248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1210 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1210  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 		 178 aa  356  9.999999999999999e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.5 
 
 		 204 aa  241  3.9999999999999997e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0989  20S proteasome A and B subunits  66.67 
 
 		 176 aa  241  5e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.5 
 
 		 181 aa  240  7.999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 		 183 aa  240  9e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.42 
 
 		 174 aa  239  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.36 
 
 		 177 aa  238  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.93 
 
 		 182 aa  236  2e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  61.36 
 
 		 180 aa  235  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  64 
 
 		 181 aa  235  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 174 aa  234  4e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 		 172 aa  234  5.0000000000000005e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.36 
 
 		 182 aa  234  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3264  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.07 
 
 		 185 aa  233  9e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 		 185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.42 
 
 		 176 aa  232  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 		 174 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.66 
 
 		 187 aa  231  6e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.16 
 
 		 176 aa  231  6e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3982  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.33 
 
 		 175 aa  231  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 		 174 aa  230  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 		 174 aa  230  7.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 		 174 aa  230  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03817  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 		 176 aa  230  9e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4053  20S proteasome A and B subunits  62.57 
 
 		 176 aa  230  9e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4414  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 		 176 aa  230  9e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0890704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4468  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 		 176 aa  230  9e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4086  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 		 176 aa  230  9e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4164  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 		 176 aa  230  9e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5389  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 		 176 aa  230  9e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4374  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 		 176 aa  230  9e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03766  hypothetical protein  62.57 
 
 		 176 aa  230  9e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03517  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.19 
 
 		 174 aa  229  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839153  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.05 
 
 		 175 aa  228  2e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4422  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 176 aa  228  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4424  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 176 aa  228  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4338  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 176 aa  228  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4308  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 176 aa  228  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4492  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 176 aa  228  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0114  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 		 176 aa  228  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0214  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.22 
 
 		 180 aa  228  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4792  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.4 
 
 		 176 aa  228  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.82 
 
 		 183 aa  227  6e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.64 
 
 		 184 aa  227  7e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0531  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.65 
 
 		 174 aa  227  7e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00786303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 		 174 aa  227  7e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3797  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 176 aa  227  7e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.64 
 
 		 184 aa  227  8e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.06 
 
 		 174 aa  226  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0302  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.02 
 
 		 182 aa  225  2e-58  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4429  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.06 
 
 		 174 aa  225  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.52 
 
 		 179 aa  224  4e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.06 
 
 		 176 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0166  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.82 
 
 		 176 aa  224  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.98 
 
 		 184 aa  224  6e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.71 
 
 		 176 aa  223  8e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.89 
 
 		 172 aa  223  9e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 		 176 aa  223  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00178551  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0400  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 		 176 aa  223  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000263629  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.9 
 
 		 178 aa  221  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.34 
 
 		 182 aa  221  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0473  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 		 174 aa  221  6e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.49 
 
 		 184 aa  221  6e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0463  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 		 174 aa  221  6e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3867  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 		 174 aa  221  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0180  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 		 176 aa  220  7e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.48 
 
 		 183 aa  220  7e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.25 
 
 		 179 aa  220  7e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3361  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.8 
 
 		 174 aa  220  7e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00724  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 		 183 aa  220  7e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4162  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 174 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3521  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 174 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0434  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 174 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1323  20S proteasome A and B subunits  60.92 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3699  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 174 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.085186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2411  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.34 
 
 		 177 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0141789  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5140  heat shock protein HslV  61.76 
 
 		 176 aa  218  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0447  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 174 aa  218  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0529  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 174 aa  218  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0395  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.76 
 
 		 176 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0464  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.59 
 
 		 176 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0165  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.09 
 
 		 214 aa  218  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.183873  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0709  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.43 
 
 		 188 aa  217  6e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0032  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.64 
 
 		 186 aa  217  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4309  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.33 
 
 		 175 aa  217  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0829  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.25 
 
 		 178 aa  217  7e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000238243  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.98 
 
 		 193 aa  217  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6441  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.66 
 
 		 178 aa  216  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2367  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.45 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121979  hitchhiker  0.00000525467 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.98 
 
 		 181 aa  216  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0004  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.28 
 
 		 184 aa  216  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.98 
 
 		 181 aa  216  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45380  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.06 
 
 		 180 aa  215  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479981  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0230  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.14 
 
 		 176 aa  216  2e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000355363  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0343  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.09 
 
 		 178 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.8 
 
 		 194 aa  215  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5050  ATP-dependent protease peptidase subunit  60 
 
 		 176 aa  214  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3108  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.09 
 
 		 178 aa  214  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.192963 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4874  ATP-dependent protease peptidase subunit  60 
 
 		 176 aa  214  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.55 
 
 		 178 aa  214  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>