185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3463 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3463  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 576 aa  1152    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.158169  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0092  putative PAS/PAC sensor protein  44.46 
 
 		 577 aa  485  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2300  putative PAS/PAC sensor protein  41.51 
 
 		 574 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.252887  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0655  putative PAS/PAC sensor protein  38.79 
 
 		 580 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0426  putative PAS/PAC sensor protein  36.76 
 
 		 556 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0839  putative PAS/PAC sensor protein  36.85 
 
 		 569 aa  391  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192903 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0752  putative PAS/PAC sensor protein  38.69 
 
 		 559 aa  387  1e-106  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.801139  hitchhiker  0.0000000000202467 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02060  putative PAS/PAC sensor protein  38.82 
 
 		 571 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1585  putative PAS/PAC sensor protein  37.74 
 
 		 573 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000290099  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01770  putative PAS/PAC sensor protein  35.7 
 
 		 584 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1846  putative PAS/PAC sensor protein  32.42 
 
 		 572 aa  312  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1833  ferredoxin 2  31.31 
 
 		 583 aa  293  6e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00530052  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0494  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 519 aa  280  5e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0318  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.68 
 
 		 550 aa  276  8e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0556  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.06 
 
 		 542 aa  268  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1315  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.41 
 
 		 521 aa  267  4e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000641444  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1371  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.72 
 
 		 521 aa  265  2e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1713  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  34.3 
 
 		 748 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000552259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1889  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35.61 
 
 		 752 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0467  transcriptional regulator, Fis family  30.79 
 
 		 767 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3363  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  30.69 
 
 		 763 aa  230  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4176  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  30.69 
 
 		 755 aa  225  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000648689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3885  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  29.46 
 
 		 759 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0055  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  29.2 
 
 		 756 aa  213  9e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.928801 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3802  putative sigma54 specific transcriptional regulator  28.29 
 
 		 759 aa  213  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02950  putative PAS/PAC sensor protein  32.37 
 
 		 877 aa  208  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2312  Fe binding transcriptional regulator FhlA  27.23 
 
 		 747 aa  195  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2305  ferredoxin 2  32.5 
 
 		 500 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1292  Fe-S cluster domain protein  28.67 
 
 		 443 aa  159  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0178  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.04 
 
 		 443 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0413  hydrogenase large subunit  30.49 
 
 		 485 aa  148  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0146308  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0836  hydrogenase large subunit domain protein  33.65 
 
 		 482 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000619385  hitchhiker  0.000460922 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0884  hydrogenase large subunit domain protein  29.97 
 
 		 507 aa  143  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.139599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2145  Fe-S cluster domain-containing protein  28.38 
 
 		 435 aa  143  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1794  hydrogenase large subunit  31.56 
 
 		 462 aa  141  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0335  hydrogenase large subunit-like protein  27.75 
 
 		 448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02090  hydrogenase large subunit domain protein  30.49 
 
 		 491 aa  139  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02870  Ferredoxin hydrogenase  31.55 
 
 		 456 aa  136  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.417058  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2900  [Fe] hydrogenase  32.77 
 
 		 490 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2579  [Fe] hydrogenase  32.77 
 
 		 490 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0093  Fe-S cluster domain protein  25.51 
 
 		 460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835421 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0996  hydrogenase large subunit domain protein  31.77 
 
 		 454 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000195829  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3798  Fe-S cluster domain-containing protein  26.51 
 
 		 427 aa  128  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.818918  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2303  hydrogenase, Fe-only  27.75 
 
 		 562 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0090  ferredoxin hydrogenase  29.72 
 
 		 484 aa  125  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3465  hydrogenase large subunit domain protein  31.36 
 
 		 488 aa  123  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1040  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  26.96 
 
 		 696 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2341  iron hydrogenase  27 
 
 		 572 aa  122  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2655  iron hydrogenase  27 
 
 		 572 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1371  hydrogenase large subunit domain protein  29.79 
 
 		 508 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000870686  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0411  Ferredoxin hydrogenase  25.37 
 
 		 531 aa  118  3.9999999999999997e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0687694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0750  hydrogenase large subunit  32.48 
 
