More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2472 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  100 
 
 
446 aa  911    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2422  peptidase M23B  37.36 
 
 
475 aa  256  6e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638116  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  34.06 
 
 
452 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  34.9 
 
 
482 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2205  peptidase M23B  34.5 
 
 
450 aa  229  7e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000218447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1137  Peptidase M23  38.72 
 
 
468 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  33.71 
 
 
448 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  30.29 
 
 
445 aa  210  4e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  36.2 
 
 
582 aa  206  8e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  35.28 
 
 
468 aa  189  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  33.84 
 
 
430 aa  132  9e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  50.77 
 
 
411 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  33.21 
 
 
314 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  52.8 
 
 
402 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  32.16 
 
 
320 aa  122  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  38.64 
 
 
400 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  33.33 
 
 
284 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  40.74 
 
 
375 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  49.22 
 
 
379 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  46.76 
 
 
414 aa  117  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  33 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  51.26 
 
 
824 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  45.45 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  46.83 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  47.29 
 
 
376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  32.56 
 
 
283 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  42.86 
 
 
375 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  42.86 
 
 
377 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  48.76 
 
 
332 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  32.31 
 
 
419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  38.46 
 
 
404 aa  114  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  45.9 
 
 
309 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  43.88 
 
 
375 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  46.72 
 
 
305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  56.12 
 
 
340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  44.72 
 
 
431 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  53.06 
 
 
415 aa  110  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  42.75 
 
 
441 aa  110  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  51 
 
 
238 aa  110  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  39.49 
 
 
301 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  45.16 
 
 
469 aa  108  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  52.04 
 
 
327 aa  109  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  47.5 
 
 
459 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  47.97 
 
 
284 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  52.04 
 
 
455 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  45.54 
 
 
399 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  45.54 
 
 
399 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  52.04 
 
 
456 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  32.6 
 
 
324 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  46.27 
 
 
294 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  35.88 
 
 
300 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  52.04 
 
 
440 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  47.9 
 
 
751 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  52.04 
 
 
440 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  45.52 
 
 
292 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  47.06 
 
 
349 aa  107  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  46.27 
 
 
291 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  52.58 
 
 
437 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  50.51 
 
 
417 aa  106  7e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  28.84 
 
 
274 aa  106  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  50 
 
 
460 aa  106  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  41.54 
 
 
373 aa  106  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  50.46 
 
 
538 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  47.46 
 
 
358 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  44.26 
 
 
300 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  51.02 
 
 
457 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  46.67 
 
 
692 aa  104  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  43.05 
 
 
216 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  47.22 
 
 
392 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  43.09 
 
 
301 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  32.13 
 
 
297 aa  104  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2938  M24/M37 family peptidase  39.77 
 
 
350 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  47.22 
 
 
392 aa  104  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  54.08 
 
 
394 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  39.58 
 
 
333 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  43.44 
 
 
302 aa  104  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  43.75 
 
 
318 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  48.98 
 
 
454 aa  103  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  41.96 
 
 
445 aa  103  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  46.02 
 
 
459 aa  103  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  50 
 
 
455 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  48.98 
 
 
453 aa  103  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  46.94 
 
 
430 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  53.06 
 
 
382 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  45.38 
 
 
590 aa  103  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  47.46 
 
 
360 aa  103  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  60 
 
 
529 aa  103  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2621  M24/M37 family peptidase  28.65 
 
 
350 aa  103  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  50 
 
 
398 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  47.06 
 
 
727 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  47.22 
 
 
391 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  45.08 
 
 
524 aa  102  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  47.06 
 
 
727 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  51.02 
 
 
288 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  26.46 
 
 
476 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  46.81 
 
 
423 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3741  peptidase M23B  38.64 
 
 
332 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  47.96 
 
 
291 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  39.29 
 
 
230 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  45.92 
 
 
450 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>