More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0092 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0092  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 140 aa  288  2e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1827  50S ribosomal protein L13  68.12 
 
 		 147 aa  209  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000510048  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1653  50S ribosomal protein L13  67.39 
 
 		 141 aa  208  2e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1473  50S ribosomal protein L13  67.39 
 
 		 147 aa  208  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00205276  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0384  50S ribosomal protein L13  66.42 
 
 		 142 aa  204  2e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.618287  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0911  50S ribosomal protein L13  63.77 
 
 		 142 aa  200  4e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0737  50S ribosomal protein L13  63.77 
 
 		 142 aa  200  5e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.664104  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1597  50S ribosomal protein L13  64.49 
 
 		 141 aa  191  2e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219033  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0387  50S ribosomal protein L13  62.32 
 
 		 141 aa  189  8e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1909  ribosomal protein L13  56.52 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  50.71 
 
 		 143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1250  ribosomal protein L13  52.94 
 
 		 146 aa  154  6e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 144 aa  149  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  50.75 
 
 		 163 aa  149  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1941  ribosomal protein L13  51.88 
 
 		 142 aa  148  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0912  50S ribosomal protein L13  50.75 
 
 		 142 aa  148  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482809  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  48.57 
 
 		 143 aa  148  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  50.75 
 
 		 142 aa  148  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 149 aa  148  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  50.36 
 
 		 143 aa  148  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 149 aa  148  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  49.62 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  48.18 
 
 		 145 aa  147  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 142 aa  146  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2286  50S ribosomal protein L13  50.36 
 
 		 145 aa  146  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101681  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 142 aa  146  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2245  50S ribosomal protein L13  50.36 
 
 		 145 aa  146  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000176479  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  49.64 
 
 		 142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  48.85 
 
 		 142 aa  145  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  46.56 
 
 		 142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  49.64 
 
 		 143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1799  50S ribosomal protein L13  49.64 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  47.76 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  48.85 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  48.09 
 
 		 142 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  48.09 
 
 		 142 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  48.51 
 
 		 148 aa  144  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  48.09 
 
 		 142 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  48.91 
 
 		 143 aa  145  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  49.64 
 
 		 143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  48.09 
 
 		 142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  48.09 
 
 		 142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  45.99 
 
 		 145 aa  144  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  44.78 
 
 		 144 aa  144  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  50.38 
 
 		 142 aa  143  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  48.91 
 
 		 142 aa  144  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  48.18 
 
 		 148 aa  143  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0461  50S ribosomal protein L13  48.18 
 
 		 142 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  47.01 
 
 		 144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0110  ribosomal protein L13  48.51 
 
 		 147 aa  143  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00100259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  49.64 
 
 		 143 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  48.09 
 
 		 142 aa  143  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04010  50S ribosomal protein L13  46.56 
 
 		 142 aa  143  9e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  47.33 
 
 		 142 aa  143  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  48.09 
 
 		 142 aa  143  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  50.38 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  50.38 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  50.38 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  48.85 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  49.62 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1669  50S ribosomal protein L13  51.56 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000843127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  49.62 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0330  ribosomal protein L13  47.66 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000116087  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  49.61 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  47.33 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  48.85 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  46.27 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  47.01 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  49.62 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  46.27 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  45.8 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  45.26 
 
 		 145 aa  140  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  46.27 
 
 		 142 aa  141  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  49.62 
 
 		 142 aa  140  5e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  47.76 
 
 		 144 aa  140  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  49.62 
 
 		 142 aa  140  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  48.84 
 
 		 145 aa  140  6e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  50.76 
 
 		 144 aa  140  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  51.94 
 
 		 147 aa  140  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  49.62 
 
 		 142 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  51.94 
 
 		 147 aa  140  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  44.53 
 
 		 145 aa  140  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  44.53 
 
 		 145 aa  140  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  44.53 
 
 		 145 aa  140  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  44.53 
 
 		 145 aa  140  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  44.53 
 
 		 145 aa  140  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  44.53 
 
 		 145 aa  140  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  44.53 
 
 		 145 aa  140  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  44.78 
 
 		 142 aa  140  8e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  44.53 
 
 		 145 aa  140  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  48.85 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  47.14 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  48.51 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  47.69 
 
 		 144 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  47.14 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>