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for query gene Smed_2519 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2519  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 399 aa  775    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.632928 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1232  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  64.8 
 
 		 396 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104179  normal  1 
 
 
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NC_009140  SNSL254_pSN254_0040  florfenicol/chloramphenicol resistance protein FloR  67.72 
 
 		 404 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_1320  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  67.73 
 
 		 395 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_3944  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  62.87 
 
 		 401 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3862  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  59.79 
 
 		 399 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.984629 
 
 
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NC_009667  Oant_1335  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  62.43 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.409904  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_4704  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  59.79 
 
 		 399 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3659  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  59.79 
 
 		 399 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154078  normal  0.828723 
 
 
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NC_011071  Smal_3550  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  60.75 
 
 		 395 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B2449  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  59.62 
 
 		 410 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011092  SeSA_B0064  chloramphenicol resistance protein  49.48 
 
 		 419 aa  352  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.629663 
 
 
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NC_009511  Swit_3389  hypothetical protein  68.83 
 
 		 244 aa  300  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0402028 
 
 
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NC_008577  Shewana3_2204  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.64 
 
 		 402 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  35.01 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_0297  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.27 
 
 		 401 aa  169  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169159  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_3494  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.66 
 
 		 402 aa  163  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.61895  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_4271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.01 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0763382 
 
 
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NC_009665  Shew185_4138  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.01 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009052  Sbal_0196  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.01 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_0196  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.01 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  31.35 
 
 		 401 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.74 
 
 		 400 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.662405 
 
 
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NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.14 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009783  VIBHAR_00358  permease  32.29 
 
 		 423 aa  153  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.24 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  31.62 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.62 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_3948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.52 
 
 		 402 aa  149  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3823  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.23 
 
 		 402 aa  149  9e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_3750  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.93 
 
 		 402 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  32.32 
 
 		 397 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_0325  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.83 
 
 		 402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_4555  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  34.42 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_2509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.64 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.29 
 
 		 394 aa  143  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
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NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.94 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.67 
 
 		 413 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
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NC_007778  RPB_2009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.67 
 
 		 429 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175256  normal  0.467375 
 
 
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NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  29.94 
 
 		 398 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.94 
 
 		 398 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.91 
 
 		 400 aa  135  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009457  VC0395_A2445  putative multidrug resistance protein  30.15 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.81 
 
 		 398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.34 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.03 
 
 		 392 aa  133  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.86 
 
 		 412 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.39 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  30.54 
 
 		 398 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.83 
 
 		 412 aa  129  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4246  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.49 
 
 		 411 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381159  normal  0.103625 
 
 
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NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.67 
 
 		 411 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.97 
 
 		 411 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
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NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.56 
 
 		 396 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  29.61 
 
 		 420 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_5989  sugar (and other) transporter  37.4 
 
 		 411 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.291494  normal  0.241739 
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  31.71 
 
 		 404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_2744  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.91 
 
 		 397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000519122 
 
 
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NC_009075  BURPS668_A0774  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.35 
 
 		 403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0782  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.94 
 
 		 402 aa  126  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.02 
 
 		 418 aa  126  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.84 
 
 		 400 aa  126  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.799827  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0683  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.64 
 
 		 403 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8441  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A2033  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.35 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1996  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.21 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_1058  Bcr/CflA family drug resistance transporter  30.35 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1774  Bcr/CflA family drug resistance transporter  30.35 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2106  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.21 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.758817  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_4120  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.97 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174908  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  32.56 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_0765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.35 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.356599  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_4034  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34 
 
 		 428 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_3668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.5 
 
 		 411 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.79 
 
 		 399 aa  123  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.79 
 
 		 401 aa  123  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_2254  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.31 
 
 		 399 aa  123  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS3263  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.39 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00113776  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_3518  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.39 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0261106  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.79 
 
 		 425 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.79 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.07 
 
 		 436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal  1 
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A2059  putative transporter protein  30.03 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_3478  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  29.39 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_2399  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.39 
 
 		 457 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.35739 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_3170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.17 
 
 		 399 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.04 
 
 		 412 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  33.87 
 
 		 414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_3235  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.11 
 
 		 399 aa  120  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154906  n/a   
 
 
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NC_009717  Xaut_4936  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.79 
 
 		 409 aa  119  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380942  normal  1 
 
 
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NC_006274  BCZK3177  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.53 
 
 		 399 aa  119  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000683833  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.31 
 
 		 401 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_2001  inner membrane transport protein YdhC  30.25 
 
 		 423 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.330416  hitchhiker  0.000336538 
 
 
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NC_013757  Gobs_3432  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.23 
 
 		 438 aa  119  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00363219  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.17 
 
 		 461 aa  119  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.82 
 
 		 430 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1975  inner membrane transport protein YdhC  29.89 
 
 		 423 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00432346  normal  0.238152 
 
 
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NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.71 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.03 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.69 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
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NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.7 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
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