47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2307 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2307  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  769    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735392  normal  0.0472495 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4708  beta-lactamase domain-containing protein  28.68 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  28.75 
 
 		 282 aa  59.3  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  26.28 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  29.91 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04445  AttM/AiiB family protein  27.35 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  26.49 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  32.19 
 
 		 284 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2298  beta-lactamase domain protein  26.42 
 
 		 248 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  30.14 
 
 		 284 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4529  beta-lactamase domain-containing protein  32.19 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0948  beta-lactamase domain-containing protein  26.52 
 
 		 248 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  30.82 
 
 		 284 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 287 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  30.14 
 
 		 284 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  30.82 
 
 		 284 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  28 
 
 		 250 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  28.21 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  27.35 
 
 		 250 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5130  beta-lactamase domain protein  31.18 
 
 		 243 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  28.21 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  27.35 
 
 		 250 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  28.21 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  28.97 
 
 		 284 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  28.97 
 
 		 284 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  28.21 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  28.97 
 
 		 284 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2130  beta-lactamase-like protein  27.73 
 
 		 282 aa  48.5  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0090  beta-lactamase domain-containing protein  30.36 
 
 		 198 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4133  beta-lactamase domain protein  26.52 
 
 		 253 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1580  beta-lactamase domain protein  28.91 
 
 		 302 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  27.35 
 
 		 250 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3361  beta-lactamase domain-containing protein  29.37 
 
 		 284 aa  47  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  27.42 
 
 		 249 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  30.14 
 
 		 284 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0898  hypothetical protein  28.7 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0423506  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1858  beta-lactamase domain-containing protein  27.82 
 
 		 284 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  26.09 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09610  hypothetical protein  28.7 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1421  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 262 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  22.33 
 
 		 229 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5276  beta-lactamase domain-containing protein  30.37 
 
 		 286 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.872928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  28.44 
 
 		 263 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.47 
 
 		 288 aa  43.9  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  29.92 
 
 		 253 aa  43.1  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  28.28 
 
 		 332 aa  43.1  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>