246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0829 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0829  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 
178 aa  354  2.9999999999999997e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000238243  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1310  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.7 
 
 
181 aa  244  4e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.14 
 
 
176 aa  228  4e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00178551  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0400  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.14 
 
 
176 aa  228  4e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000263629  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.76 
 
 
183 aa  226  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0709  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.74 
 
 
188 aa  226  1e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.55 
 
 
204 aa  226  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.99 
 
 
181 aa  223  9e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1587  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.66 
 
 
180 aa  220  8e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1210  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.25 
 
 
178 aa  217  7e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.43 
 
 
178 aa  215  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.9 
 
 
178 aa  215  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.18 
 
 
178 aa  214  7e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.63 
 
 
182 aa  214  8e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0214  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.34 
 
 
180 aa  213  9e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.06 
 
 
182 aa  213  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.98 
 
 
185 aa  213  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1099  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.3 
 
 
182 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.57 
 
 
176 aa  212  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.68 
 
 
183 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2720  20S proteasome A and B subunits  56.25 
 
 
179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.3 
 
 
187 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.14 
 
 
176 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.5 
 
 
177 aa  211  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.57 
 
 
176 aa  210  9e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.56 
 
 
172 aa  210  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.14 
 
 
188 aa  209  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0989  20S proteasome A and B subunits  58.86 
 
 
176 aa  209  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.14 
 
 
172 aa  208  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1699  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.29 
 
 
176 aa  208  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000408331  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.14 
 
 
175 aa  208  3e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.82 
 
 
185 aa  208  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.37 
 
 
179 aa  207  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.11 
 
 
180 aa  207  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3571  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.11 
 
 
180 aa  207  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000211087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3589  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.11 
 
 
180 aa  207  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000154758  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3928  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.11 
 
 
180 aa  207  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00131744  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3968  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.11 
 
 
180 aa  207  6e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1323  20S proteasome A and B subunits  57.3 
 
 
179 aa  207  6e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3842  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.11 
 
 
180 aa  207  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.01545e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1315  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.11 
 
 
180 aa  207  7e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  unclonable  7.14384e-26 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.87 
 
 
186 aa  207  7e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3872  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.11 
 
 
180 aa  206  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0375524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3877  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.11 
 
 
180 aa  206  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1117  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.6 
 
 
182 aa  206  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.9 
 
 
179 aa  206  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3797  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.48 
 
 
176 aa  206  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5624  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.93 
 
 
180 aa  206  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.39 
 
 
184 aa  205  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0176  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.62 
 
 
188 aa  206  2e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.87 
 
 
186 aa  206  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1105  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.56 
 
 
180 aa  205  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745772  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0114  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.89 
 
 
176 aa  205  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.54 
 
 
184 aa  205  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.48 
 
 
176 aa  204  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0996  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.06 
 
 
189 aa  204  4e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1175  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.29 
 
 
182 aa  204  4e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.107278  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0623  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.18 
 
 
206 aa  204  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.39 
 
 
184 aa  204  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0456  20S proteasome A and B subunits  58.62 
 
 
185 aa  204  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3653  ATP-dependent protease peptidase subunit  55 
 
 
180 aa  204  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00119552  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.59 
 
 
193 aa  204  6e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0167  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.87 
 
 
178 aa  204  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.37 
 
 
179 aa  204  7e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.59 
 
 
181 aa  204  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.65 
 
 
174 aa  204  7e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1556  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.19 
 
 
181 aa  204  7e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.910696  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.71 
 
 
176 aa  204  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4792  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.73 
 
 
176 aa  204  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.57 
 
 
176 aa  203  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  56 
 
 
182 aa  203  9e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.14 
 
 
181 aa  203  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0131  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.3 
 
 
178 aa  203  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0440313 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3384  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.18 
 
 
178 aa  203  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  50 
 
 
180 aa  203  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03817  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.31 
 
 
176 aa  202  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4053  20S proteasome A and B subunits  57.31 
 
 
176 aa  202  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03766  hypothetical protein  57.31 
 
 
176 aa  202  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0043  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.62 
 
 
178 aa  202  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5389  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.31 
 
 
176 aa  202  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3254  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.74 
 
 
178 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0386  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.74 
 
 
178 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3707  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.18 
 
 
178 aa  202  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4086  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.31 
 
 
176 aa  202  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4468  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.31 
 
 
176 aa  202  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4414  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.31 
 
 
176 aa  202  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0890704  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4164  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.31 
 
 
176 aa  202  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0166  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.73 
 
 
176 aa  202  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2482  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.44 
 
 
180 aa  202  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0030  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.18 
 
 
179 aa  202  2e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4374  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.31 
 
 
176 aa  202  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2916  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.74 
 
 
178 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0771725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2173  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.74 
 
 
178 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0191  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.74 
 
 
178 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.834819  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0201  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.74 
 
 
178 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3432  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.74 
 
 
178 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.23 
 
 
174 aa  202  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4422  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.31 
 
 
176 aa  201  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4492  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.31 
 
 
176 aa  201  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.89 
 
 
186 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>