More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2078 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  86.74 
 
 
614 aa  1114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  64.98 
 
 
613 aa  837  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  88.62 
 
 
615 aa  1129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.00228e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  68.52 
 
 
613 aa  884  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  3.54581e-05  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  61.1 
 
 
617 aa  796  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  4.37439e-05  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  87.44 
 
 
614 aa  1126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.3501e-06  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  88.94 
 
 
615 aa  1137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  8.73335e-11 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  88.62 
 
 
615 aa  1132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  7.5558e-06  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  69 
 
 
613 aa  893  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  88.46 
 
 
615 aa  1129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  9.44101e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  66.67 
 
 
614 aa  842  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  2.33078e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  87.56 
 
 
614 aa  1123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  3.6932e-07  hitchhiker  1.82105e-05 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  70.15 
 
 
612 aa  908  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  3.17657e-06  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  86.95 
 
 
614 aa  1119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  100 
 
 
615 aa  1252  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  2.18784e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  67.43 
 
 
613 aa  860  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  2.9404e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  48.98 
 
 
637 aa  588  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2367  signal peptide peptidase SppA, 67K type  48.48 
 
 
620 aa  563  1e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  46.64 
 
 
617 aa  560  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  46.3 
 
 
616 aa  546  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.49898e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  46.46 
 
 
616 aa  546  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  45.34 
 
 
621 aa  535  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  45.71 
 
 
616 aa  533  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  8.32547e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.72 
 
 
616 aa  492  1e-138  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  44.63 
 
 
618 aa  491  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  44.63 
 
 
622 aa  491  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  44.63 
 
 
618 aa  490  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  44.63 
 
 
618 aa  490  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  43.6 
 
 
616 aa  489  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  44.63 
 
 
618 aa  490  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.24959e-08  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  44.63 
 
 
618 aa  491  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  44.63 
 
 
618 aa  490  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  6.40053e-06 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  42.63 
 
 
616 aa  488  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1681  protease 4  43.94 
 
 
618 aa  486  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239548  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1990  protease 4  44.46 
 
 
618 aa  486  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152485  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1389  protease 4  44.14 
 
 
618 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146845  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2051  protease 4  43.97 
 
 
618 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.278981 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1406  protease 4  44.14 
 
 
618 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147485  normal  0.119343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1880  protease 4  44.14 
 
 
618 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000366121  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  46.3 
 
 
618 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1422  protease 4  43.97 
 
 
618 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.671113 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.41 
 
 
617 aa  473  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2486  protease 4  44.63 
 
 
618 aa  473  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.944254  normal  0.176457 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  44.78 
 
 
617 aa  463  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2346  protease 4  45.84 
 
 
616 aa  453  1e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.06232e-06  decreased coverage  0.00400443 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1982  protease 4  45.73 
 
 
616 aa  446  1e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.07213e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2091  protease 4  45.49 
 
 
616 aa  447  1e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0442  protease 4  40.3 
 
 
618 aa  438  1e-121  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.116179  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  40.26 
 
 
621 aa  433  1e-120  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.75 
 
 
640 aa  432  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  43.32 
 
 
610 aa  430  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  1.53698e-07 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.2 
 
 
611 aa  431  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.33 
 
 
633 aa  422  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  42.33 
 
 
633 aa  419  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.71 
 
 
629 aa  419  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4062  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.67 
 
 
613 aa  372  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244218  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0522  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.83 
 
 
626 aa  347  4e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200693  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.77 
 
 
625 aa  317  3e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2221  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.45 
 
 
661 aa  317  6e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.431319 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  36.38 
 
 
608 aa  315  1e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.65 
 
 
590 aa  304  4e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  34.97 
 
 
609 aa  294  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.39 
 
 
605 aa  294  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.77 
 
 
595 aa  293  9e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.43 
 
 
587 aa  292  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  34.17 
 
 
611 aa  291  3e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  35.05 
 
 
609 aa  285  2e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  5.32675e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.46 
 
 
605 aa  284  4e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  8.52075e-06 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.46 
 
 
605 aa  284  4e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.46 
 
 
585 aa  283  8e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  35.86 
 
 
513 aa  276  7e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.24 
 
 
598 aa  273  5e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.24 
 
 
598 aa  273  5e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.74 
 
 
590 aa  272  1e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  3.75913e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  33.21 
 
 
583 aa  271  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.46 
 
 
656 aa  270  8e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2800  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.9 
 
 
588 aa  250  5e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.39 
 
 
589 aa  247  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.91 
 
 
566 aa  227  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1320  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.34 
 
 
595 aa  223  9e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.55 
 
 
563 aa  221  2e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.25 
 
 
604 aa  217  6e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.07 
 
 
649 aa  215  2e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  31.99 
 
 
623 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  30.75 
 
 
569 aa  211  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1631  protease IV  29.59 
 
 
583 aa  206  9e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.33 
 
 
593 aa  202  1e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.33 
 
 
593 aa  202  1e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0670  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.96 
 
 
597 aa  202  1e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0556  signal peptide peptidase A  31.59 
 
 
601 aa  202  2e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0603  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.38 
 
 
597 aa  199  2e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.849681  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.11 
 
 
595 aa  198  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1343  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.84 
 
 
594 aa  196  8e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19865  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.02 
 
 
593 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.2 
 
 
596 aa  194  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0510  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.17 
 
 
596 aa  194  6e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.57 
 
 
562 aa  193  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  31.45 
 
 
601 aa  193  9e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3608  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.98 
 
 
570 aa  193  9e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113162  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.36 
 
 
584 aa  192  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>