56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0934 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0934  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 304 aa  621  1e-177  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000927672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1012  TPR repeat-containing protein  73.9 
 
 		 308 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.47501  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1081  TPR repeat-containing protein  80 
 
 		 308 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1114  TPR repeat-containing protein  80 
 
 		 308 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918708 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3277  TPR repeat-containing protein  80 
 
 		 308 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.114437 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06554  hypothetical protein  69.02 
 
 		 282 aa  372  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1040  membrane protein  66.16 
 
 		 282 aa  368  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000673  TPR repeat containing protein  67.59 
 
 		 281 aa  358  5e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0271673  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3334  TPR repeat-containing protein  45.08 
 
 		 297 aa  229  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0522  TPR repeat-containing protein  41.77 
 
 		 290 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.598532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1193  hypothetical protein  40.2 
 
 		 305 aa  206  5e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.65343 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0614  hypothetical protein  39.42 
 
 		 151 aa  87.4  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.81 
 
 		 736 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1876  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 123 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1850  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 123 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 927 aa  56.2  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.52 
 
 		 836 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 3560 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1852  protein of unknown function DUF86  27.91 
 
 		 208 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1878  protein of unknown function DUF86  27.91 
 
 		 208 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 250 aa  48.9  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 662 aa  48.5  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 699 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0681  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 375 aa  47.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  32.1 
 
 		 442 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.87 
 
 		 738 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 602 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.29 
 
 		 634 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 270 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  26.53 
 
 		 539 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 716 aa  46.2  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 1056 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 270 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1564  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 199 aa  45.8  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 523 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.92 
 
 		 1979 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.41 
 
 		 818 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.67 
 
 		 1838 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.4844  normal  0.543205 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1169  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  28.7 
 
 		 619 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  22.75 
 
 		 1007 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 392 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 547 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.75 
 
 		 1022 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.03 
 
 		 622 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0416  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  25.23 
 
 		 541 aa  43.5  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1138 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 1276 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.41 
 
 		 784 aa  43.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.42 
 
 		 296 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  28.57 
 
 		 306 aa  42.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.4 
 
 		 778 aa  42.7  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.48 
 
 		 1694 aa  42.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  21.55 
 
 		 269 aa  42.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 291 aa  42.4  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 4079 aa  42.4  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>