247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_66770 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_66770  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 
177 aa  357  5e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5790  ATP-dependent protease peptidase subunit  99.44 
 
 
182 aa  355  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  89.2 
 
 
176 aa  307  6.999999999999999e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45380  ATP-dependent protease peptidase subunit  93.1 
 
 
180 aa  306  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479981  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5000  ATP-dependent protease peptidase subunit  90.34 
 
 
176 aa  301  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4874  ATP-dependent protease peptidase subunit  90.34 
 
 
176 aa  301  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5050  ATP-dependent protease peptidase subunit  90.34 
 
 
176 aa  301  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0464  ATP-dependent protease peptidase subunit  87.5 
 
 
176 aa  292  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.958298  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5140  heat shock protein HslV  88.07 
 
 
176 aa  290  8e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0395  ATP-dependent protease peptidase subunit  88.07 
 
 
176 aa  290  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0397  ATP-dependent protease peptidase subunit  86.36 
 
 
192 aa  278  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.848683 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.77 
 
 
176 aa  278  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.88 
 
 
172 aa  276  8e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.01 
 
 
185 aa  273  7e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.44 
 
 
174 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  78.03 
 
 
174 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.29 
 
 
174 aa  270  5.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.3 
 
 
174 aa  270  9e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.14 
 
 
204 aa  268  4e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.41 
 
 
183 aa  267  7e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.16 
 
 
177 aa  267  7e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3797  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.43 
 
 
176 aa  266  8e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4429  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.29 
 
 
174 aa  266  8e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03517  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.71 
 
 
174 aa  266  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839153  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0531  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.71 
 
 
174 aa  265  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00786303  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0114  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.86 
 
 
176 aa  266  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.44 
 
 
174 aa  265  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.56 
 
 
181 aa  265  2e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4792  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.14 
 
 
176 aa  265  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.14 
 
 
182 aa  265  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.86 
 
 
176 aa  265  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03817  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.72 
 
 
176 aa  264  5e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4053  20S proteasome A and B subunits  75.72 
 
 
176 aa  264  5e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4086  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.72 
 
 
176 aa  264  5e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03766  hypothetical protein  75.72 
 
 
176 aa  264  5e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4164  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.72 
 
 
176 aa  264  5e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0166  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.29 
 
 
176 aa  264  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  75 
 
 
179 aa  264  5e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4414  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.72 
 
 
176 aa  264  5e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0890704  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4374  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.72 
 
 
176 aa  264  5e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5389  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.72 
 
 
176 aa  264  5e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4468  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.72 
 
 
176 aa  264  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.56 
 
 
187 aa  264  5.999999999999999e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.56 
 
 
182 aa  264  5.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.99 
 
 
172 aa  263  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4422  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.14 
 
 
176 aa  262  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4492  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.14 
 
 
176 aa  262  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4338  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.14 
 
 
176 aa  262  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4308  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.14 
 
 
176 aa  262  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4424  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.14 
 
 
176 aa  262  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00724  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.27 
 
 
183 aa  261  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  70.69 
 
 
180 aa  261  4e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0180  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.71 
 
 
176 aa  261  4.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4162  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.31 
 
 
174 aa  259  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3521  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.31 
 
 
174 aa  259  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0434  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.31 
 
 
174 aa  259  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3699  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.31 
 
 
174 aa  259  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.085186  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.41 
 
 
174 aa  259  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.41 
 
 
174 aa  259  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.41 
 
 
174 aa  259  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0447  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.44 
 
 
174 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0529  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.44 
 
 
174 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3361  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.59 
 
 
174 aa  257  7e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.51 
 
 
179 aa  256  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0463  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.59 
 
 
174 aa  254  5e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0004  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.41 
 
 
184 aa  254  5e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3867  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.59 
 
 
174 aa  254  5e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0473  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.59 
 
 
174 aa  254  5e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.41 
 
 
175 aa  253  1.0000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.19 
 
 
183 aa  251  3e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.47 
 
 
178 aa  248  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.32 
 
 
181 aa  246  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.63 
 
 
178 aa  246  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.61 
 
 
181 aa  244  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.23 
 
 
194 aa  242  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.28 
 
 
184 aa  241  3e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1323  20S proteasome A and B subunits  71.26 
 
 
179 aa  239  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.6 
 
 
178 aa  239  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.58 
 
 
183 aa  238  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3837  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.94 
 
 
178 aa  238  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.552553 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.86 
 
 
188 aa  238  5e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.05 
 
 
193 aa  237  5.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.48 
 
 
181 aa  236  9e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3436  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.32 
 
 
182 aa  236  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.834588  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3982  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.09 
 
 
175 aa  234  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0167  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.89 
 
 
180 aa  234  4e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2545  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.9 
 
 
196 aa  234  6e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.53 
 
 
184 aa  230  9e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3264  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.94 
 
 
185 aa  228  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.64 
 
 
184 aa  229  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.22 
 
 
182 aa  228  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1210  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.3 
 
 
178 aa  227  5e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.07 
 
 
184 aa  227  6e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.53 
 
 
187 aa  226  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4309  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.29 
 
 
175 aa  226  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.64 
 
 
184 aa  226  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0343  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.74 
 
 
178 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3389  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.6 
 
 
185 aa  225  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0397838 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0131  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.74 
 
 
178 aa  225  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0440313 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.88 
 
 
181 aa  225  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>