246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3764 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 		 174 aa  357  7e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3361  ATP-dependent protease peptidase subunit  95.4 
 
 		 174 aa  326  1.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  88.51 
 
 		 174 aa  324  4.0000000000000003e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0531  ATP-dependent protease peptidase subunit  89.08 
 
 		 174 aa  322  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00786303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4429  ATP-dependent protease peptidase subunit  88.51 
 
 		 174 aa  320  5e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  88.51 
 
 		 174 aa  320  8e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0529  ATP-dependent protease peptidase subunit  93.1 
 
 		 174 aa  319  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0447  ATP-dependent protease peptidase subunit  93.1 
 
 		 174 aa  319  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4162  ATP-dependent protease peptidase subunit  91.95 
 
 		 174 aa  316  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3521  ATP-dependent protease peptidase subunit  91.95 
 
 		 174 aa  316  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0434  ATP-dependent protease peptidase subunit  91.95 
 
 		 174 aa  316  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3699  ATP-dependent protease peptidase subunit  91.95 
 
 		 174 aa  316  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.085186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  86.78 
 
 		 174 aa  315  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0473  ATP-dependent protease peptidase subunit  91.38 
 
 		 174 aa  313  5e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0463  ATP-dependent protease peptidase subunit  91.38 
 
 		 174 aa  313  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3867  ATP-dependent protease peptidase subunit  91.38 
 
 		 174 aa  313  5e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03517  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.76 
 
 		 174 aa  301  4.0000000000000003e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839153  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.66 
 
 		 185 aa  299  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.18 
 
 		 174 aa  296  9e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.81 
 
 		 172 aa  290  6e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03817  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.89 
 
 		 176 aa  289  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4053  20S proteasome A and B subunits  79.89 
 
 		 176 aa  289  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4374  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.89 
 
 		 176 aa  289  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5389  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.89 
 
 		 176 aa  289  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4164  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.89 
 
 		 176 aa  289  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4414  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.89 
 
 		 176 aa  289  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0890704  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4086  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.89 
 
 		 176 aa  289  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4468  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.89 
 
 		 176 aa  289  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03766  hypothetical protein  79.89 
 
 		 176 aa  289  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0166  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.65 
 
 		 176 aa  287  6e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  78.74 
 
 		 174 aa  287  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  78.74 
 
 		 174 aa  287  7e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  78.74 
 
 		 174 aa  287  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.19 
 
 		 176 aa  286  9e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0180  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.65 
 
 		 176 aa  286  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0114  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.07 
 
 		 176 aa  286  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4792  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.07 
 
 		 176 aa  285  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4492  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.65 
 
 		 176 aa  285  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3797  ATP-dependent protease peptidase subunit  78.49 
 
 		 176 aa  285  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4422  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.65 
 
 		 176 aa  285  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4424  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.65 
 
 		 176 aa  285  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4308  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.65 
 
 		 176 aa  285  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4338  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.65 
 
 		 176 aa  285  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00724  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.08 
 
 		 183 aa  282  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.16 
 
 		 182 aa  280  7.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.58 
 
 		 182 aa  279  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.19 
 
 		 175 aa  276  8e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.58 
 
 		 176 aa  273  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.99 
 
 		 176 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0004  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.99 
 
 		 184 aa  267  4e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.67 
 
 		 183 aa  267  7e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.25 
 
 		 179 aa  264  4e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.84 
 
 		 172 aa  263  5.999999999999999e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.93 
 
 		 204 aa  261  4.999999999999999e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.35 
 
 		 179 aa  259  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2545  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.6 
 
 		 196 aa  258  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.35 
 
 		 181 aa  258  3e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.76 
 
 		 177 aa  256  9e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.35 
 
 		 187 aa  256  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.14 
 
 		 181 aa  256  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.19 
 
 		 178 aa  254  4e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.86 
 
 		 181 aa  254  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  68.6 
 
 		 180 aa  253  9e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66770  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.84 
 
 		 177 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.77 
 
 		 178 aa  252  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0167  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.99 
 
 		 180 aa  252  2.0000000000000002e-66  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5000  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.41 
 
 		 176 aa  251  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5790  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.26 
 
 		 182 aa  251  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4874  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.41 
 
 		 176 aa  251  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.18 
 
 		 188 aa  251  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5050  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.41 
 
 		 176 aa  251  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.61 
 
 		 194 aa  251  5.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5140  heat shock protein HslV  74.57 
 
 		 176 aa  250  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0395  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.57 
 
 		 176 aa  250  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 184 aa  250  8.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45380  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.83 
 
 		 180 aa  249  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479981  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.08 
 
 		 183 aa  247  5e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0464  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.68 
 
 		 176 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.86 
 
 		 193 aa  244  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.29 
 
 		 181 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.21 
 
 		 183 aa  242  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1210  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.42 
 
 		 178 aa  239  2e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3837  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.86 
 
 		 178 aa  238  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.552553 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0165  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.28 
 
 		 214 aa  238  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.183873  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0397  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.68 
 
 		 192 aa  237  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.848683 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3436  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.61 
 
 		 182 aa  237  5.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.834588  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3108  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.86 
 
 		 178 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.192963 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001748  ATP-dependent protease HslV  80.14 
 
 		 156 aa  234  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.906406  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3086  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.86 
 
 		 178 aa  234  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0495645 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6441  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.86 
 
 		 178 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2477  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.7 
 
 		 178 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567324  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3138  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.86 
 
 		 178 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.100279  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3091  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.7 
 
 		 178 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3000  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.86 
 
 		 178 aa  234  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.209191 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0386  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.53 
 
 		 178 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0070  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.28 
 
 		 178 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2173  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.53 
 
 		 178 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0191  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.53 
 
 		 178 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.834819  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0201  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.53 
 
 		 178 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3432  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.53 
 
 		 178 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>