More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5329 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 440 aa  858    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  71.53 
 
 		 437 aa  604  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  77.54 
 
 		 438 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  68.72 
 
 		 439 aa  583  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  62.39 
 
 		 460 aa  498  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  55.33 
 
 		 455 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  52.26 
 
 		 439 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  51.7 
 
 		 450 aa  432  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  51.88 
 
 		 435 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  51.88 
 
 		 435 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  51.88 
 
 		 435 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  52.26 
 
 		 439 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  52.26 
 
 		 439 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  49.89 
 
 		 456 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  51.52 
 
 		 484 aa  425  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  50.93 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  50.93 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  50.93 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  50 
 
 		 447 aa  420  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  48.86 
 
 		 458 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  47.78 
 
 		 459 aa  413  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  56.4 
 
 		 461 aa  412  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  49.18 
 
 		 459 aa  415  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  49.18 
 
 		 459 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  53.21 
 
 		 439 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  50.68 
 
 		 460 aa  408  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  50.36 
 
 		 441 aa  401  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  50.47 
 
 		 435 aa  401  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  52.31 
 
 		 443 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  49.21 
 
 		 459 aa  395  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  52.91 
 
 		 456 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3969  major facilitator transporter  50.61 
 
 		 457 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  47.66 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  50 
 
 		 454 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  50.11 
 
 		 455 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  47.51 
 
 		 450 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  47.03 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  47.99 
 
 		 468 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  48.88 
 
 		 441 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  48.46 
 
 		 438 aa  363  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4210  major facilitator superfamily MFS_1  51.66 
 
 		 448 aa  363  3e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.199459  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  47.2 
 
 		 431 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  46.91 
 
 		 443 aa  360  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  45.97 
 
 		 430 aa  358  8e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  43.09 
 
 		 439 aa  358  8e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  50.51 
 
 		 446 aa  358  9e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  49.64 
 
 		 430 aa  358  9.999999999999999e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4803  major facilitator superfamily MFS_1  48.76 
 
 		 444 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.543727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  43.89 
 
 		 457 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  43.89 
 
 		 457 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  43.89 
 
 		 457 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07050  arabinose efflux permease family protein  45.88 
 
 		 429 aa  353  4e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267941 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  50 
 
 		 452 aa  352  5e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.13 
 
 		 438 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  45.18 
 
 		 437 aa  352  7e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5966  major facilitator transporter  49.07 
 
 		 457 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  50 
 
 		 432 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  50 
 
 		 432 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  50 
 
 		 432 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  46.87 
 
 		 447 aa  350  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  45.69 
 
 		 442 aa  350  4e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  44.75 
 
 		 445 aa  349  5e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3577  major facilitator transporter  47.27 
 
 		 453 aa  349  6e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  48.44 
 
 		 460 aa  348  8e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  44.92 
 
 		 482 aa  347  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  48.2 
 
 		 460 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  48.32 
 
 		 445 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  47.72 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.26 
 
 		 437 aa  347  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  48.48 
 
 		 442 aa  347  3e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  43.91 
 
 		 430 aa  347  4e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3519  major facilitator superfamily MFS_1  48.15 
 
 		 444 aa  346  4e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  47.9 
 
 		 445 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0094  major facilitator transporter  50.13 
 
 		 443 aa  346  4e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  47.9 
 
 		 445 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3240  major facilitator superfamily MFS_1  47.46 
 
 		 466 aa  346  5e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  47.66 
 
 		 445 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  47.34 
 
 		 442 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  47.97 
 
 		 438 aa  342  7e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  45.5 
 
 		 439 aa  342  7e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  47.36 
 
 		 445 aa  342  7e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  43.12 
 
 		 438 aa  342  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  44.39 
 
 		 437 aa  340  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0176  major facilitator superfamily MFS_1  48.28 
 
 		 449 aa  340  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1110  major facilitator superfamily protein  45.21 
 
 		 449 aa  340  4e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  43.79 
 
 		 439 aa  339  7e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  43.12 
 
 		 438 aa  338  9e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  43.12 
 
 		 438 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  42.89 
 
 		 438 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  42.89 
 
 		 438 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  42.89 
 
 		 438 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  43.87 
 
 		 439 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  43.12 
 
 		 438 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4212  major facilitator superfamily MFS_1  48.84 
 
 		 458 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  46.97 
 
 		 439 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  43.46 
 
 		 439 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  43.33 
 
 		 439 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  42.89 
 
 		 438 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  43.33 
 
 		 439 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  43.87 
 
 		 439 aa  335  7e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>