More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3093 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3093  Citrate (Si)-synthase  100 
 
 
378 aa  777    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.832749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6150  Citrate (Si)-synthase  66.67 
 
 
391 aa  518  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.153659 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3561  Citrate (Si)-synthase  64.52 
 
 
387 aa  474  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3748  Citrate (Si)-synthase  55.44 
 
 
388 aa  415  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1729  Citrate (Si)-synthase  51.06 
 
 
373 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120294  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  41.3 
 
 
395 aa  286  4e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2557  citrate synthase  42.12 
 
 
391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4146  citrate (Si)-synthase  41.6 
 
 
375 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2423  Citrate (Si)-synthase  40.11 
 
 
377 aa  261  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.32 
 
 
382 aa  258  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.7 
 
 
430 aa  258  1e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2539  Citrate (Si)-synthase  40.33 
 
 
374 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.64966  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.3 
 
 
379 aa  251  1e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.75 
 
 
378 aa  251  1e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.75 
 
 
390 aa  248  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.57 
 
 
382 aa  247  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.47 
 
 
385 aa  247  3e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  35.77 
 
 
370 aa  246  6e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  37.27 
 
 
396 aa  246  6e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.98 
 
 
382 aa  246  6.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  38.89 
 
 
381 aa  245  8e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  38.56 
 
 
397 aa  244  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  38.48 
 
 
375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  39.02 
 
 
378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  38.62 
 
 
381 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  38.36 
 
 
381 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  36.91 
 
 
374 aa  242  6e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  37.74 
 
 
372 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  35.22 
 
 
373 aa  241  1e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  38.48 
 
 
375 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.14 
 
 
387 aa  240  4e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.25 
 
 
397 aa  239  5e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  38.15 
 
 
381 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  37.53 
 
 
372 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  36.29 
 
 
373 aa  239  9e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  36.29 
 
 
373 aa  239  9e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.26 
 
 
367 aa  238  1e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.26 
 
 
367 aa  238  1e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0713  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.94 
 
 
404 aa  237  2e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.756288  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.13 
 
 
380 aa  236  4e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  38.08 
 
 
396 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  36.41 
 
 
378 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.75 
 
 
380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  36.44 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2031  citrate (Si)-synthase  36.46 
 
 
473 aa  233  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602388  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  37.99 
 
 
412 aa  232  8.000000000000001e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.3 
 
 
409 aa  232  9e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2420  Citrate synthase  35.5 
 
 
481 aa  229  5e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.22 
 
 
377 aa  228  9e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  37.3 
 
 
373 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.37 
 
 
377 aa  228  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  36.41 
 
 
386 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  37.37 
 
 
386 aa  228  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.97 
 
 
373 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.08 
 
 
375 aa  226  4e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  36.29 
 
 
397 aa  226  7e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.73 
 
 
379 aa  225  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1868  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.5 
 
 
376 aa  225  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.650369  normal  0.135048 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.51 
 
 
393 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1198  methylcitrate synthase  37.67 
 
 
376 aa  224  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  36.51 
 
 
386 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  36.51 
 
 
386 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  36.39 
 
 
387 aa  223  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03371  methylcitrate synthase  35.95 
 
 
373 aa  222  7e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  35.81 
 
 
371 aa  222  8e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.96 
 
 
378 aa  222  8e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2498  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.04 
 
 
374 aa  222  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0246552 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  36.64 
 
 
371 aa  222  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  34.68 
 
 
383 aa  221  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1665  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.42 
 
 
374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  35.15 
 
 
382 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  35.15 
 
 
382 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0511  citrate synthase 2  37.23 
 
 
368 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.043222  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  35.54 
 
 
371 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  35.54 
 
 
371 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  35.54 
 
 
371 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  35.54 
 
 
371 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  35.15 
 
 
382 aa  219  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2480  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.47 
 
 
380 aa  219  5e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388889  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  34.05 
 
 
386 aa  219  7e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  34.05 
 
 
386 aa  219  7e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  35.6 
 
 
382 aa  219  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1111  methylcitrate synthase  35.81 
 
 
379 aa  218  1e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1765  methylcitrate synthase  36.71 
 
 
375 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.924616  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  34.76 
 
 
391 aa  218  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2112  2-methylcitrate synthase  34.25 
 
 
374 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  37.19 
 
 
374 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  36.99 
 
 
371 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4141  methylcitrate synthase  35.05 
 
 
379 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4022  methylcitrate synthase  35.05 
 
 
375 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3946  methylcitrate synthase  35.05 
 
 
375 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1821  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.42 
 
 
374 aa  216  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1310  methylcitrate synthase  35.26 
 
 
375 aa  216  5e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  35.26 
 
 
378 aa  216  5e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1692  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.81 
 
 
409 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.141022  normal  0.100865 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0247  citrate synthase 2  36.68 
 
 
368 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0848  Citrate (Si)-synthase  36.56 
 
 
368 aa  215  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4048  methylcitrate synthase  34.78 
 
 
375 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3645  methylcitrate synthase  34.78 
 
 
375 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11154  citrate synthase  36.31 
 
 
393 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>