195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1367 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  74.79 
 
 
611 aa  931  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  89.79 
 
 
614 aa  1110  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  88.78 
 
 
607 aa  1088  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  89.13 
 
 
614 aa  1103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  88.61 
 
 
607 aa  1087  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  64.91 
 
 
622 aa  836  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  89.62 
 
 
614 aa  1108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  88.45 
 
 
607 aa  1111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  5.15921e-05 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  100 
 
 
614 aa  1260  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  71.33 
 
 
608 aa  917  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  90.03 
 
 
617 aa  1105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1649  hypothetical protein  82.95 
 
 
352 aa  585  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  47.31 
 
 
615 aa  467  1e-130  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  43.21 
 
 
615 aa  468  1e-130  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  46.08 
 
 
627 aa  468  1e-130  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  47.31 
 
 
615 aa  468  1e-130  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  47.33 
 
 
615 aa  464  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  46.69 
 
 
628 aa  458  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  46.89 
 
 
616 aa  454  1e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.02664e-05  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  47.1 
 
 
616 aa  454  1e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  4.81618e-06  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  46.89 
 
 
616 aa  453  1e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  94.69 
 
 
227 aa  452  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  42.58 
 
 
614 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  46.68 
 
 
616 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.23999e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  43.57 
 
 
613 aa  446  1e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  43.09 
 
 
602 aa  445  1e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  42.74 
 
 
617 aa  447  1e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  41.58 
 
 
613 aa  444  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.82029e-06  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  44.89 
 
 
618 aa  441  1e-122  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.60677e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  44.95 
 
 
625 aa  442  1e-122  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  42.32 
 
 
624 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.99463e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  42.36 
 
 
618 aa  427  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  42.25 
 
 
617 aa  427  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  40.29 
 
 
630 aa  414  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  39.24 
 
 
625 aa  400  1e-110  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  39.18 
 
 
633 aa  393  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  38.25 
 
 
628 aa  382  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  1.65722e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  42.89 
 
 
605 aa  379  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  39.69 
 
 
609 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  35.65 
 
 
628 aa  369  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  39.69 
 
 
609 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  39.69 
 
 
609 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  3.491e-08 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  39.49 
 
 
609 aa  363  7e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  41.14 
 
 
636 aa  362  8e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  38.92 
 
 
616 aa  362  1e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.86308e-06  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  39.3 
 
 
609 aa  362  1e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  40.35 
 
 
616 aa  362  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  39.53 
 
 
611 aa  361  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  5.55519e-06 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  39.3 
 
 
609 aa  361  3e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  36.38 
 
 
629 aa  360  4e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  38.96 
 
 
609 aa  358  1e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  4.29666e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  38.77 
 
 
611 aa  357  2e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  4.85801e-09 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  38.96 
 
 
609 aa  357  5e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  6.339e-11 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  36.91 
 
 
610 aa  353  5e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  36.84 
 
 
605 aa  353  7e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  37.07 
 
 
607 aa  352  9e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  38.98 
 
 
621 aa  349  1e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  37.77 
 
 
609 aa  344  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  36.22 
 
 
609 aa  344  2e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  35.48 
 
 
609 aa  344  3e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  34.94 
 
 
585 aa  335  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  37.79 
 
 
635 aa  333  4e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  37.79 
 
 
635 aa  333  4e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  38 
 
 
635 aa  333  5e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  35.09 
 
 
1283 aa  333  7e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  36.13 
 
 
639 aa  321  2e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  34.32 
 
 
601 aa  315  1e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  34.14 
 
 
601 aa  313  5e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  34.14 
 
 
601 aa  313  8e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  34.62 
 
 
604 aa  312  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  36.52 
 
 
594 aa  308  2e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  34.2 
 
 
587 aa  308  2e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  34.49 
 
 
602 aa  304  3e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  34.56 
 
 
589 aa  303  4e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  34.08 
 
 
601 aa  303  8e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  33.91 
 
 
603 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  34.25 
 
 
603 aa  300  5e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  35.04 
 
 
583 aa  300  8e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  33.73 
 
 
603 aa  299  9e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  33.8 
 
 
603 aa  299  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  4.26014e-10 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  33.91 
 
 
603 aa  299  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  34.77 
 
 
619 aa  296  5e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3398  hypothetical protein  36.85 
 
 
610 aa  295  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2044  twin-arginine translocation pathway signal  34.96 
 
 
614 aa  294  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  32.67 
 
 
637 aa  291  2e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  33.46 
 
 
595 aa  290  5e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  34.43 
 
 
599 aa  290  5e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  37.67 
 
 
608 aa  290  7e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  32.73 
 
 
605 aa  289  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  32.48 
 
 
635 aa  289  1e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  32.69 
 
 
599 aa  289  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  37.67 
 
 
608 aa  288  3e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  36.9 
 
 
611 aa  288  3e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  34.17 
 
 
591 aa  287  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  35.19 
 
 
599 aa  285  1e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  32.48 
 
 
629 aa  285  2e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  33.52 
 
 
592 aa  284  3e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  36.23 
 
 
621 aa  283  5e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  32.94 
 
 
619 aa  282  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  31.12 
 
 
610 aa  278  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>