More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0199 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 237 aa  492  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.68 
 
 		 239 aa  194  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.26 
 
 		 238 aa  189  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.31 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.68 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 		 233 aa  186  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.92 
 
 		 229 aa  174  8e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.78 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.83 
 
 		 229 aa  171  9e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.67 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.95 
 
 		 241 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 		 239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497428  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 		 265 aa  149  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.729821 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.28 
 
 		 241 aa  148  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 272 aa  148  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2801  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 		 248 aa  148  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0814  putative short-chain dehydrogenase/reductase  38.31 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.968056 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  44.72 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01679  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase  35.29 
 
 		 242 aa  142  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.52 
 
 		 236 aa  141  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5116  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 		 246 aa  140  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0163958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7619  short chain oxidoreductase  37.8 
 
 		 244 aa  138  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493234  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 		 232 aa  138  6e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 		 246 aa  135  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 		 244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120829  normal  0.282186 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 		 245 aa  132  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0227742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 		 249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.56 
 
 		 231 aa  128  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 246 aa  126  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 		 257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2677  putative short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  34.55 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334903  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1616  short chain dehydrogenase  37.62 
 
 		 236 aa  125  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1818  short chain dehydrogenase  37.62 
 
 		 236 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.93 
 
 		 245 aa  125  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1782  short chain dehydrogenase  36.59 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.95 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  normal  0.454063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 		 250 aa  122  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  decreased coverage  0.000126478 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3562  short chain dehydrogenase  32.51 
 
 		 236 aa  122  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0396  carbonyl reductase  34.7 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 		 235 aa  115  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02369  short chain dehydrogenase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G15350)  35.83 
 
 		 309 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.406317 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02810  hypothetical protein  33.47 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1084  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.604748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 		 236 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0167749  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3321  hypothetical protein  31.8 
 
 		 258 aa  108  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 		 247 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0807  hypothetical protein  32.64 
 
 		 247 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.540927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.45 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1561  short chain dehydrogenase  35.08 
 
 		 516 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.636243  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.139748 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.110275 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0345  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.89 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1614  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.98 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0547221  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1474  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  31.88 
 
 		 246 aa  105  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.45819  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1834  short chain dehydrogenase  33.51 
 
 		 269 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.674997  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.03 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.97281  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.89 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  35.96 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_004310  BR1338  short chain dehydrogenase  34.55 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.16343  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1298  short chain dehydrogenase  34.55 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2004  short chain dehydrogenase  33.61 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.108608  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.02 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.138611  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02734  predicted NAD(P)-binding oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  31.8 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707447  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3229  hypothetical protein  31.8 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02697  hypothetical protein  31.8 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23650  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0188614 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3061  hypothetical protein  31.8 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3323  hypothetical protein  31.8 
 
 		 247 aa  102  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.640458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>