More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_22090 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  100 
 
 
285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  63.83 
 
 
286 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  44.13 
 
 
290 aa  212  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  36.14 
 
 
302 aa  155  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1155  alpha/beta hydrolase fold protein  34.93 
 
 
292 aa  144  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  34.64 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4466  alpha/beta hydrolase fold protein  33.71 
 
 
290 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.911408  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  29.14 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 
286 aa  113  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
361 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 
287 aa  108  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 
276 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 
345 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 
286 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 
288 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
272 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  29.85 
 
 
453 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  30.66 
 
 
284 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  33.84 
 
 
282 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  32.95 
 
 
462 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  28.93 
 
 
279 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 
350 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  27.94 
 
 
456 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
276 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  30.58 
 
 
271 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
291 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0888  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 
282 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 
283 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
283 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  30.66 
 
 
278 aa  99.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 
289 aa  99.4  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
340 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
290 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 
340 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  31.87 
 
 
308 aa  99  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 
340 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 
346 aa  98.6  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 
314 aa  99  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 
340 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 
293 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 
281 aa  97.8  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 
309 aa  97.8  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  31.03 
 
 
462 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 
504 aa  97.4  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 
284 aa  97.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 
298 aa  96.7  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
340 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
274 aa  96.3  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 
272 aa  95.9  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 
350 aa  95.5  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
283 aa  93.6  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 
283 aa  93.6  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  30.92 
 
 
322 aa  94  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
287 aa  94  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  27.46 
 
 
291 aa  94  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  28.83 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 
315 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  29.85 
 
 
341 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 
437 aa  92.8  6e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 
284 aa  92.8  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
290 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 
273 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  30.82 
 
 
304 aa  91.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  30.62 
 
 
271 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
278 aa  91.3  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 
289 aa  90.9  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
302 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 
339 aa  91.3  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 
273 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
289 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
295 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  30.66 
 
 
291 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.27 
 
 
277 aa  89.4  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  30.29 
 
 
286 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 
275 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
284 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
323 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0656  Alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198236  decreased coverage  0.00768241 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2307  alpha/beta hydrolase fold protein  27.9 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.960741 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  29.77 
 
 
275 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  25.08 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2256  alpha/beta hydrolase fold protein  27.9 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 
314 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 
292 aa  87.4  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.73 
 
 
263 aa  86.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 
288 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  26.27 
 
 
291 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 
296 aa  85.9  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 
277 aa  86.3  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  26.27 
 
 
291 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  26.46 
 
 
289 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 
282 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>