48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1943 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1943  putative homocysteine/selenocysteine methylase  100 
 
 		 319 aa  656    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0064  homocysteine S-methyltransferase  41.75 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2696  homocysteine S-methyltransferase  41.75 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274652 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0984  homocysteine S-methyltransferase  43 
 
 		 315 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0417  homocysteine S-methyltransferase  40 
 
 		 314 aa  238  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0769316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1107  homocysteine S-methyltransferase  40.75 
 
 		 313 aa  236  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0120891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3671  homocysteine S-methyltransferase  41.5 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0624  homocysteine S-methyltransferase  38.78 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2467  homocysteine S-methyltransferase  38.1 
 
 		 330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0089  homocysteine S-methyltransferase  38.61 
 
 		 312 aa  215  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.898737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0597  homocysteine S-methyltransferase  37.67 
 
 		 322 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0740  homocysteine S-methyltransferase  36.79 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5017  homocysteine S-methyltransferase  35.27 
 
 		 312 aa  196  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1304  homocysteine S-methyltransferase  36.77 
 
 		 311 aa  192  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.652458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6335  homocysteine S-methyltransferase  33.11 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5337  homocysteine S-methyltransferase  33.66 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1327  homocysteine S-methyltransferase domain-containing protein  33 
 
 		 318 aa  126  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3324  homocysteine S-methyltransferase  29.55 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2547  methionine synthase I  29.95 
 
 		 340 aa  65.9  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.946299 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  27.8 
 
 		 804 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  29.49 
 
 		 800 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  27.23 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1468  methionine synthase I  27.72 
 
 		 340 aa  53.9  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.799153  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  24.62 
 
 		 617 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  26.38 
 
 		 319 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  24.23 
 
 		 1228 aa  50.4  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1598  homocysteine S-methyltransferase  26.7 
 
 		 297 aa  50.4  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0324  homocysteine S-methyltransferase  24.47 
 
 		 413 aa  49.3  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1268  homocysteine S-methyltransferase  22.87 
 
 		 320 aa  48.5  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.897971 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2200  homocysteine S-methyltransferase  23.7 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558388  normal  0.514236 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3207  methionine synthase (B12-dependent)  23.39 
 
 		 358 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0036  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  25.9 
 
 		 355 aa  47.4  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.20807 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4534  homocysteine S-methyltransferase  24.54 
 
 		 302 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0770365 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0073  homocysteine S-methyltransferase  24.31 
 
 		 290 aa  46.6  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0415  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  23.7 
 
 		 613 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12483  homocysteine methyltransferase  24.3 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0595  B12-dependent methionine synthase  24.57 
 
 		 1272 aa  45.8  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0405  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  23.7 
 
 		 613 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0709  methionine synthase I  25 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6392  homocysteine S-methyltransferase  23.08 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.612657 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0388  homocysteine S-methyltransferase  24.26 
 
 		 367 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0207088 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  23.38 
 
 		 781 aa  43.5  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2169  methionine synthase  23.4 
 
 		 1245 aa  43.1  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.205577  normal  0.226732 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2010  B12-dependent methionine synthase  23.71 
 
 		 1233 aa  43.1  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  25.08 
 
 		 1184 aa  43.1  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0035  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  22.86 
 
 		 612 aa  42.7  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0799  methionine synthase I  24.81 
 
 		 335 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2124  methionine synthase I  24.81 
 
 		 335 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>