157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2037 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2037  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.902665  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3930  hypothetical protein  57.5 
 
 		 219 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1948  hypothetical protein  56.02 
 
 		 215 aa  222  4e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00544645  normal  0.0118846 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06661  hypothetical protein  52.74 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03932  hypothetical protein  52 
 
 		 209 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1056  hypothetical protein  49.5 
 
 		 217 aa  211  3.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07816  hypothetical protein  41.5 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0518  hypothetical protein  50.36 
 
 		 152 aa  149  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39511  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.64 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  32.79 
 
 		 292 aa  75.1  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  27.39 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.75 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  28.25 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  29.33 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.38 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  27.68 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  27.12 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.37 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  27.12 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  30.41 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  28.72 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  25.41 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  29.41 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.33 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  28.82 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  27.89 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.65 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.55 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.29 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  26.55 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  29.38 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  28.82 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  25.99 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  26.55 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  25.99 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  26.55 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  28.3 
 
 		 230 aa  62  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  26.55 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  25.26 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.9 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  27.89 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.14 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  27.66 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  25.14 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  27.01 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  27.33 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  27.52 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  27.11 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.57 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  27.06 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  24 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  28.1 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.9 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  29.33 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  26.78 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  27.13 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  21.18 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.33 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  25.86 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  25.86 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  26.04 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  27.03 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.4 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2857  hypothetical protein  26.84 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  28.4 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  28.99 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  30.71 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  28.99 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  25.66 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  27.11 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.86 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  25.93 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  26.47 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  25.93 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  27.81 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  23.12 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.93 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  25.15 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2164  hypothetical protein  26.94 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  25.93 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.44 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  24.57 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  26.49 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  25.93 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  27.33 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  29.45 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.97 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  27.06 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  25.47 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  26.47 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  27.07 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  27.39 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  24.26 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  25.93 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.89 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  25.15 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.1 
 
 		 189 aa  51.6  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2683  hypothetical protein  24.81 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2740  hypothetical protein  24.81 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>