More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0865 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0865  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 331 aa  697    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1192  radical SAM domain-containing protein  58.61 
 
 		 332 aa  430  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2823  radical SAM family protein  58.61 
 
 		 332 aa  425  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0411588 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0685  radical SAM domain-containing protein  58.91 
 
 		 332 aa  422  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0882  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  57.7 
 
 		 332 aa  418  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000626988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3363  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  57.1 
 
 		 332 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1017  radical SAM domain-containing protein  56.8 
 
 		 332 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2236  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  58.13 
 
 		 333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2446  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  44.24 
 
 		 336 aa  328  8e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2847  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  44 
 
 		 338 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3249  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  44 
 
 		 338 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.792504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4131  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  42.15 
 
 		 381 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3252  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  42.27 
 
 		 386 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.309315 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0220  radical SAM family protein  44.2 
 
 		 340 aa  301  1e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4719  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  41.96 
 
 		 386 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1268  radical SAM domain-containing protein  41.96 
 
 		 386 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3055  radical SAM domain-containing protein  41.96 
 
 		 386 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1963  radical SAM domain-containing protein  41.96 
 
 		 386 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0981  radical SAM domain-containing protein  41.96 
 
 		 386 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.820842  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5307  radical SAM family protein  41.96 
 
 		 386 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2243  radical SAM domain-containing protein  41.96 
 
 		 386 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5553  radical SAM domain-containing protein  41.96 
 
 		 386 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2930  radical SAM domain-containing protein  41.96 
 
 		 386 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3158  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  41.18 
 
 		 382 aa  299  4e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1831  radical SAM domain-containing protein  42.06 
 
 		 383 aa  298  7e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5424  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  41.32 
 
 		 386 aa  298  8e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3361  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  42.06 
 
 		 402 aa  298  8e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.941975  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0017  MoaA/NifB/PqqE family protein  40.84 
 
 		 384 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4877  radical SAM domain-containing protein  41.32 
 
 		 386 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.481897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7035  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  41.64 
 
 		 384 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000165617 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0105  radical SAM oxidoreductase  41.64 
 
 		 386 aa  296  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2560  radical SAM family protein  42.25 
 
 		 369 aa  296  3e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0538253  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3245  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  42.39 
 
 		 382 aa  295  6e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2244  radical SAM domain-containing protein  43.05 
 
 		 371 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1287  radical SAM domain-containing protein  43.05 
 
 		 371 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4899  radical SAM family protein  42.09 
 
 		 386 aa  292  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152748  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0826  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  41.85 
 
 		 337 aa  291  8e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.256838 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3457  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  42.86 
 
 		 339 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483459 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0060  radical SAM family protein  40.43 
 
 		 387 aa  289  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0850532  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4168  putative hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein  40.69 
 
 		 388 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159717  normal  0.0664961 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1219  radical SAM family protein  45.19 
 
 		 338 aa  288  7e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0815  MoaA/NifB/PqqE family protein  41.28 
 
 		 371 aa  287  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1745  oxidoreductase  41.64 
 
 		 372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1288  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  42.24 
 
 		 392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1015  radical SAM family Fe-S protein  41.12 
 
 		 366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0391907  normal  0.466336 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2115  radical SAM domain protein  41.07 
 
 		 367 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1774  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  41.07 
 
 		 367 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2267  Fe-S oxidoreductase  40.82 
 
 		 389 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2680  radical SAM family protein  40.82 
 
 		 389 aa  280  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.150776  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20630  MoaA, NifB, PqqE, radical SAM superfamily protein  39.09 
 
 		 377 aa  280  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2971  hypothetical protein  40.51 
 
 		 382 aa  279  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0553904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1725  radical SAM family protein  40.82 
 
 		 383 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0670141 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4083  radical SAM domain-containing protein  44.41 
 
 		 336 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179922 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2079  MoaA/NifB/PqqE family Fe-S oxidoreductase  39.69 
 
 		 336 aa  275  9e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3571  radical SAM family protein  39.87 
 
 		 386 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7158  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  40.13 
 
 		 384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1699  radical SAM domain-containing protein  40.92 
 
 		 334 aa  272  6e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.440195  hitchhiker  0.000169379 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3768  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  39.81 
 
 		 387 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3460  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  39.81 
 
 		 387 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  0.56 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3658  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  39.81 
 
 		 387 aa  270  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6662  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  40.77 
 
 		 334 aa  270  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.549457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4256  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  42.09 
 
 		 386 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.59824  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1728  radical SAM family protein  41.77 
 
 		 388 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.791785  normal  0.0366359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6342  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  39.81 
 
 		 384 aa  268  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364932 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0969  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  39.5 
 
 		 387 aa  267  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0827  radical SAM family protein  40.76 
 
 		 334 aa  264  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.731351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2595  radical SAM family protein  40.31 
 
 		 332 aa  256  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.90136  normal  0.0805169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6192  radical SAM domain-containing protein  39.38 
 
 		 332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0225613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5711  radical SAM domain-containing protein  39.81 
 
 		 335 aa  246  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23060  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  38.32 
 
 		 334 aa  237  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.1711 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3273  radical SAM domain-containing protein  44.44 
 
 		 157 aa  110  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347908  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0919  radical SAM domain-containing protein  25.93 
 
 		 338 aa  87.4  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  31.93 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  29.38 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  27.19 
 
 		 561 aa  75.9  0.0000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0122  Radical SAM domain protein  23.47 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  28.27 
 
 		 769 aa  73.9  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  31.1 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  29.41 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0354  radical SAM domain-containing protein  32.93 
 
 		 377 aa  69.3  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.880417 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  29.78 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  30.64 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  25 
 
 		 479 aa  67  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  30.39 
 
 		 396 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  27.98 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  27.81 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0323  Radical SAM domain protein  28.95 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  25.88 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  26.26 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  27.13 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1760  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.85 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.7115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  26.47 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  28.24 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 438 aa  63.2  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  25.44 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  27.91 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2045  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.22 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>