222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0766 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0766  ionotropic glutamate receptor  100 
 
 		 357 aa  714    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17521  GIC family ligand gated channel  44.71 
 
 		 333 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4470  extracellular solute-binding protein  41.42 
 
 		 360 aa  298  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3401  extracellular solute-binding protein family 3  35.71 
 
 		 345 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288087 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3185  extracellular solute-binding protein family 3  30.28 
 
 		 386 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0319469  normal  0.327167 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2108  Ion transport 2 domain protein  28.87 
 
 		 380 aa  153  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.64507  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0243  extracellular solute-binding protein  30.27 
 
 		 352 aa  143  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.461233  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0534  extracellular solute-binding protein  29 
 
 		 378 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000119937  normal  0.231064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0989  ionotropic glutamate receptor  25.88 
 
 		 385 aa  123  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00799659  normal  0.390721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5634  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4522  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2998  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.593817  normal  0.519466 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2561  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 367 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1963  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.503489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06570  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  26.5 
 
 		 363 aa  100  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1231  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 366 aa  96.3  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.196544  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3087  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4230  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.062377 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  34.43 
 
 		 244 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  35.11 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2020  Ion transport protein  41.67 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  25 
 
 		 269 aa  57  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0411  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  32.08 
 
 		 238 aa  55.5  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1005  Ion transport protein  37.78 
 
 		 267 aa  54.7  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  31.18 
 
 		 412 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1169  hypothetical protein  34.94 
 
 		 251 aa  53.9  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.242801  normal  0.430394 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  27.27 
 
 		 253 aa  53.5  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  31.3 
 
 		 344 aa  53.5  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  36.26 
 
 		 517 aa  52.4  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.41 
 
 		 408 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  42.42 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  42.42 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  32.97 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 		 242 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  29.06 
 
 		 247 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 1165 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  31.62 
 
 		 245 aa  50.8  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1424  Ion transport 2 domain protein  29.67 
 
 		 253 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.287794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  29.27 
 
 		 258 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  32.35 
 
 		 242 aa  51.2  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  34.58 
 
 		 246 aa  50.8  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  33.73 
 
 		 280 aa  50.8  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  38.37 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  28.07 
 
 		 287 aa  50.4  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  26.77 
 
 		 272 aa  50.4  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1395  amino acid ABC transporter, permease/amino acid-binding protein, putative  23.93 
 
 		 485 aa  50.4  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  30.11 
 
 		 419 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2141  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 		 247 aa  50.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343212 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  32.61 
 
 		 277 aa  50.1  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  33.01 
 
 		 258 aa  49.7  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.91 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  37.63 
 
 		 272 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0945  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.3 
 
 		 177 aa  48.9  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.656461  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.91 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  37.66 
 
 		 273 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.91 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.91 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  40.62 
 
 		 252 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  33.64 
 
 		 279 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  25.89 
 
 		 485 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  32.97 
 
 		 269 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.91 
 
 		 250 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2235  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 		 268 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.15 
 
 		 253 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0253  Ion transport 2 domain protein  31.87 
 
 		 260 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  37.5 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  25.89 
 
 		 485 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.91 
 
 		 250 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0834  CjaC  29.51 
 
 		 251 aa  47.8  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0955  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.17 
 
 		 268 aa  47.8  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0776363  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  34.94 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0296  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 		 263 aa  47.8  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2600  extracellular solute-binding protein  34.29 
 
 		 252 aa  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  30.07 
 
 		 331 aa  48.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  31.36 
 
 		 245 aa  47.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0129  Ion transport 2 domain protein  31.73 
 
 		 241 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000177719  hitchhiker  0.0000693343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  31.9 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1236  ABC-type amino acid transport system, periplasmic component  25.6 
 
 		 278 aa  47.8  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  35.21 
 
 		 272 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  34.04 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2595  extracellular solute-binding protein family 3  34.91 
 
 		 278 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0757  cjaC protein  29.51 
 
 		 251 aa  47.8  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.943565  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  30.77 
 
 		 269 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3746  extracellular solute-binding protein  34.65 
 
 		 266 aa  47.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  30.2 
 
 		 357 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0438  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  34.94 
 
 		 480 aa  47.4  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.126368  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  31.43 
 
 		 273 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1920  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  33.65 
 
 		 252 aa  47.4  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.541755  hitchhiker  0.00384825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  39.06 
 
 		 251 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1588  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 260 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  36.99 
 
 		 265 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.82 
 
 		 267 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  28.43 
 
 		 269 aa  47  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  35.56 
 
 		 228 aa  46.6  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  32.32 
 
 		 261 aa  47  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0906  amino acid-binding protein  31.9 
 
 		 256 aa  46.6  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0553  hypothetical protein  31.87 
 
 		 244 aa  46.6  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  29.9 
 
 		 263 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>