69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1107 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1107  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 		 313 aa  647    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0120891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2696  homocysteine S-methyltransferase  61.54 
 
 		 328 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274652 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0064  homocysteine S-methyltransferase  61.09 
 
 		 328 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0624  homocysteine S-methyltransferase  57.96 
 
 		 312 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0984  homocysteine S-methyltransferase  56.83 
 
 		 315 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2467  homocysteine S-methyltransferase  58.17 
 
 		 330 aa  361  7.0000000000000005e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0417  homocysteine S-methyltransferase  54.95 
 
 		 314 aa  349  3e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0769316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3671  homocysteine S-methyltransferase  55.45 
 
 		 316 aa  348  9e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0597  homocysteine S-methyltransferase  53.65 
 
 		 322 aa  339  4e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0089  homocysteine S-methyltransferase  52.56 
 
 		 312 aa  335  5e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.898737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5017  homocysteine S-methyltransferase  51.6 
 
 		 312 aa  323  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0740  homocysteine S-methyltransferase  50.85 
 
 		 311 aa  278  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6335  homocysteine S-methyltransferase  47.1 
 
 		 307 aa  267  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1304  homocysteine S-methyltransferase  46.13 
 
 		 311 aa  259  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.652458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1943  putative homocysteine/selenocysteine methylase  40.75 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3324  homocysteine S-methyltransferase  35.25 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1327  homocysteine S-methyltransferase domain-containing protein  33.92 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5337  homocysteine S-methyltransferase  31.68 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2200  homocysteine S-methyltransferase  25.6 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558388  normal  0.514236 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  28.51 
 
 		 1136 aa  56.6  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  27.48 
 
 		 1136 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0073  homocysteine S-methyltransferase  27.59 
 
 		 290 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2815  homocysteine S-methyltransferase  29.29 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  26.16 
 
 		 791 aa  53.9  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1771  methionine synthase I  27.6 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  normal  0.0676063 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.53 
 
 		 1208 aa  49.7  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0149  homocysteine S-methyltransferase  26.99 
 
 		 346 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.637039 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3243  homocysteine S-methyltransferase  27.98 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.562987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3090  homocysteine S-methyltransferase  28.31 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  26.01 
 
 		 1178 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3100  homocysteine S-methyltransferase  27.98 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  24.13 
 
 		 1208 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  22.3 
 
 		 617 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  24.56 
 
 		 1183 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0324  homocysteine S-methyltransferase  23.92 
 
 		 413 aa  47.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1277  homocysteine S-methyltransferase  27.38 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0441893 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0295  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  26.55 
 
 		 346 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0156  homocysteine S-methyltransferase  26.55 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3865  homocysteine S-methyltransferase  30.36 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  23.08 
 
 		 1224 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1598  homocysteine S-methyltransferase  29.06 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  25.78 
 
 		 1190 aa  46.6  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  26.27 
 
 		 1223 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3928  homocysteine S-methyltransferase  28.57 
 
 		 308 aa  46.2  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.45742 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4837  homocysteine S-methyltransferase  28.7 
 
 		 309 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.345042 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  27.6 
 
 		 1158 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2547  methionine synthase I  27.88 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.946299 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.43 
 
 		 1132 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  25.36 
 
 		 1226 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  27.54 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  22.94 
 
 		 1191 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  25 
 
 		 1191 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  24.52 
 
 		 1212 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  25 
 
 		 1191 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  25.13 
 
 		 1132 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.43 
 
 		 1132 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  24.02 
 
 		 1182 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  24.89 
 
 		 1150 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  27.84 
 
 		 1132 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  25.46 
 
 		 1236 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  25.13 
 
 		 1132 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  26.41 
 
 		 1178 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  23.15 
 
 		 1188 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6804  homocysteine S-methyltransferase  27.19 
 
 		 313 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0191  homocysteine S-methyltransferase  25.11 
 
 		 356 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4282  homocysteine S-methyltransferase  27.52 
 
 		 309 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  25.63 
 
 		 1132 aa  42.7  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  25.97 
 
 		 1176 aa  42.7  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  23.81 
 
 		 1187 aa  42.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>