More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35820 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 134 aa  264  4e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  60.63 
 
 		 133 aa  151  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  54.31 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  54.31 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  54.31 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  53.51 
 
 		 136 aa  114  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  54.31 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0525  putative transcriptional regulator, MerR family  50.88 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178502 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  49.58 
 
 		 137 aa  105  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3239  transcriptional regulator, MerR family  45.76 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000227315  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 147 aa  103  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  50.41 
 
 		 133 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 165 aa  102  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 133 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  49.17 
 
 		 186 aa  100  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  48.03 
 
 		 154 aa  98.2  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  48.28 
 
 		 131 aa  97.8  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  46.03 
 
 		 141 aa  97.4  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2779  MerR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  38.14 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  48.84 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  47.13 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  43.18 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 253 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  47.67 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4918  MerR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502538 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  50.75 
 
 		 251 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0035  transcriptional regulator, MerR family  56.92 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.987448  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 254 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 254 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 254 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 253 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  48.57 
 
 		 253 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0017  MerR family transcriptional regulator  56.92 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.801756 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  48.57 
 
 		 253 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 251 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  40.59 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  48.48 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  48.57 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  45.79 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 252 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  45.59 
 
 		 334 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  43.68 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  43.68 
 
 		 173 aa  72  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  44.83 
 
 		 259 aa  72  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  43.18 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  35.4 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0032  MerR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  45.59 
 
 		 336 aa  71.2  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  40.23 
 
 		 347 aa  70.9  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 336 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 342 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  45.59 
 
 		 354 aa  70.5  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 254 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  34.48 
 
 		 132 aa  70.1  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  33.61 
 
 		 133 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  40.51 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0987  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.758767  hitchhiker  0.000750648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  47.06 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0393  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.24 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.493726  hitchhiker  2.73635e-17 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0448  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.24 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.17179e-17 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0388  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.24 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 639 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  33.64 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 648 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1555  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.949248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  48 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0407  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.24 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267625 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  40.62 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0385  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.24 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000075209 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  48.53 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  35.51 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  37.25 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  40.51 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 342 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2318  MerR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  35.4 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>