More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3561 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03035  translation initiation factor IF-2  65.79 
 
 		 890 aa  1120    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243864  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  65.79 
 
 		 890 aa  1120    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  62.99 
 
 		 975 aa  814    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  57.17 
 
 		 883 aa  686    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4712  translation initiation factor IF-2  67.38 
 
 		 846 aa  851    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.333126  normal  0.0123461 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  56.39 
 
 		 882 aa  676    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  85.38 
 
 		 896 aa  1392    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  83.13 
 
 		 880 aa  1204    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  62.13 
 
 		 964 aa  819    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5462  translation initiation factor IF-2  69.14 
 
 		 837 aa  844    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  72.48 
 
 		 889 aa  1022    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  87.75 
 
 		 885 aa  1240    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  62.83 
 
 		 975 aa  812    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  54.95 
 
 		 959 aa  658    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  82.46 
 
 		 885 aa  1196    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4490  translation initiation factor IF-2  55.92 
 
 		 841 aa  896    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0593821  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4577  translation initiation factor IF-2  67.38 
 
 		 846 aa  852    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  53.41 
 
 		 885 aa  642    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3652  translation initiation factor IF-2  65.79 
 
 		 890 aa  1120    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  62.99 
 
 		 975 aa  814    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  54.21 
 
 		 868 aa  910    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  54.5 
 
 		 868 aa  908    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  47.92 
 
 		 908 aa  805    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  61.54 
 
 		 904 aa  795    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  62.99 
 
 		 975 aa  814    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  53.16 
 
 		 985 aa  650    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  63.91 
 
 		 966 aa  779    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  50.52 
 
 		 922 aa  821    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3596  translation initiation factor IF-2  66.59 
 
 		 892 aa  1122    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000160504  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  62.83 
 
 		 975 aa  812    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  53.51 
 
 		 845 aa  905    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0779  translation initiation factor IF-2  55.36 
 
 		 837 aa  887    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679376  normal  0.0113763 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  54.89 
 
 		 836 aa  645    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  53.21 
 
 		 947 aa  677    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  54.02 
 
 		 854 aa  891    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  61.65 
 
 		 943 aa  783    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  83.13 
 
 		 880 aa  1204    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2749  translation initiation factor IF-2  60.97 
 
 		 990 aa  745    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.867679  normal  0.130193 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  56.14 
 
 		 884 aa  683    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  51.55 
 
 		 984 aa  640    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1123  translation initiation factor IF-2  66.34 
 
 		 818 aa  814    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  48.28 
 
 		 905 aa  790    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1600  translation initiation factor IF-2  53.49 
 
 		 803 aa  864    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0215539  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1749  translation initiation factor IF-2  62.35 
 
 		 890 aa  761    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0133551  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  45.83 
 
 		 848 aa  639    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  61.55 
 
 		 876 aa  796    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  51.16 
 
 		 873 aa  649    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  52.89 
 
 		 903 aa  656    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  62.68 
 
 		 976 aa  811    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3605  translation initiation factor IF-2  66.27 
 
 		 898 aa  1137    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600034  normal  0.0461803 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  68.5 
 
 		 894 aa  1177    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0563  translation initiation factor IF-2  53.6 
 
 		 816 aa  867    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.852622  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  67.59 
 
 		 895 aa  1144    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2134  translation initiation factor IF-2  62.6 
 
 		 978 aa  762    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149988  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2708  translation initiation factor IF-2  63.76 
 
 		 908 aa  767    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.334172  normal  0.377403 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  65.79 
 
 		 890 aa  1120    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  52.09 
 
 		 907 aa  890    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  59.54 
 
 		 968 aa  773    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  62.44 
 
 		 989 aa  808    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  78.15 
 
 		 884 aa  1303    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3563  translation initiation factor IF-2  50.99 
 
 		 832 aa  637    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  70.32 
 
 		 843 aa  864    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  46.05 
 
 		 964 aa  662    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  48.7 
 
 		 908 aa  806    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  62.09 
 
 		 979 aa  806    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0631  translation initiation factor IF2-2  55.38 
 
 		 880 aa  954    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  51.6 
 
 		 887 aa  666    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  52.13 
 
 		 835 aa  654    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3608  translation initiation factor IF-2  64.78 
 
 		 828 aa  850    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  80.2 
 
 		 880 aa  1348    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1695  translation initiation factor IF-2  62.89 
 
 		 869 aa  1025    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  53.92 
 
 		 856 aa  646    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  92.63 
 
 		 896 aa  1511    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3993  translation initiation factor IF-2  66.52 
 
 		 884 aa  1137    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  64.62 
 
 		 953 aa  767    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  63.53 
 
 		 831 aa  998    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  63.36 
 
 		 943 aa  758    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  82.6 
 
 		 885 aa  1197    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  82.6 
 
 		 885 aa  1197    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  64.39 
 
 		 883 aa  814    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  78.29 
 
 		 881 aa  1349    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4712  translation initiation factor IF-2  68.63 
 
 		 842 aa  847    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.940521  normal  0.658182 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62760  translation initiation factor IF-2  69.14 
 
 		 840 aa  844    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0503522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2757  translation initiation factor IF-2  54.89 
 
 		 838 aa  643    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  61.78 
 
 		 920 aa  773    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  55.06 
 
 		 836 aa  645    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  62.83 
 
 		 975 aa  813    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  52.35 
 
 		 962 aa  667    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  51.61 
 
 		 949 aa  675    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  82.6 
 
 		 889 aa  1198    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  67.14 
 
 		 898 aa  1134    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  62.99 
 
 		 975 aa  814    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  55.7 
 
 		 921 aa  679    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  54.95 
 
 		 990 aa  655    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2697  translation initiation factor IF-2  51.08 
 
 		 989 aa  637    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  83.13 
 
 		 880 aa  1204    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  81.08 
 
 		 882 aa  1152    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  65.67 
 
 		 880 aa  1144    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  55.65 
 
 		 1079 aa  665    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  63.89 
 
 		 848 aa  804    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>