More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1597 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1597  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 141 aa  290  6e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219033  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1827  50S ribosomal protein L13  77.3 
 
 		 147 aa  234  3e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000510048  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1473  50S ribosomal protein L13  76.6 
 
 		 147 aa  233  5.0000000000000005e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00205276  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1653  50S ribosomal protein L13  76.6 
 
 		 141 aa  233  6e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0384  50S ribosomal protein L13  76.6 
 
 		 142 aa  232  1.0000000000000001e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.618287  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0387  50S ribosomal protein L13  78.01 
 
 		 141 aa  231  3e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0737  50S ribosomal protein L13  76.76 
 
 		 142 aa  226  7e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.664104  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0911  50S ribosomal protein L13  76.06 
 
 		 142 aa  225  2e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1909  ribosomal protein L13  67.86 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0092  50S ribosomal protein L13  64.49 
 
 		 140 aa  191  3e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0461  50S ribosomal protein L13  53.62 
 
 		 142 aa  167  6e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797457  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  52.24 
 
 		 142 aa  157  6e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  53.38 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  53.33 
 
 		 144 aa  154  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  52.59 
 
 		 144 aa  154  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  51.49 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  55.22 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  52.99 
 
 		 142 aa  150  7e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 142 aa  150  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  51.15 
 
 		 142 aa  150  8e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  53.08 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04010  50S ribosomal protein L13  51.47 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 145 aa  148  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  51.49 
 
 		 142 aa  149  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  51.49 
 
 		 142 aa  149  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  50.37 
 
 		 142 aa  148  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  53.03 
 
 		 143 aa  149  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  48.57 
 
 		 142 aa  148  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  48.57 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  50.74 
 
 		 142 aa  147  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  52.99 
 
 		 142 aa  147  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  50.75 
 
 		 142 aa  147  6e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  51.49 
 
 		 149 aa  147  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 142 aa  147  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  52.24 
 
 		 145 aa  147  7e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  146  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  50.75 
 
 		 142 aa  146  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  146  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  51.49 
 
 		 142 aa  146  8e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  50.75 
 
 		 142 aa  146  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  48.57 
 
 		 142 aa  146  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  51.85 
 
 		 142 aa  146  9e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  49.26 
 
 		 142 aa  146  9e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 142 aa  146  9e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  53.08 
 
 		 149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  47.83 
 
 		 142 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2044  ribosomal protein L13  51.15 
 
 		 142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000510712  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 142 aa  145  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000138225  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  52.31 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  47.14 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  48.91 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  50.75 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  52.31 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 145 aa  145  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  49.28 
 
 		 144 aa  145  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  50.75 
 
 		 147 aa  145  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  49.25 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  50.36 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0453  50S ribosomal protein L13  50.75 
 
 		 148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0286772  normal  0.569665 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  48.18 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  50.75 
 
 		 148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  51.8 
 
 		 144 aa  144  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0330  ribosomal protein L13  47.76 
 
 		 145 aa  144  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000116087  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4943  50S ribosomal protein L13  48.46 
 
 		 144 aa  144  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 163 aa  144  6e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  50.77 
 
 		 147 aa  144  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  50 
 
 		 147 aa  143  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  49.25 
 
 		 142 aa  143  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 145 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  50.37 
 
 		 142 aa  143  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0604  50S ribosomal protein L13  53.44 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>