 		 482 aa  117  5e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0180769  hitchhiker  0.000000000087178 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0087  hydrogenase, Fe-only  26.09 
 
 		 567 aa  117  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1708  hydrogenase large subunit domain protein  26.09 
 
 		 435 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  26.05 
 
 		 667 aa  115  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0725  hydrogenase-like  26.99 
 
 		 483 aa  114  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000665726  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2631  Ferredoxin hydrogenase  30 
 
 		 490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000219307  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  27.73 
 
 		 666 aa  110  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0342  hydrogenase, Fe-only  25.7 
 
 		 582 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0430  hydrogenase, Fe-only  25.62 
 
 		 566 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.735126  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1277  Fe-hydrogenase large subunit family protein  28.24 
 
 		 493 aa  107  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000478337  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0912  Fe-S cluster domain protein  24.28 
 
 		 443 aa  107  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3290  hydrogenases, Fe-only  24.38 
 
 		 594 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  26.98 
 
 		 645 aa  106  9e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  26.98 
 
 		 645 aa  107  9e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4621  hydrogenase, Fe-only  25.12 
 
 		 527 aa  104  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1490  hydrogenases, Fe-only  23.37 
 
 		 601 aa  104  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1440  hydrogenase large subunit  27.97 
 
 		 429 aa  104  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0477  hydrogenase large subunit  28.4 
 
 		 478 aa  103  8e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3003  hydrogenase, Fe-only  26.2 
 
 		 644 aa  103  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2138  hydrogenase, Fe-only  23.75 
 
 		 581 aa  101  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000865974  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0692  Fe-S cluster domain protein  21.2 
 
 		 434 aa  101  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1883  ferredoxin hydrogenase  23.31 
 
 		 460 aa  100  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2467  hydrogenase, Fe-only  25.07 
 
 		 574 aa  100  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2232  hydrogenase, Fe-only  24.48 
 
 		 582 aa  99.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02980  NADH dehydrogenase I subunit G  24.84 
 
 		 570 aa  98.2  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0533  hydrogenase, Fe-only  24.88 
 
 		 582 aa  98.6  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0310904  normal  0.240554 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0723  hydrogenase, Fe-only  25.72 
 
 		 578 aa  98.2  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3805  hydrogenase, Fe-only  22.8 
 
 		 582 aa  97.4  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1299  hydrogenase, Fe-only  24.74 
 
 		 579 aa  97.1  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.130328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0813  hydrogenase large subunit domain protein  25.67 
 
 		 424 aa  94.4  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.128167  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0168  hydrogenase, Fe-only  25.67 
 
 		 513 aa  94  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.191335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  23.92 
 
 		 1150 aa  94  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0848  hydrogenases, Fe-only  24.23 
 
 		 417 aa  93.2  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16530  hydrogenase, Fe-only  22.25 
 
 		 569 aa  93.2  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.143158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  26.01 
 
 		 696 aa  92.8  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  25.77 
 
 		 653 aa  92.8  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1503  hydrogenase, Fe-only  23.12 
 
 		 418 aa  92  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349556  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1925  ferredoxin hydrogenase  24.05 
 
 		 387 aa  90.9  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1548  hydrogenase, Fe-only  23.4 
 
 		 615 aa  90.5  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01810  NADH dehydrogenase I subunit G  25.73 
 
 		 666 aa  90.5  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000616939  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1781  hydrogenase, Fe-only  23.93 
 
 		 578 aa  89.4  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1654  hydrogenases, Fe-only  24.16 
 
 		 659 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.357121  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1601  hydrogenase, Fe-only  25 
 
 		 582 aa  89  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  24.2 
 
 		 696 aa  87.8  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1783  hydrogenase, Fe-only  24.85 
 
 		 583 aa  87.8  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1384  hydrogenases, Fe-only  21.79 
 
 		 606 aa  87.4  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1651  hydrogenases, Fe-only  24.27 
 
 		 593 aa  87.4  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.556328  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_155  [Fe] hydrogenase, Hym C subunit  23.23 
 
 		 573 aa  86.3  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0081  ferredoxin hydrogenase  24.69 
 
 		 421 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>