More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1152 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_14591  cell division protein FtsH4  73.22 
 
 
619 aa  828    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.584936 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1152  peptidase M41, FtsH  100 
 
 
599 aa  1201    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1322  ATP-dependent metalloprotease FtsH  83.11 
 
 
598 aa  967    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.358408  normal  0.0936427 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  59.12 
 
 
632 aa  659    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09061  cell division protein FtsH4  56.51 
 
 
577 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0625866  hitchhiker  0.0000226946 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0353  peptidase M41, FtsH  54.38 
 
 
575 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.209104  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10341  cell division protein FtsH4  54.38 
 
 
575 aa  609  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194795  hitchhiker  0.000108584 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10151  cell division protein FtsH4  50.09 
 
 
584 aa  604  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.745337  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0946  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.9 
 
 
584 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10141  cell division protein FtsH4  50.72 
 
 
584 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09311  cell division protein FtsH4  50.18 
 
 
584 aa  591  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.679797  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4255  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.11 
 
 
632 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3253  FtsH peptidase  54.26 
 
 
667 aa  587  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.586375  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3058  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.57 
 
 
628 aa  583  1.0000000000000001e-165  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539417  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  53.22 
 
 
628 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.91 
 
 
640 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2444  FtsH peptidase  51.84 
 
 
633 aa  578  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000343724  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.27 
 
 
631 aa  579  1e-164  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  54.5 
 
 
628 aa  580  1e-164  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.91 
 
 
640 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.76 
 
 
655 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1438  FtsH peptidase  60.45 
 
 
639 aa  575  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.226378  normal  0.078862 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  57.37 
 
 
637 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0508625  hitchhiker  0.00322552 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0630  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.26 
 
 
628 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0751  FtsH peptidase  52.55 
 
 
637 aa  574  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0614  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.26 
 
 
628 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1061  peptidase M41, FtsH  60.91 
 
 
642 aa  571  1e-161  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498037  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3590  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.85 
 
 
631 aa  571  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.14 
 
 
628 aa  569  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.711705 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08411  FtsH ATP-dependent protease-like protein  52.41 
 
 
637 aa  568  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  60.71 
 
 
638 aa  567  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08041  FtsH ATP-dependent protease-like protein  58.18 
 
 
637 aa  567  1e-160  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0315531  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08031  FtsH ATP-dependent protease-like protein  58.18 
 
 
637 aa  568  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  53 
 
 
602 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0942  FtsH peptidase  58.28 
 
 
630 aa  564  1.0000000000000001e-159  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0293  FtsH peptidase  59.62 
 
 
640 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  52.37 
 
 
613 aa  558  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09651  FtsH ATP-dependent protease-like protein  59.62 
 
 
640 aa  559  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.116112  normal  0.424003 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  52.02 
 
 
617 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  52.02 
 
 
617 aa  554  1e-156  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.97 
 
 
612 aa  554  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23831  cell division protein FtsH2  52.36 
 
 
615 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0657792 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  51.66 
 
 
619 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  51.72 
 
 
613 aa  551  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  51.58 
 
 
617 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03061  cell division protein FtsH2  50.95 
 
 
615 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1595  cell division protein FtsH2  50.95 
 
 
615 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.169685  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.63 
 
 
616 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.63 
 
 
616 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2043  peptidase M41, FtsH  52.46 
 
 
617 aa  543  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0301  FtsH peptidase  52.64 
 
 
616 aa  545  1e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.23 
 
 
616 aa  545  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  50.52 
 
 
613 aa  537  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.34 
 
 
613 aa  530  1e-149  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.79 
 
 
651 aa  511  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.54 
 
 
638 aa  507  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.54 
 
 
640 aa  508  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35099  predicted protein  47.74 
 
 
651 aa  502  1e-141  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235498  decreased coverage  0.000591243 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  48.87 
 
 
616 aa  503  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29118  AAA-metalloprotease FtsH, chloroplast precursor  55.17 
 
 
632 aa  504  1e-141  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.75 
 
 
656 aa  505  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.21 
 
 
611 aa  496  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17504  predicted protein  44.96 
 
 
673 aa  493  9.999999999999999e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.34 
 
 
607 aa  492  9.999999999999999e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.81 
 
 
651 aa  492  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.64 
 
 
602 aa  492  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.93 
 
 
615 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.95 
 
 
642 aa  489  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.71 
 
 
640 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.23 
 
 
639 aa  491  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.2 
 
 
651 aa  490  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  54.35 
 
 
627 aa  489  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  48.15 
 
 
681 aa  491  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0085  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.61 
 
 
619 aa  489  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0128077  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.34 
 
 
643 aa  485  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  52.75 
 
 
633 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  52.75 
 
 
633 aa  486  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  52.75 
 
 
633 aa  486  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  52.75 
 
 
633 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  52.75 
 
 
633 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.98 
 
 
643 aa  485  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.34 
 
 
648 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.83 
 
 
632 aa  485  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.08 
 
 
639 aa  486  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  52.75 
 
 
633 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.17 
 
 
643 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  52.54 
 
 
633 aa  483  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.54 
 
 
633 aa  483  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  52.75 
 
 
633 aa  485  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  52.75 
 
 
633 aa  484  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  47.28 
 
 
649 aa  482  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.6 
 
 
640 aa  484  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.72 
 
 
640 aa  484  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.47 
 
 
635 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.56 
 
 
621 aa  484  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  47.28 
 
 
644 aa  482  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.07 
 
 
640 aa  480  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.42 
 
 
642 aa  481  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.84 
 
 
645 aa  481  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.31 
 
 
599 aa  482  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>