More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5118 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5118  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 707 aa  1397    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179318  normal  0.034812 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0600  CheA signal transduction histidine kinase  51.56 
 
 		 706 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 		 705 aa  349  9e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 784 aa  346  1e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 705 aa  345  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 777 aa  331  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  31.77 
 
 		 764 aa  325  2e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 679 aa  320  5e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 801 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 		 741 aa  318  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 740 aa  317  4e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 742 aa  316  9e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 		 679 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  32.25 
 
 		 768 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1193  CheA signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 		 706 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0440291  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 		 777 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  32.44 
 
 		 764 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 762 aa  298  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0469  CheA signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 		 830 aa  298  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153889  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  30.7 
 
 		 734 aa  297  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  35.73 
 
 		 878 aa  296  8e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 756 aa  295  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  32.81 
 
 		 764 aa  295  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 755 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3136  CheA signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 649 aa  292  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  32.61 
 
 		 769 aa  293  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 760 aa  291  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 783 aa  290  8e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 686 aa  287  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.43 
 
 		 764 aa  287  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 772 aa  286  7e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 808 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  32.19 
 
 		 763 aa  283  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 781 aa  278  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  27.98 
 
 		 769 aa  278  3e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  33.02 
 
 		 752 aa  277  5e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  27.29 
 
 		 769 aa  276  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2297  CheA signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 		 799 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  27.32 
 
 		 769 aa  276  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  37.25 
 
 		 798 aa  275  3e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 865 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 865 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  35.41 
 
 		 1866 aa  273  7e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 777 aa  269  1e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  31.81 
 
 		 770 aa  267  4e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 		 793 aa  266  7e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3533  CheA signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 808 aa  265  3e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.229129  normal  0.100521 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.99 
 
 		 1960 aa  265  3e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  30.47 
 
 		 789 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  31.06 
 
 		 785 aa  263  8e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  31.49 
 
 		 783 aa  263  8.999999999999999e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 896 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 896 aa  261  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 804 aa  260  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 765 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 766 aa  260  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 762 aa  260  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 2212 aa  260  7e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 767 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 695 aa  259  1e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  36.13 
 
 		 839 aa  258  4e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 989 aa  257  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 989 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 2012 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 2009 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 1012 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 769 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 769 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  31.62 
 
 		 769 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  31.62 
 
 		 769 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  33.96 
 
 		 2048 aa  253  7e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 1907 aa  253  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 1065 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 		 2539 aa  252  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  31.24 
 
 		 774 aa  251  3e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  32.43 
 
 		 769 aa  251  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  31.74 
 
 		 770 aa  251  3e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  32.57 
 
 		 1956 aa  250  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  32.71 
 
 		 2458 aa  249  9e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  28.8 
 
 		 1180 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  32.52 
 
 		 2476 aa  249  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  36.42 
 
 		 2092 aa  248  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 1974 aa  248  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  34.48 
 
 		 832 aa  248  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  34.48 
 
 		 864 aa  247  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 		 2137 aa  248  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  34.66 
 
 		 1970 aa  248  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  34.48 
 
 		 864 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  34.48 
 
 		 864 aa  247  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  34.48 
 
 		 864 aa  247  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  34.48 
 
 		 864 aa  247  6e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  34.48 
 
 		 864 aa  247  6e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 974 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  34.19 
 
 		 1079 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0638  CheA signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 753 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 2423 aa  244  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 		 1758 aa  244  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3065  CheA signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 748 aa  245  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.93771  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.89 
 
 		 974 aa  244  6e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0647  CheA signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 756 aa  243  7e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>