More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1364 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1364  ABC transporter-related protein  100 
 
 
237 aa  479  1e-134  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00718085  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0869  ATPase  51.69 
 
 
243 aa  258  5.0000000000000005e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3625  ABC transporter related  48.93 
 
 
243 aa  248  8e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2875  ATP-binding cassette containing protein  49.57 
 
 
236 aa  247  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2683  ABC transporter related  49.13 
 
 
236 aa  246  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3832  ABC transporter related  49.13 
 
 
236 aa  246  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737847  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3849  ABC transporter related  49.13 
 
 
236 aa  246  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0574047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1917  ABC transporter related  49.13 
 
 
236 aa  246  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3251  ABC transporter-related protein  47.68 
 
 
236 aa  246  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2835  ABC transporter related  48.5 
 
 
245 aa  246  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204247 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1359  ABC transporter ATPase  49.13 
 
 
236 aa  244  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1243  ABC transporter related  50 
 
 
244 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1253  ABC transporter related  49.57 
 
 
236 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0397899  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1328  ABC transporter related  50 
 
 
244 aa  242  3e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.667978  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1671  ABC transporter related  49.56 
 
 
234 aa  240  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1043  ABC transporter related  49.13 
 
 
234 aa  239  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1836  ABC transporter related  46.78 
 
 
236 aa  237  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1687  ABC transporter related  46.78 
 
 
236 aa  237  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1186  ABC transporter related  45.69 
 
 
241 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225539  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1048  ABC transporter related  47.21 
 
 
235 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1923  ABC transporter related  46.79 
 
 
234 aa  231  6e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1918  ABC transporter related  47.84 
 
 
244 aa  228  9e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0947  ABC transporter, ATP-binding protein  49.33 
 
 
234 aa  225  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  47.79 
 
 
233 aa  224  7e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  48.23 
 
 
240 aa  223  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  47.79 
 
 
244 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0147  ABC transporter related  47.19 
 
 
235 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1279  ABC transporter related  49.12 
 
 
235 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00259137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  47.32 
 
 
228 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3299  ABC transporter related  47 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0482255  normal  0.440753 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3305  ABC transporter related  43.72 
 
 
254 aa  190  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  43.86 
 
 
228 aa  185  6e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  42.73 
 
 
223 aa  182  3e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  40.18 
 
 
223 aa  181  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  40.18 
 
 
223 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  39.73 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  39.73 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 
223 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 
223 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  39.27 
 
 
223 aa  178  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  41.78 
 
 
259 aa  176  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  38.91 
 
 
246 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0481  ABC transporter related  43.2 
 
 
241 aa  176  4e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2644  ABC transporter, ATP-binding protein  42.17 
 
 
230 aa  175  5e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2784  heterocyst specific ABC-transporter, ATP-binding subunit DevA-like  40.97 
 
 
227 aa  174  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473881 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  39.64 
 
 
233 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0292  ABC transporter related  44.34 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  38.33 
 
 
227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0299  ABC transporter related  44.34 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2018  ABC transporter related  46.52 
 
 
238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2383  ABC transporter related  41.74 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0264  ATPase  42.72 
 
 
246 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2429  ABC transporter related  41.74 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.47836  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  40.97 
 
 
227 aa  172  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  35.43 
 
 
232 aa  172  5e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  40.47 
 
 
408 aa  172  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  39.06 
 
 
642 aa  171  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 
239 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  44.68 
 
 
240 aa  170  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  36.6 
 
 
232 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3555  ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 
224 aa  169  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287436  normal  0.628784 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  39.73 
 
 
255 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  42.33 
 
 
217 aa  169  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0122  ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 
228 aa  169  4e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0473  ABC transporter related  45.45 
 
 
238 aa  168  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  40.62 
 
 
248 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4690  ABC transporter, nucleotide binding/ATPase protein  38.12 
 
 
243 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0429336  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  40.2 
 
 
235 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  36.52 
 
 
246 aa  166  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1373  ABC transporter related  37.39 
 
 
227 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  37 
 
 
242 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  35.27 
 
 
225 aa  166  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  36.7 
 
 
277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1395  ABC transporter related protein  36.28 
 
 
238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0267947  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  39.04 
 
 
246 aa  166  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08341  ABC transporter, ATP-binding component  39.83 
 
 
237 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.119889  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  38.72 
 
 
266 aa  166  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  40.09 
 
 
643 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2113  ABC transporter related  35.27 
 
 
240 aa  165  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000000136112  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  40.09 
 
 
225 aa  165  5e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  38.86 
 
 
227 aa  165  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  39.56 
 
 
228 aa  165  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  40.17 
 
 
228 aa  165  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0425  ABC transporter related  44.27 
 
 
234 aa  165  6.9999999999999995e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0174  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
235 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.926259  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1757  peptide ABC transporter ATPase  41.94 
 
 
225 aa  165  6.9999999999999995e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000421952  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  39.25 
 
 
226 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.109288  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  37.66 
 
 
237 aa  164  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  36.4 
 
 
228 aa  164  8e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  37.66 
 
 
237 aa  164  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  38.74 
 
 
244 aa  164  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2110  ABC transporter related protein  40.17 
 
 
257 aa  164  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1004  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 
220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1809  ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.596439  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  37.07 
 
 
642 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  35.32 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  36.94 
 
 
239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>