76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3671 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3671  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 
316 aa  640    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0624  homocysteine S-methyltransferase  57.56 
 
 
312 aa  364  1e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1107  homocysteine S-methyltransferase  55.45 
 
 
313 aa  348  9e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0120891  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0984  homocysteine S-methyltransferase  53.16 
 
 
315 aa  345  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0597  homocysteine S-methyltransferase  52.85 
 
 
322 aa  341  9e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2696  homocysteine S-methyltransferase  52.88 
 
 
328 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274652 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0089  homocysteine S-methyltransferase  53.21 
 
 
312 aa  335  5e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.898737  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0064  homocysteine S-methyltransferase  52.73 
 
 
328 aa  335  5e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0417  homocysteine S-methyltransferase  51.6 
 
 
314 aa  328  7e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0769316  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5017  homocysteine S-methyltransferase  50.64 
 
 
312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2467  homocysteine S-methyltransferase  48.21 
 
 
330 aa  291  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1304  homocysteine S-methyltransferase  50 
 
 
311 aa  278  8e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.652458  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0740  homocysteine S-methyltransferase  49.13 
 
 
311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6335  homocysteine S-methyltransferase  45.02 
 
 
307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1943  putative homocysteine/selenocysteine methylase  41.5 
 
 
319 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3324  homocysteine S-methyltransferase  36.04 
 
 
319 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1327  homocysteine S-methyltransferase domain-containing protein  35.69 
 
 
318 aa  146  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5337  homocysteine S-methyltransferase  33.77 
 
 
319 aa  139  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.27 
 
 
617 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0238  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  27.18 
 
 
609 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  25.3 
 
 
841 aa  60.5  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  25.65 
 
 
791 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  28.35 
 
 
319 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4784  homocysteine S-methyltransferase  24.62 
 
 
643 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0073  homocysteine S-methyltransferase  27.94 
 
 
290 aa  57.4  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  27.88 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  24.07 
 
 
819 aa  53.9  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1598  homocysteine S-methyltransferase  31.58 
 
 
297 aa  53.5  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  28.51 
 
 
839 aa  52.8  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  27.71 
 
 
288 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2974  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  28.23 
 
 
605 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2200  homocysteine S-methyltransferase  28.21 
 
 
307 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558388  normal  0.514236 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  28.57 
 
 
816 aa  50.8  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  24.69 
 
 
781 aa  49.7  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0839  homocysteine S-methyltransferase  28.16 
 
 
285 aa  49.7  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  29.02 
 
 
800 aa  49.7  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  23.5 
 
 
774 aa  49.3  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5017  S-methyltransferase  30.54 
 
 
301 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3471  homocysteine methyltransferase  25.74 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  26.91 
 
 
313 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  26.77 
 
 
801 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1524  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  27.69 
 
 
615 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0324  homocysteine S-methyltransferase  23.91 
 
 
413 aa  47.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4282  homocysteine S-methyltransferase  28.57 
 
 
309 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1583  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  27.88 
 
 
637 aa  47.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1277  homocysteine S-methyltransferase  31.29 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0441893 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  27.88 
 
 
813 aa  47.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4837  homocysteine S-methyltransferase  29.11 
 
 
309 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.345042 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  29.69 
 
 
841 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  27.52 
 
 
811 aa  46.6  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3090  homocysteine S-methyltransferase  30.67 
 
 
300 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  24.89 
 
 
804 aa  47  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  24.17 
 
 
807 aa  46.6  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  27.98 
 
 
820 aa  46.6  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3100  homocysteine S-methyltransferase  30.67 
 
 
300 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0504  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.79 
 
 
605 aa  46.2  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120544  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3243  homocysteine S-methyltransferase  30.06 
 
 
300 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.562987  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0658  homocysteine S-methyltransferase family protein  29.05 
 
 
311 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3865  homocysteine S-methyltransferase  29.47 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0613  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  28.44 
 
 
610 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  22.9 
 
 
793 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  25.71 
 
 
1180 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0708  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.92 
 
 
616 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0266464  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6804  homocysteine S-methyltransferase  28.84 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0405  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  24.55 
 
 
613 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0415  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  24.55 
 
 
613 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  26.7 
 
 
801 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3952  methionine synthase I  26.57 
 
 
319 aa  43.9  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225692  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  24.02 
 
 
1188 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  26.94 
 
 
802 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2255  homocysteine S-methyltransferase  27.84 
 
 
350 aa  43.1  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2048  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  22.65 
 
 
614 aa  43.1  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  24.02 
 
 
1187 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2547  methionine synthase I  26.67 
 
 
340 aa  43.1  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.946299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0692  homocysteine S-methyltransferase  28.63 
 
 
311 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0245772 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  29.17 
 
 
1223 aa  42.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>