More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0570 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0570  ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 720 aa  1467    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0749  histidine kinase  28.79 
 
 		 722 aa  270  7e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3949  histidine kinase  28.01 
 
 		 679 aa  206  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  27.37 
 
 		 738 aa  178  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1575  histidine kinase  24.5 
 
 		 684 aa  177  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000414678  decreased coverage  0.0000074807 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4625  histidine kinase  25.13 
 
 		 756 aa  172  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402141 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1181  histidine kinase  27.5 
 
 		 719 aa  169  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.798724  normal  0.0930045 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2441  histidine kinase  24.26 
 
 		 674 aa  167  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459087  unclonable  0.00000000106284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2565  histidine kinase  24.74 
 
 		 796 aa  153  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36080  ATP binding/ATPase (HATPase_c) domain-containing protein  23.85 
 
 		 723 aa  152  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785122  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  27.61 
 
 		 946 aa  125  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2516  putative prophage encoded two-component system histidine kinase  26.99 
 
 		 774 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222494  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2655  histidine kinase  28.3 
 
 		 771 aa  105  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0835586 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5323  histidine kinase  23.82 
 
 		 783 aa  101  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.15205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1489  histidine kinase  25.77 
 
 		 774 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0079  histidine kinase  25.32 
 
 		 987 aa  90.9  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217254  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4587  histidine kinase  21.82 
 
 		 784 aa  87  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4048  histidine kinase  25 
 
 		 773 aa  77.4  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0371  histidine kinase  31.52 
 
 		 989 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2495  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.47 
 
 		 463 aa  72  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0489906  normal  0.418154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1158  hypothetical protein  29.52 
 
 		 971 aa  71.2  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0746072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0301  histidine kinase  25.24 
 
 		 994 aa  70.9  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4833  sensory box histidine kinase  24.75 
 
 		 899 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4373  PAS  28.99 
 
 		 907 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323082  normal  0.21328 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 470 aa  67  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0504  signal transduction protein, histidine kinase  31.37 
 
 		 997 aa  66.6  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.284164  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0125  histidine kinase  26.27 
 
 		 498 aa  64.3  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  25.66 
 
 		 458 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  25.66 
 
 		 458 aa  63.9  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 497 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.45 
 
 		 1845 aa  63.9  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 		 591 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  25.48 
 
 		 458 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1499  flagellar regulatory protein B  23.75 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440819  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0344  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.75 
 
 		 459 aa  62.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337335  normal  0.899671 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  25.48 
 
 		 458 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  25.48 
 
 		 458 aa  62.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  25.22 
 
 		 458 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3013  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  25.66 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4084  GAF sensor signal transduction histidine kinase  22.01 
 
 		 441 aa  62  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  26.5 
 
 		 612 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03833  hypothetical protein  25.63 
 
 		 422 aa  62  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0772561  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0721  hypothetical protein  25.54 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0783179  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.23 
 
 		 519 aa  61.6  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1084  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 495 aa  61.6  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.5 
 
 		 933 aa  61.6  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.493639  hitchhiker  0.0000319453 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.36 
 
 		 514 aa  61.6  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0595  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.64 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0465  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  26.5 
 
 		 599 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.12 
 
 		 585 aa  60.1  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572324  normal  0.76853 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3093  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.58 
 
 		 444 aa  60.1  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  24.52 
 
 		 465 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1233  PAS sensor protein  22.53 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2884  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.260369  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1492  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.609505  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.45 
 
 		 604 aa  60.1  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405956  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1589  hypothetical protein  32.28 
 
 		 698 aa  59.7  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242692  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2080  ATP-binding region ATPase domain protein  24.56 
 
 		 542 aa  59.3  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1376  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 		 737 aa  59.7  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00550904  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0790  histidine kinase  22.92 
 
 		 522 aa  59.7  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 597 aa  59.3  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0801303  normal  0.115737 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  26.84 
 
 		 830 aa  58.9  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2586  sensor histidine kinase  25.23 
 
 		 623 aa  59.3  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.209829  normal  0.69032 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0875  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 548 aa  58.9  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2129  sensor histidine kinase  24.45 
 
 		 587 aa  58.9  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178359  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1723  histidine kinase  24.78 
 
 		 608 aa  58.9  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.10547 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3242  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  23.51 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0037  sensor histidine kinase  22.98 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2355  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 902 aa  59.3  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.415333  normal  0.408426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0637  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  24.82 
 
 		 921 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.91 
 
 		 592 aa  58.5  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2911  ATPase domain-containing protein  22.69 
 
 		 613 aa  58.9  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2525  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.46 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.465456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1230  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  27.23 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0439907  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0900  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1510  C4-dicarboxylate transport sensor protein dctB  27.23 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.220294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.4 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479611  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0491  hydrogen uptake histidine-kinase  24.4 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3598  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.2 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0961  hypothetical protein  27.64 
 
 		 587 aa  58.2  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.598783  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0041  sensor histidine kinase  23 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  23.99 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4258  histidine kinase  26.55 
 
 		 506 aa  57.8  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  25.58 
 
 		 643 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1517  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 632 aa  57.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 		 701 aa  57.4  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000562313  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  25.58 
 
 		 643 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0975  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 		 683 aa  57.8  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2545  ATP-binding region, ATPase-like protein  27.78 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2874  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 		 693 aa  57.8  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266107 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  25.58 
 
 		 643 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 553 aa  57.4  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  25.44 
 
 		 465 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.01 
 
 		 598 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0050  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.46 
 
 		 871 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0971682  decreased coverage  0.000571287 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  23.85 
 
 		 1306 aa  57  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>