More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6230 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5870  FixC protein  72.18 
 
 		 435 aa  642    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100427  normal  0.798669 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4927  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  75.4 
 
 		 435 aa  687    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5046  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  74.25 
 
 		 435 aa  672    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6230  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 435 aa  897    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3575  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  69.2 
 
 		 435 aa  633  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120471  normal  0.145615 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4446  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  71.95 
 
 		 435 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5084  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  71.72 
 
 		 435 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3614  FAD dependent oxidoreductase  70.34 
 
 		 435 aa  629  1e-179  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119671 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1090  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.34 
 
 		 435 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0986  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.34 
 
 		 435 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.105953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0140  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  68.97 
 
 		 435 aa  615  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.942085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4013  FAD dependent oxidoreductase  68.05 
 
 		 435 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0489  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  64.6 
 
 		 433 aa  591  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.905872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1553  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.24 
 
 		 436 aa  554  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.229666 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2265  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  60.19 
 
 		 433 aa  543  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00453186  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1370  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.14 
 
 		 434 aa  513  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1434  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.74 
 
 		 436 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000988984  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1478  fixC protein  59.26 
 
 		 432 aa  504  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1194  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.26 
 
 		 432 aa  504  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0537689 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2315  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.81 
 
 		 436 aa  498  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0377746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10540  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase, FixC  57.41 
 
 		 432 aa  492  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106956  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7737  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.04 
 
 		 436 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1540  FAD dependent oxidoreductase  46.99 
 
 		 431 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0060  FAD dependent oxidoreductase  43.42 
 
 		 432 aa  344  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012744 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1937  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  45.14 
 
 		 431 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1195  FAD dependent oxidoreductase  40.68 
 
 		 438 aa  323  5e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  40.18 
 
 		 430 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  40.45 
 
 		 438 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0958  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  40.55 
 
 		 437 aa  309  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  40.24 
 
 		 429 aa  299  6e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3598  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  40.78 
 
 		 438 aa  297  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4041  FAD dependent oxidoreductase  38.48 
 
 		 429 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3232  FAD dependent oxidoreductase  38.88 
 
 		 430 aa  281  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2679  FAD dependent oxidoreductase  39.02 
 
 		 430 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1397  hypothetical protein  38.77 
 
 		 429 aa  271  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222986  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 430 aa  269  8.999999999999999e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  37.07 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  36.83 
 
 		 428 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  36.59 
 
 		 428 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  36.83 
 
 		 428 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  36.98 
 
 		 428 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  36.59 
 
 		 428 aa  266  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3106  FAD dependent oxidoreductase  36.57 
 
 		 472 aa  262  8.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000790545 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  34.88 
 
 		 432 aa  260  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2124  hypothetical protein  38.28 
 
 		 428 aa  259  6e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  38.14 
 
 		 434 aa  259  8e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0047  putative oxidoreductase FixC  37.11 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1822  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  35.73 
 
 		 431 aa  258  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.170222 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1496  hypothetical protein  37.78 
 
 		 429 aa  258  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.403861 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  36.87 
 
 		 428 aa  257  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  36.87 
 
 		 428 aa  257  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  36.87 
 
 		 428 aa  257  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  36.87 
 
 		 428 aa  257  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  36.87 
 
 		 428 aa  257  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  36.87 
 
 		 428 aa  256  6e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2416  hypothetical protein  37.28 
 
 		 429 aa  256  7e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  37.16 
 
 		 432 aa  256  7e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01668  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  37.53 
 
 		 429 aa  255  9e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01657  hypothetical protein  37.53 
 
 		 429 aa  255  9e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1943  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  37.53 
 
 		 429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633206  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1916  hypothetical protein  37.53 
 
 		 429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0045  putative oxidoreductase FixC  35.8 
 
 		 428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820288  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1932  hypothetical protein  37.28 
 
 		 429 aa  253  7e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1902  hypothetical protein  37.28 
 
 		 429 aa  251  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3927  FAD dependent oxidoreductase  36.41 
 
 		 431 aa  247  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1464  hypothetical protein  37.16 
 
 		 428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.682941  normal  0.67626 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1448  hypothetical protein  37.16 
 
 		 428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08770  flavin-dependent dehydrogenase  36.41 
 
 		 437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.9458 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1482  hypothetical protein  37.16 
 
 		 428 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839158  normal  0.0909638 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1992  hypothetical protein  36.92 
 
 		 428 aa  242  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.594962  normal  0.0242177 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1820  hypothetical protein  36.92 
 
 		 428 aa  242  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0479  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  37.1 
 
 		 425 aa  239  8e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000230935  decreased coverage  0.000263259 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09250  flavin-dependent dehydrogenase  35.05 
 
 		 442 aa  233  7.000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.696714 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1843  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  36.45 
 
 		 431 aa  232  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.186881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27800  flavin-dependent dehydrogenase  35.28 
 
 		 439 aa  229  7e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2198  FAD dependent oxidoreductase  37.75 
 
 		 446 aa  226  6e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0129  FAD dependent oxidoreductase  32.19 
 
 		 436 aa  226  7e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1434  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  33.72 
 
 		 442 aa  224  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02611  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  31.73 
 
 		 423 aa  203  6e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0922  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  31.73 
 
 		 423 aa  203  6e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.713397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02574  hypothetical protein  31.73 
 
 		 423 aa  203  6e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0946  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  31.73 
 
 		 423 aa  202  9e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2906  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.49 
 
 		 423 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4021  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.73 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3068  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.49 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3107  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.57 
 
 		 422 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.916046  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0648  FAD dependent oxidoreductase  34.59 
 
 		 424 aa  200  5e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.567553  hitchhiker  0.0038978 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00140  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  32.84 
 
 		 388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2000  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.39 
 
 		 426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2369  FAD dependent oxidoreductase  34.09 
 
 		 424 aa  196  7e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2895  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.01 
 
 		 423 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3860  FAD dependent oxidoreductase  32.06 
 
 		 438 aa  192  8e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00230775  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2135  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 424 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  34.76 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0590  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.95 
 
 		 407 aa  157  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00186747  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2615  FAD dependent oxidoreductase  33.68 
 
 		 553 aa  141  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.489125  normal  0.819562 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0333  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.882916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1249  FAD dependent oxidoreductase  35.89 
 
 		 387 aa  138  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0484  monooxygenase FAD-binding protein  32.59 
 
 		 561 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35565  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05546  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  26.43 
 
 		 554 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>