192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4392 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  56.77 
 
 		 605 aa  657    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  100 
 
 		 604 aa  1230    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  45.01 
 
 		 609 aa  510  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3398  hypothetical protein  44.6 
 
 		 610 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2044  twin-arginine translocation pathway signal  40.92 
 
 		 614 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  36.98 
 
 		 615 aa  355  1e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  36.71 
 
 		 615 aa  353  5e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  36.63 
 
 		 615 aa  352  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  36.89 
 
 		 615 aa  351  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  35.2 
 
 		 616 aa  342  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  35.38 
 
 		 616 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  35.2 
 
 		 616 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  35.2 
 
 		 616 aa  339  7e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  35.44 
 
 		 611 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  35.48 
 
 		 628 aa  334  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  34.63 
 
 		 624 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  34.44 
 
 		 630 aa  332  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  34.07 
 
 		 617 aa  331  2e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  34.97 
 
 		 614 aa  330  4e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  37.32 
 
 		 605 aa  330  5.0000000000000004e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  34.89 
 
 		 608 aa  328  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  34.91 
 
 		 614 aa  326  6e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  34.74 
 
 		 614 aa  326  7e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  34.59 
 
 		 628 aa  325  1e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  34.86 
 
 		 607 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  34.86 
 
 		 607 aa  325  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  34.86 
 
 		 607 aa  325  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  33.79 
 
 		 617 aa  323  4e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  34.62 
 
 		 617 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  32.78 
 
 		 614 aa  323  4e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  34.33 
 
 		 614 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  35.98 
 
 		 635 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  35.98 
 
 		 635 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  33.86 
 
 		 613 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  33.85 
 
 		 627 aa  320  5e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  35.79 
 
 		 635 aa  320  7e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  34.33 
 
 		 621 aa  318  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  34.27 
 
 		 622 aa  318  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  33.33 
 
 		 613 aa  317  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  37.26 
 
 		 633 aa  316  7e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  34.77 
 
 		 618 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  33.97 
 
 		 618 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  32.81 
 
 		 602 aa  315  1.9999999999999998e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  34.61 
 
 		 628 aa  308  3e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  33.28 
 
 		 636 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  33.33 
 
 		 625 aa  301  2e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  37.63 
 
 		 639 aa  299  8e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  33.85 
 
 		 625 aa  299  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  32.68 
 
 		 585 aa  284  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  33.45 
 
 		 629 aa  284  3.0000000000000004e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  32.93 
 
 		 619 aa  267  4e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  32.14 
 
 		 613 aa  263  6e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  30.47 
 
 		 611 aa  263  6e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  33.1 
 
 		 591 aa  263  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  32.82 
 
 		 594 aa  262  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  31.4 
 
 		 619 aa  262  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  30.23 
 
 		 610 aa  259  8e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  30.4 
 
 		 1283 aa  259  1e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  32.83 
 
 		 601 aa  258  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  32.83 
 
 		 601 aa  258  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  32.34 
 
 		 599 aa  256  7e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  31.04 
 
 		 607 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  32.5 
 
 		 601 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  31.87 
 
 		 608 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  41.49 
 
 		 602 aa  254  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  31.87 
 
 		 608 aa  254  3e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  32.82 
 
 		 603 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  32.37 
 
 		 583 aa  254  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  30.22 
 
 		 609 aa  253  7e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  32.65 
 
 		 603 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  32.19 
 
 		 601 aa  252  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  32.82 
 
 		 603 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  30.03 
 
 		 609 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  32.58 
 
 		 603 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  30.05 
 
 		 609 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  32.23 
 
 		 595 aa  250  6e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  31.84 
 
 		 605 aa  250  7e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  30.26 
 
 		 616 aa  249  7e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  29.87 
 
 		 609 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  32.48 
 
 		 599 aa  248  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  29.23 
 
 		 609 aa  248  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  30.62 
 
 		 616 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  31.74 
 
 		 588 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  29.11 
 
 		 592 aa  244  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  31.68 
 
 		 603 aa  244  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  36.54 
 
 		 609 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  29.64 
 
 		 611 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  31.52 
 
 		 599 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  30.07 
 
 		 589 aa  242  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  39.78 
 
 		 621 aa  242  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  29.42 
 
 		 609 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  29.59 
 
 		 609 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  29.42 
 
 		 629 aa  241  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  29.55 
 
 		 610 aa  241  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  33.22 
 
 		 587 aa  239  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  29.91 
 
 		 609 aa  238  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  35.34 
 
 		 590 aa  236  7e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  29.17 
 
 		 609 aa  236  7e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  38.74 
 
 		 584 aa  236  9e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1222  protein of unknown function DUF885  37.25 
 
 		 546 aa  235  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>