151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4708 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4708  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 276 aa  555  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1858  beta-lactamase domain-containing protein  54.58 
 
 		 284 aa  275  6e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2130  beta-lactamase-like protein  54.51 
 
 		 282 aa  275  7e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04445  AttM/AiiB family protein  36.97 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  36.97 
 
 		 299 aa  178  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03884  hypothetical protein  48.25 
 
 		 136 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.762573 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  27.24 
 
 		 250 aa  97.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  27.24 
 
 		 250 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  26.85 
 
 		 250 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  32.56 
 
 		 269 aa  92.4  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  26.07 
 
 		 250 aa  92  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  26.85 
 
 		 250 aa  92  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  26.85 
 
 		 250 aa  92  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  26.85 
 
 		 250 aa  92  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  27.24 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  26.85 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1421  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1654  Zn-dependent hydrolase  31.22 
 
 		 238 aa  86.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0903  beta-lactamase domain-containing protein  29.49 
 
 		 235 aa  85.9  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  26.82 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03883  hypothetical protein  35.42 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.804009 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  25.38 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  30.23 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0090  beta-lactamase domain-containing protein  30.06 
 
 		 198 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2373  beta-lactamase domain protein  27.21 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0752798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2937  metal-dependent hydrolase  23.98 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2682  beta-lactamase domain protein  25.09 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3000  hypothetical protein  23.98 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115353  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3246  hypothetical protein  23.98 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  28.11 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2956  beta-lactamase domain-containing protein  23.98 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0379847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3015  hypothetical protein  23.53 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3247  hypothetical protein  23.53 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1494  beta-lactamase domain protein  24.72 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00424723  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3043  beta-lactamase-like protein  33.53 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02639  conserved hypothetical protein  32.21 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.453021 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24810  hypothetical protein  28.57 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1599  hypothetical protein  25.94 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2102  hypothetical protein  29.19 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  27.1 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  26.16 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3218  beta-lactamase domain-containing protein  25.23 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2307  hypothetical protein  28.68 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735392  normal  0.0472495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4648  beta-lactamase domain protein  28.46 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197699  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3391  putative metallo-beta-lactamase family protein  26.73 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4133  beta-lactamase domain protein  26.83 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  27.14 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5130  beta-lactamase domain protein  33.14 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  28.07 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00028  conserved hypothetical protein  29.53 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.531794  normal  0.132381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0375  beta-lactamase domain-containing protein  25.23 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  26.18 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41810  Zn-dependent hydrolase  24.89 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  27.55 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  27.71 
 
 		 253 aa  53.9  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002733  GumP protein  26.26 
 
 		 287 aa  53.1  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672439  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0714  hypothetical protein  24.56 
 
 		 279 aa  53.1  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  30.17 
 
 		 351 aa  52.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3579  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 273 aa  52.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00371126  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  26.54 
 
 		 276 aa  52.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3682  beta-lactamase domain protein  26.19 
 
 		 255 aa  52.4  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3256  beta-lactamase domain-containing protein  26.26 
 
 		 269 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  26.51 
 
 		 229 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  29.36 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  25.89 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2721  beta-lactamase domain protein  26.61 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.91537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0627  hypothetical protein  24.02 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3485  AHL-lactonase  31.46 
 
 		 94 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  28.25 
 
 		 322 aa  49.7  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 		 282 aa  49.7  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  24.06 
 
 		 284 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08635  conserved hypothetical protein  25.77 
 
 		 317 aa  49.3  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.19369 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  22.38 
 
 		 284 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  22.38 
 
 		 284 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  22.38 
 
 		 284 aa  48.9  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  28.97 
 
 		 322 aa  48.9  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  22.38 
 
 		 284 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2378  beta-lactamase-like protein  24.12 
 
 		 271 aa  49.3  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  30.08 
 
 		 315 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0986  putative Zn-dependent hydrolases including glyoxylases  24.44 
 
 		 271 aa  48.9  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3173  beta-lactamase domain protein  24.65 
 
 		 251 aa  48.9  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558996  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4058  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 258 aa  48.9  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966002  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5790  beta-lactamase domain-containing protein  23.53 
 
 		 266 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07316  conserved hypothetical protein  24.15 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000551538  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  22.38 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  22.86 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  29.85 
 
 		 332 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  29.94 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1292  beta-lactamase-like protein  26.07 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  22.86 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1468  beta-lactamase domain-containing protein  25.52 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  26.27 
 
 		 328 aa  47  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0967  putative Zn-dependent hydrolase  25.29 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674922  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4355  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.112156  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 324 aa  46.6  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  24.42 
 
 		 302 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  24.42 
 
 		 302 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12323  hypothetical protein  26.55 
 
 		 310 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  22.38 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>