266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4374 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03817  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 
176 aa  358  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4053  20S proteasome A and B subunits  100 
 
 
176 aa  358  2e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5389  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 
176 aa  358  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4374  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 
176 aa  358  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4414  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 
176 aa  358  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0890704  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4164  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 
176 aa  358  2e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03766  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  358  2e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4086  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 
176 aa  358  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4468  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 
176 aa  358  2e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4424  ATP-dependent protease peptidase subunit  98.3 
 
 
176 aa  352  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4308  ATP-dependent protease peptidase subunit  98.3 
 
 
176 aa  352  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4422  ATP-dependent protease peptidase subunit  98.3 
 
 
176 aa  352  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4338  ATP-dependent protease peptidase subunit  98.3 
 
 
176 aa  352  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4492  ATP-dependent protease peptidase subunit  98.3 
 
 
176 aa  352  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  97.16 
 
 
176 aa  348  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4792  ATP-dependent protease peptidase subunit  93.18 
 
 
176 aa  339  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3797  ATP-dependent protease peptidase subunit  92.61 
 
 
176 aa  335  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0114  ATP-dependent protease peptidase subunit  92.05 
 
 
176 aa  334  3.9999999999999995e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0166  ATP-dependent protease peptidase subunit  91.48 
 
 
176 aa  329  1e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  90.8 
 
 
174 aa  327  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  90.8 
 
 
174 aa  327  6e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  90.8 
 
 
174 aa  327  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0180  ATP-dependent protease peptidase subunit  90.91 
 
 
176 aa  326  8e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  83.91 
 
 
174 aa  303  6e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4429  ATP-dependent protease peptidase subunit  83.33 
 
 
174 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0531  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.76 
 
 
174 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00786303  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  84.88 
 
 
185 aa  300  6.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.18 
 
 
174 aa  298  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  83.91 
 
 
174 aa  298  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.46 
 
 
174 aa  292  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03517  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.61 
 
 
174 aa  292  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839153  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0167  ATP-dependent protease peptidase subunit  86.44 
 
 
180 aa  293  1e-78  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00724  ATP-dependent protease peptidase subunit  86.05 
 
 
183 aa  291  3e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.89 
 
 
174 aa  289  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.81 
 
 
172 aa  287  4e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.81 
 
 
182 aa  287  5.0000000000000004e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.23 
 
 
182 aa  286  9e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.31 
 
 
175 aa  285  2e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  80 
 
 
176 aa  283  5.999999999999999e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4162  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.76 
 
 
174 aa  281  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3521  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.76 
 
 
174 aa  281  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0434  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.76 
 
 
174 aa  281  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3699  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.76 
 
 
174 aa  281  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.085186  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0447  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.76 
 
 
174 aa  280  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0529  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.76 
 
 
174 aa  280  7.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3361  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.61 
 
 
174 aa  278  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0463  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.18 
 
 
174 aa  278  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3867  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.18 
 
 
174 aa  278  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0473  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.18 
 
 
174 aa  278  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.46 
 
 
179 aa  278  4e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.19 
 
 
177 aa  274  6e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.19 
 
 
187 aa  270  9e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.02 
 
 
204 aa  268  4e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.16 
 
 
176 aa  267  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.02 
 
 
181 aa  267  7e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.84 
 
 
172 aa  263  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0004  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.99 
 
 
184 aa  262  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.42 
 
 
179 aa  261  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  69.59 
 
 
180 aa  258  4e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.35 
 
 
178 aa  256  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5000  ATP-dependent protease peptidase subunit  78.36 
 
 
176 aa  254  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5050  ATP-dependent protease peptidase subunit  78.36 
 
 
176 aa  254  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4874  ATP-dependent protease peptidase subunit  78.36 
 
 
176 aa  254  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.61 
 
 
183 aa  253  9e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.18 
 
 
183 aa  253  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0464  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.19 
 
 
176 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.958298  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2740  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.93 
 
 
176 aa  250  9.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.86 
 
 
181 aa  249  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5140  heat shock protein HslV  77.78 
 
 
176 aa  248  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0395  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.78 
 
 
176 aa  249  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66770  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.83 
 
 
177 aa  248  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.42 
 
 
178 aa  247  7e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45380  ATP-dependent protease peptidase subunit  75 
 
 
180 aa  247  7e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479981  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5790  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.25 
 
 
182 aa  246  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  68 
 
 
181 aa  245  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.01 
 
 
188 aa  244  3e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2545  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.01 
 
 
196 aa  244  4e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001748  ATP-dependent protease HslV  85.52 
 
 
156 aa  244  6.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.906406  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.12 
 
 
183 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.05 
 
 
194 aa  241  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.86 
 
 
193 aa  240  6e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.29 
 
 
181 aa  239  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0397  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.02 
 
 
192 aa  239  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.848683 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.95 
 
 
184 aa  238  2.9999999999999997e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 
178 aa  233  8e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3108  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.18 
 
 
178 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.192963 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2367  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.35 
 
 
179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121979  hitchhiker  0.00000525467 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0165  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.59 
 
 
214 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.183873  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2747  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.35 
 
 
173 aa  232  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3436  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.32 
 
 
182 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.834588  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6441  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.18 
 
 
178 aa  231  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4380  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.18 
 
 
178 aa  231  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3000  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.18 
 
 
178 aa  230  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.209191 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0070  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.59 
 
 
178 aa  230  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3138  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.18 
 
 
178 aa  230  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.100279  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1210  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 
178 aa  230  8.000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3837  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.42 
 
 
178 aa  230  8.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.552553 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0386  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.01 
 
 
178 aa  229  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0201  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.01 
 
 
178 aa  229  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2916  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.01 
 
 
178 aa  229  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0771725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>