More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1909 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1909  ribosomal protein L13  100 
 
 		 142 aa  290  3e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0387  50S ribosomal protein L13  77.94 
 
 		 141 aa  223  9e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0737  50S ribosomal protein L13  76.3 
 
 		 142 aa  219  9.999999999999999e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.664104  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0911  50S ribosomal protein L13  74.07 
 
 		 142 aa  215  1e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1473  50S ribosomal protein L13  73.53 
 
 		 147 aa  215  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00205276  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1653  50S ribosomal protein L13  73.53 
 
 		 141 aa  214  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1827  50S ribosomal protein L13  72.79 
 
 		 147 aa  214  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000510048  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0384  50S ribosomal protein L13  73.28 
 
 		 142 aa  210  4.9999999999999996e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.618287  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1597  50S ribosomal protein L13  67.86 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219033  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0092  50S ribosomal protein L13  56.52 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 145 aa  166  8e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  56.83 
 
 		 150 aa  164  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  53.68 
 
 		 148 aa  163  9e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  56.39 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  56.39 
 
 		 144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  54.89 
 
 		 142 aa  160  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  56.39 
 
 		 149 aa  160  6e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  54.14 
 
 		 149 aa  160  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 145 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  52.71 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  53.68 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  50.36 
 
 		 142 aa  158  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  53.68 
 
 		 143 aa  158  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  55.15 
 
 		 143 aa  159  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  55.64 
 
 		 142 aa  158  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_002936  DET0505  50S ribosomal protein L13  52.63 
 
 		 143 aa  158  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000122168  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  54.41 
 
 		 143 aa  157  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 163 aa  158  3e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0461  50S ribosomal protein L13  50.72 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797457  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  52.63 
 
 		 142 aa  157  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  51.08 
 
 		 142 aa  157  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  50.36 
 
 		 142 aa  157  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  52.63 
 
 		 149 aa  157  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  52.63 
 
 		 142 aa  157  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  55.97 
 
 		 144 aa  157  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  50.72 
 
 		 142 aa  157  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  51.08 
 
 		 142 aa  157  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  51.08 
 
 		 142 aa  157  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  51.13 
 
 		 146 aa  157  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  53.68 
 
 		 145 aa  157  6e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_447  ribosomal protein L13  51.88 
 
 		 143 aa  157  7e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000466788  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  50.36 
 
 		 142 aa  156  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0482  50S ribosomal protein L13  51.13 
 
 		 143 aa  156  7e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150083  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1669  50S ribosomal protein L13  54.89 
 
 		 142 aa  156  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000843127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  50.38 
 
 		 146 aa  156  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  53.38 
 
 		 142 aa  156  9e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  50.36 
 
 		 149 aa  156  9e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  51.8 
 
 		 149 aa  156  9e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  51.08 
 
 		 148 aa  156  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  49.64 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  50.36 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  52.9 
 
 		 142 aa  156  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  53.38 
 
 		 142 aa  156  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04010  50S ribosomal protein L13  53.38 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  50.36 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  54.14 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  53.62 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  54.14 
 
 		 147 aa  155  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  52.63 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0410  50S ribosomal protein L13  55.64 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575017  normal  0.0346472 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  50.36 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  49.64 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  51.88 
 
 		 142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  49.64 
 
 		 142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 145 aa  154  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  50.72 
 
 		 142 aa  153  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  48.2 
 
 		 142 aa  153  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  48.92 
 
 		 144 aa  153  7e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 142 aa  153  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 142 aa  153  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  50.72 
 
 		 149 aa  153  9e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  51.88 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1062  50S ribosomal protein L13  49.62 
 
 		 144 aa  152  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000039802  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  52.63 
 
 		 147 aa  152  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  50.36 
 
 		 149 aa  152  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  50.74 
 
 		 143 aa  151  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0468  50S ribosomal protein L13  54.89 
 
 		 142 aa  151  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000130449  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  51.13 
 
 		 142 aa  151  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000138225  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  50.38 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  52.63 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  53.38 
 
 		 142 aa  151  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  53.68 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  51.47 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  52.63 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16870  50S ribosomal protein L13  51.13 
 
 		 147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  51.47 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  51.47 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  51.13 
 
 		 142 aa  151  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  53.38 
 
 		 147 aa  151  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>