246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0375 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 		 174 aa  356  9.999999999999999e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0531  ATP-dependent protease peptidase subunit  94.25 
 
 		 174 aa  339  9e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00786303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4429  ATP-dependent protease peptidase subunit  93.68 
 
 		 174 aa  338  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  94.25 
 
 		 174 aa  336  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  93.68 
 
 		 174 aa  334  2.9999999999999997e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  88.51 
 
 		 174 aa  324  4.0000000000000003e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4162  ATP-dependent protease peptidase subunit  90.23 
 
 		 174 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3521  ATP-dependent protease peptidase subunit  90.23 
 
 		 174 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0434  ATP-dependent protease peptidase subunit  90.23 
 
 		 174 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3699  ATP-dependent protease peptidase subunit  90.23 
 
 		 174 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.085186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0447  ATP-dependent protease peptidase subunit  89.66 
 
 		 174 aa  309  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0529  ATP-dependent protease peptidase subunit  89.66 
 
 		 174 aa  309  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0463  ATP-dependent protease peptidase subunit  89.66 
 
 		 174 aa  309  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0473  ATP-dependent protease peptidase subunit  89.66 
 
 		 174 aa  309  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3867  ATP-dependent protease peptidase subunit  89.66 
 
 		 174 aa  309  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3361  ATP-dependent protease peptidase subunit  88.51 
 
 		 174 aa  309  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  87.21 
 
 		 172 aa  306  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03517  ATP-dependent protease peptidase subunit  83.91 
 
 		 174 aa  305  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839153  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  85.47 
 
 		 185 aa  303  7e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  84.48 
 
 		 174 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03817  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.18 
 
 		 176 aa  298  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4053  20S proteasome A and B subunits  82.18 
 
 		 176 aa  298  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5389  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.18 
 
 		 176 aa  298  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4086  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.18 
 
 		 176 aa  298  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4468  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.18 
 
 		 176 aa  298  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03766  hypothetical protein  82.18 
 
 		 176 aa  298  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4414  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.18 
 
 		 176 aa  298  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0890704  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4374  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.18 
 
 		 176 aa  298  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4164  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.18 
 
 		 176 aa  298  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.08 
 
 		 176 aa  296  9e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0166  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.98 
 
 		 176 aa  295  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.46 
 
 		 174 aa  295  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.46 
 
 		 174 aa  295  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00724  ATP-dependent protease peptidase subunit  87.79 
 
 		 183 aa  295  3e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.46 
 
 		 174 aa  295  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0114  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.4 
 
 		 176 aa  294  5e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0180  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.98 
 
 		 176 aa  293  6e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3797  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.81 
 
 		 176 aa  292  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4338  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.98 
 
 		 176 aa  293  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.4 
 
 		 182 aa  293  1e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4424  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.98 
 
 		 176 aa  293  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4792  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.81 
 
 		 176 aa  293  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4308  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.98 
 
 		 176 aa  293  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4492  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.98 
 
 		 176 aa  293  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4422  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.98 
 
 		 176 aa  293  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.81 
 
 		 182 aa  292  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.07 
 
 		 176 aa  280  8.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.88 
 
 		 179 aa  278  4e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0004  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.59 
 
 		 184 aa  278  4e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.46 
 
 		 176 aa  277  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  78.16 
 
 		 175 aa  276  9e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.58 
 
 		 183 aa  273  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.58 
 
 		 204 aa  272  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  75 
 
 		 181 aa  270  1e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.42 
 
 		 172 aa  268  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.42 
 
 		 179 aa  268  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.85 
 
 		 177 aa  268  4e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.85 
 
 		 187 aa  266  8.999999999999999e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.43 
 
 		 181 aa  258  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.35 
 
 		 183 aa  258  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  70.35 
 
 		 180 aa  258  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0167  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.88 
 
 		 180 aa  258  3e-68  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5000  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.61 
 
 		 176 aa  257  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4874  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.61 
 
 		 176 aa  257  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5050  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.61 
 
 		 176 aa  257  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5140  heat shock protein HslV  78.36 
 
 		 176 aa  256  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0395  ATP-dependent protease peptidase subunit  78.36 
 
 		 176 aa  256  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66770  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.56 
 
 		 177 aa  255  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5790  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.99 
 
 		 182 aa  254  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.35 
 
 		 188 aa  254  4e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.57 
 
 		 181 aa  254  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2545  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.01 
 
 		 196 aa  254  5e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.01 
 
 		 178 aa  253  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.44 
 
 		 178 aa  252  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.84 
 
 		 184 aa  252  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45380  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.57 
 
 		 180 aa  251  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479981  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.61 
 
 		 194 aa  249  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0464  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.27 
 
 		 176 aa  249  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.28 
 
 		 183 aa  248  4e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  68 
 
 		 193 aa  247  6e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.43 
 
 		 181 aa  246  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0397  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.85 
 
 		 192 aa  244  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.848683 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3436  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.71 
 
 		 182 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.834588  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001748  ATP-dependent protease HslV  84.93 
 
 		 156 aa  242  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.906406  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.01 
 
 		 178 aa  240  7.999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3837  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.02 
 
 		 178 aa  237  5.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.552553 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0165  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.84 
 
 		 214 aa  235  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.183873  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2477  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.25 
 
 		 178 aa  233  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3091  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.25 
 
 		 178 aa  233  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3108  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.25 
 
 		 178 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.192963 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2740  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.47 
 
 		 176 aa  232  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3254  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 178 aa  232  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0386  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 178 aa  232  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2916  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 178 aa  232  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0771725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2173  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 178 aa  232  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0191  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 178 aa  232  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.834819  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0201  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 178 aa  232  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3432  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 178 aa  232  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1210  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 		 178 aa  231  4.0000000000000004e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4559  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.43 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>