39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0740 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0740  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 
311 aa  640    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1304  homocysteine S-methyltransferase  48.34 
 
 
311 aa  300  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.652458  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0624  homocysteine S-methyltransferase  47.81 
 
 
312 aa  285  5.999999999999999e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2467  homocysteine S-methyltransferase  46.47 
 
 
330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1107  homocysteine S-methyltransferase  50.85 
 
 
313 aa  278  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0120891  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3671  homocysteine S-methyltransferase  49.13 
 
 
316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0064  homocysteine S-methyltransferase  45.85 
 
 
328 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0984  homocysteine S-methyltransferase  48.3 
 
 
315 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2696  homocysteine S-methyltransferase  45.67 
 
 
328 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274652 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0089  homocysteine S-methyltransferase  47.77 
 
 
312 aa  262  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.898737  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0597  homocysteine S-methyltransferase  45.79 
 
 
322 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5017  homocysteine S-methyltransferase  46.9 
 
 
312 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0417  homocysteine S-methyltransferase  43.79 
 
 
314 aa  252  7e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0769316  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6335  homocysteine S-methyltransferase  40.07 
 
 
307 aa  229  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1943  putative homocysteine/selenocysteine methylase  36.79 
 
 
319 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1327  homocysteine S-methyltransferase domain-containing protein  33.81 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3324  homocysteine S-methyltransferase  31.58 
 
 
319 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5337  homocysteine S-methyltransferase  27.18 
 
 
319 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0073  homocysteine S-methyltransferase  24.81 
 
 
290 aa  60.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0324  homocysteine S-methyltransferase  25.77 
 
 
413 aa  56.2  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  28.57 
 
 
841 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  27.13 
 
 
839 aa  52.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  26.56 
 
 
807 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  27.04 
 
 
800 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1268  homocysteine S-methyltransferase  19.92 
 
 
320 aa  48.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.897971 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1524  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  27.05 
 
 
615 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0112  B12-dependent methionine synthase  26.53 
 
 
1259 aa  47  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.937971  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2137  methionine synthase  28.19 
 
 
1245 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.39755 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2200  homocysteine S-methyltransferase  29.34 
 
 
307 aa  46.6  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558388  normal  0.514236 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  24.9 
 
 
819 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  22.37 
 
 
617 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  23.31 
 
 
804 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0415  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  21.25 
 
 
613 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0405  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  21.25 
 
 
613 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  28.21 
 
 
1136 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2815  homocysteine S-methyltransferase  35.96 
 
 
304 aa  43.1  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3952  methionine synthase I  27.73 
 
 
319 aa  42.7  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225692  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  25.59 
 
 
1136 aa  42.7  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  27.43 
 
 
804 aa  42.7  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>