78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0597 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0597  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 		 322 aa  661    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0984  homocysteine S-methyltransferase  66.98 
 
 		 315 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5017  homocysteine S-methyltransferase  57.37 
 
 		 312 aa  359  4e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2696  homocysteine S-methyltransferase  54.95 
 
 		 328 aa  358  9e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274652 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0064  homocysteine S-methyltransferase  54.63 
 
 		 328 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0089  homocysteine S-methyltransferase  54.17 
 
 		 312 aa  345  7e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.898737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3671  homocysteine S-methyltransferase  52.85 
 
 		 316 aa  341  9e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1107  homocysteine S-methyltransferase  53.65 
 
 		 313 aa  339  4e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0120891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0624  homocysteine S-methyltransferase  54.49 
 
 		 312 aa  333  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0417  homocysteine S-methyltransferase  51.94 
 
 		 314 aa  317  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0769316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2467  homocysteine S-methyltransferase  51.01 
 
 		 330 aa  305  8.000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6335  homocysteine S-methyltransferase  49.83 
 
 		 307 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0740  homocysteine S-methyltransferase  45.79 
 
 		 311 aa  260  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1304  homocysteine S-methyltransferase  44.03 
 
 		 311 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.652458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1943  putative homocysteine/selenocysteine methylase  37.67 
 
 		 319 aa  199  5e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3324  homocysteine S-methyltransferase  36.2 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1327  homocysteine S-methyltransferase domain-containing protein  35.46 
 
 		 318 aa  144  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5337  homocysteine S-methyltransferase  33.44 
 
 		 319 aa  133  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0073  homocysteine S-methyltransferase  25.98 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4282  homocysteine S-methyltransferase  26.64 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  26.73 
 
 		 791 aa  56.2  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4837  homocysteine S-methyltransferase  27.52 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.345042 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0324  homocysteine S-methyltransferase  26.95 
 
 		 413 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  23.05 
 
 		 1191 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1277  homocysteine S-methyltransferase  30.24 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0441893 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3100  homocysteine S-methyltransferase  30.39 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3243  homocysteine S-methyltransferase  30.39 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.562987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3090  homocysteine S-methyltransferase  30.39 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1583  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  28.04 
 
 		 637 aa  50.8  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  23.39 
 
 		 617 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0325  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  22.87 
 
 		 605 aa  49.7  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  23.53 
 
 		 1208 aa  49.3  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6804  homocysteine S-methyltransferase  25.34 
 
 		 313 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4224  B12-dependent methionine synthase  28.31 
 
 		 1293 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572954  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  26.97 
 
 		 325 aa  49.3  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  27.09 
 
 		 807 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  25.56 
 
 		 1227 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2732  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  24.44 
 
 		 1239 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0346659  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  26.52 
 
 		 793 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2547  methionine synthase I  26.8 
 
 		 340 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.946299 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  26.11 
 
 		 1239 aa  47  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0839  homocysteine S-methyltransferase  26.18 
 
 		 285 aa  47  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  27.81 
 
 		 818 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3952  methionine synthase I  25.71 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2200  homocysteine S-methyltransferase  23.57 
 
 		 307 aa  47  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558388  normal  0.514236 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2464  B12-dependent methionine synthase  24.44 
 
 		 1239 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.782684  normal  0.0191622 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01233  methionine synthase  27.91 
 
 		 379 aa  46.6  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0459633  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3690  B12-dependent methionine synthase  25.77 
 
 		 1220 aa  46.6  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  23.87 
 
 		 774 aa  46.2  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  22.75 
 
 		 1224 aa  46.2  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2010  B12-dependent methionine synthase  22.63 
 
 		 1233 aa  46.2  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  23.89 
 
 		 819 aa  46.2  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2400  methionine synthase (B12-dependent)  24.85 
 
 		 353 aa  46.2  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.434892  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0035  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  23.57 
 
 		 612 aa  45.8  0.0009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2463  B12-dependent methionine synthase  24.44 
 
 		 1240 aa  45.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0628  homocysteine methyltransferase  24.45 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  25.85 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3107  B12-dependent methionine synthase  24.89 
 
 		 1236 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  22.41 
 
 		 1191 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  28.38 
 
 		 800 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0405  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  21.79 
 
 		 613 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  22.41 
 
 		 1191 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0045  B12-dependent methionine synthase  25.78 
 
 		 1267 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0415  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  21.79 
 
 		 613 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  24.53 
 
 		 1228 aa  43.9  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  27.03 
 
 		 1236 aa  43.9  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  25.42 
 
 		 1250 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1598  homocysteine S-methyltransferase  27.41 
 
 		 297 aa  43.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1042  homocysteine methyltransferase  22.4 
 
 		 310 aa  43.1  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000341653  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1692  B12-dependent methionine synthase  24.82 
 
 		 1224 aa  43.1  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  24.64 
 
 		 1158 aa  42.7  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1982  B12-dependent methionine synthase  25.23 
 
 		 1235 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0368395  normal  0.238169 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  24.6 
 
 		 841 aa  42.7  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  21.43 
 
 		 1182 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  23.97 
 
 		 1225 aa  42.7  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0866  homocysteine methyltransferase  25.86 
 
 		 316 aa  42.7  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.142005  normal  0.135969 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  25.77 
 
 		 313 aa  42.4  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1764  B12-dependent methionine synthase  29.05 
 
 		 1304 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.075059  normal  0.0106397 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>