More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_08440 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  100 
 
 		 173 aa  344  4e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02410  ribosomal protein L10  57.23 
 
 		 173 aa  191  4e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2331  ribosomal protein L10  60.12 
 
 		 173 aa  180  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.910628 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  43.35 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000357466  unclonable  0.0000000289216 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  44 
 
 		 176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  44.44 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  44.44 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  44.44 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  44.44 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  44.44 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  44.44 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  44.44 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  44.44 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  44.44 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  44.44 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  44.44 
 
 		 166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  40.35 
 
 		 175 aa  124  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  40.35 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  38.55 
 
 		 174 aa  121  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  42.33 
 
 		 176 aa  120  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  39.31 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  43.36 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1569  50S ribosomal protein L10  40.79 
 
 		 175 aa  118  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  36.42 
 
 		 172 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02781  50S ribosomal protein L10  40.79 
 
 		 175 aa  118  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.210657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0632  50S ribosomal protein L10  41.04 
 
 		 175 aa  117  7e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1174  50S ribosomal protein L10  46.21 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000920712  normal  0.67375 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  42.31 
 
 		 187 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  40.41 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2554  50S ribosomal protein L10  41.04 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  42.42 
 
 		 174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  39.73 
 
 		 166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5961  50S ribosomal protein L10  39.64 
 
 		 178 aa  114  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  0.892445 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  41.13 
 
 		 166 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  39.41 
 
 		 202 aa  114  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  41.96 
 
 		 184 aa  114  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  37.72 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  37.72 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  41.96 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  40.49 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2676  ribosomal protein L10  43.31 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000001837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  37.57 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  39.63 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4011  ribosomal protein L10  39.66 
 
 		 175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0274883  hitchhiker  0.0000000471613 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  39.05 
 
 		 256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  39.87 
 
 		 183 aa  111  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02201  50S ribosomal protein L10  40 
 
 		 175 aa  111  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.756015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2469  50S ribosomal protein L10  39.64 
 
 		 175 aa  111  5e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.851244  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1038  50S ribosomal protein L10  39.88 
 
 		 183 aa  111  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  35.84 
 
 		 173 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  35.84 
 
 		 173 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  40.74 
 
 		 166 aa  110  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  40.74 
 
 		 166 aa  110  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  41.33 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  36.05 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4678  50S ribosomal protein L10  41.29 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000989378  decreased coverage  0.00291158 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  36.16 
 
 		 181 aa  108  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  35.29 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1738  50S ribosomal protein L10  39.24 
 
 		 189 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  40.56 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1762  50S ribosomal protein L10  39.24 
 
 		 189 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.232126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1956  ribosomal protein L10  35.29 
 
 		 174 aa  107  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2951  ribosomal protein L10  40.34 
 
 		 186 aa  107  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0265827  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  38.01 
 
 		 174 aa  107  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  39.51 
 
 		 166 aa  107  8.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  36.75 
 
 		 176 aa  107  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0263  50S ribosomal protein L10  41.06 
 
 		 190 aa  107  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273866  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0479  ribosomal protein L10  41.48 
 
 		 164 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  38.82 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5083  50S ribosomal protein L10  43.26 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5114  ribosomal protein L10  37.97 
 
 		 175 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316499  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  41.01 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  37.95 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  39.38 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  42.19 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27791  50S ribosomal protein L10  36.84 
 
 		 175 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  36.2 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  35.26 
 
 		 173 aa  105  4e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  37.34 
 
 		 175 aa  104  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  39.38 
 
 		 203 aa  104  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0678  ribosomal protein L10  40.43 
 
 		 190 aa  104  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2669  ribosomal protein L10  45.19 
 
 		 175 aa  104  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  42.96 
 
 		 181 aa  104  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  40.85 
 
 		 171 aa  104  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  36.75 
 
 		 177 aa  104  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2154  50S ribosomal protein L10  39.6 
 
 		 175 aa  104  7e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.44563  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  42.55 
 
 		 176 aa  103  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  42.96 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0618  ribosomal protein L10  40 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  40.56 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  35.84 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  37.2 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  34.36 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1945  50S ribosomal protein L10  40.51 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  43.85 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02311  50S ribosomal protein L10  35.09 
 
 		 175 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>