More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4744 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4744  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 277 aa  556  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3494  translation elongation factor Ts  70.76 
 
 		 278 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000803049  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3036  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  67.52 
 
 		 278 aa  374  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00138132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  59.27 
 
 		 279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0049  translation elongation factor Ts  55.56 
 
 		 277 aa  299  3e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0883  translation elongation factor Ts  52.35 
 
 		 275 aa  271  8.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0378  elongation factor Ts  48.55 
 
 		 274 aa  256  3e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  44.09 
 
 		 276 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  44.29 
 
 		 278 aa  202  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  41.49 
 
 		 273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  42.61 
 
 		 288 aa  199  6e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  42.86 
 
 		 278 aa  198  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12260  translation elongation factor Ts  42.86 
 
 		 288 aa  198  7e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000728312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  38.38 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  41.99 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0724  translation elongation factor Ts  40.87 
 
 		 320 aa  195  7e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  42.07 
 
 		 312 aa  195  7e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  37.32 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  43.84 
 
 		 291 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  39.21 
 
 		 294 aa  192  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  41.13 
 
 		 277 aa  192  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  40.86 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  41.94 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  40.78 
 
 		 296 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  41.79 
 
 		 278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  41.84 
 
 		 303 aa  188  7e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  43.12 
 
 		 290 aa  187  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  40.56 
 
 		 311 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  41.49 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04070  elongation factor Ts  39.08 
 
 		 321 aa  186  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  41.43 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  38.99 
 
 		 289 aa  186  4e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2352  elongation factor Ts  37.68 
 
 		 288 aa  185  7e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000872397  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1647  elongation factor Ts  38.81 
 
 		 288 aa  185  8e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  42.86 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  41.43 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  42.5 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  39.57 
 
 		 291 aa  183  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0404  elongation factor Ts  38.38 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  40.71 
 
 		 295 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  40.71 
 
 		 295 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  39.1 
 
 		 287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  40.71 
 
 		 295 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  40.71 
 
 		 295 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  40.71 
 
 		 295 aa  182  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  40.71 
 
 		 295 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  40.71 
 
 		 295 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  38.54 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  40.71 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  42.2 
 
 		 272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  38.35 
 
 		 292 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1368  elongation factor Ts  40.86 
 
 		 278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0623033  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  40.71 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2177  elongation factor Ts  45.88 
 
 		 298 aa  179  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00688857  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2009  elongation factor Ts  36.97 
 
 		 288 aa  178  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1743  elongation factor Ts  44.64 
 
 		 299 aa  178  9e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  37.59 
 
 		 294 aa  178  9e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  40 
 
 		 295 aa  178  9e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  40.21 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  38.55 
 
 		 292 aa  177  1e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5910  translation elongation factor Ts  42.18 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0273949  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1104  translation elongation factor Ts  42.11 
 
 		 286 aa  177  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  38.31 
 
 		 312 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  37.32 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  37.37 
 
 		 277 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  42.53 
 
 		 293 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1385  elongation factor Ts  40.5 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000279942 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  40 
 
 		 295 aa  175  8e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06750  elongation factor Ts  40.86 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00748724  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  37.37 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0673  translation elongation factor Ts  39.45 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  41.18 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  38.57 
 
 		 294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  38.52 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  38.91 
 
 		 285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  40.53 
 
 		 293 aa  172  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  41 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  41 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  41 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  38.13 
 
 		 271 aa  172  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  38.3 
 
 		 291 aa  172  5.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  41 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  41 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  41 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  41 
 
 		 294 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23600  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  40.93 
 
 		 279 aa  172  6.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.13025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  39.85 
 
 		 308 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  38.62 
 
 		 286 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11200  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  38.65 
 
 		 282 aa  171  9e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  41.76 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  38.11 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  39.86 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  41.33 
 
 		 292 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  37.09 
 
 		 292 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1609  translation elongation factor Ts  35.98 
 
 		 320 aa  170  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00132099  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  36.33 
 
 		 307 aa  170  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0508  elongation factor Ts  42.86 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0459419  normal  0.717587 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  38.18 
 
 		 292 aa  169  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  40.44 
 
 		 292 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  37.5 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>