246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0230 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0230  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 		 176 aa  359  1e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000355363  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0400  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.16 
 
 		 176 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000263629  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.16 
 
 		 176 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00178551  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0709  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.82 
 
 		 188 aa  240  6e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  60 
 
 		 177 aa  225  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.05 
 
 		 178 aa  225  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.71 
 
 		 183 aa  223  9e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.34 
 
 		 181 aa  222  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 		 182 aa  221  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.86 
 
 		 182 aa  220  6e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.86 
 
 		 204 aa  218  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.77 
 
 		 187 aa  217  5e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  56 
 
 		 180 aa  217  8.999999999999998e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.43 
 
 		 176 aa  216  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.86 
 
 		 181 aa  216  8.999999999999998e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1210  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.14 
 
 		 178 aa  216  2e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.71 
 
 		 176 aa  214  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.06 
 
 		 174 aa  214  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2411  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.66 
 
 		 177 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0141789  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 		 176 aa  214  5.9999999999999996e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.4 
 
 		 176 aa  213  8e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03817  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.82 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4053  20S proteasome A and B subunits  60.82 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4374  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.82 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5389  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.82 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4086  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.82 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4164  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.82 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03766  hypothetical protein  60.82 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4468  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.82 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4414  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.82 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0890704  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1323  20S proteasome A and B subunits  58.86 
 
 		 179 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1997  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.93 
 
 		 180 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.65 
 
 		 174 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0114  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.4 
 
 		 176 aa  212  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4308  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 		 176 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0782  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 		 182 aa  211  2.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.639301  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4424  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 		 176 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4338  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 		 176 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4792  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.82 
 
 		 176 aa  211  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.14 
 
 		 179 aa  211  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4422  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 		 176 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4492  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 		 176 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.06 
 
 		 174 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.06 
 
 		 174 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3797  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.82 
 
 		 176 aa  211  4.9999999999999996e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.57 
 
 		 179 aa  210  9e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1029  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.82 
 
 		 174 aa  210  9e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000258699  unclonable  0.0000000048858 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1117  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.23 
 
 		 182 aa  209  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0214  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.12 
 
 		 180 aa  210  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.06 
 
 		 174 aa  209  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.8 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 		 174 aa  208  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1105  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.62 
 
 		 180 aa  208  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745772  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.45 
 
 		 183 aa  208  3e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 		 174 aa  208  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 		 174 aa  208  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03517  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.48 
 
 		 174 aa  208  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839153  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  56 
 
 		 178 aa  208  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.14 
 
 		 176 aa  208  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.3 
 
 		 175 aa  208  4e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.14 
 
 		 184 aa  208  4e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.73 
 
 		 184 aa  207  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0531  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.48 
 
 		 174 aa  207  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00786303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.73 
 
 		 184 aa  207  6e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.89 
 
 		 185 aa  207  6e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.48 
 
 		 172 aa  207  7e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0166  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.06 
 
 		 176 aa  207  7e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.6 
 
 		 187 aa  207  8e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.73 
 
 		 184 aa  206  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4429  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.89 
 
 		 174 aa  206  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.56 
 
 		 172 aa  206  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1208  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.91 
 
 		 182 aa  206  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0180  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.06 
 
 		 176 aa  205  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1175  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.29 
 
 		 182 aa  206  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.107278  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.73 
 
 		 176 aa  205  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1410  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.3 
 
 		 182 aa  205  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.29 
 
 		 178 aa  204  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0473  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 174 aa  204  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0463  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 174 aa  204  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3867  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 174 aa  204  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1313  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.86 
 
 		 181 aa  204  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1338  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.86 
 
 		 181 aa  204  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00663055  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2482  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.8 
 
 		 180 aa  203  8e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3653  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.37 
 
 		 180 aa  203  9e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00119552  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.98 
 
 		 182 aa  203  9e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2179  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 		 176 aa  203  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00206199  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2259  20S proteasome A and B subunits  56.65 
 
 		 175 aa  202  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0460618 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.39 
 
 		 183 aa  202  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0930  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.34 
 
 		 182 aa  202  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1587  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.9 
 
 		 180 aa  202  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2367  ATP-dependent protease peptidase subunit  60 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121979  hitchhiker  0.00000525467 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4162  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.82 
 
 		 174 aa  202  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0447  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.4 
 
 		 174 aa  201  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3521  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.82 
 
 		 174 aa  202  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0434  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.82 
 
 		 174 aa  202  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3699  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.82 
 
 		 174 aa  202  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.085186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0529  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.4 
 
 		 174 aa  201  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3361  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 		 174 aa  201  4e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0030  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.8 
 
 		 179 aa  201  4e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00724  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.89 
 
 		 183 aa  201  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>