More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0064 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 330 aa  674    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  44.07 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  48.31 
 
 		 330 aa  281  8.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  43.81 
 
 		 368 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0843  alpha/beta hydrolase fold protein  44.34 
 
 		 333 aa  279  6e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  44.25 
 
 		 346 aa  278  8e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  44.83 
 
 		 333 aa  276  5e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  44.15 
 
 		 344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  42.47 
 
 		 345 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  42.81 
 
 		 344 aa  268  7e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  42.24 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  43.63 
 
 		 341 aa  259  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  41.16 
 
 		 333 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  41.28 
 
 		 333 aa  255  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  43.61 
 
 		 348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  43.46 
 
 		 353 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2332  alpha/beta hydrolase fold  43.37 
 
 		 335 aa  253  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  43.93 
 
 		 339 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  43.14 
 
 		 377 aa  252  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1851  alpha/beta hydrolase fold  40.56 
 
 		 332 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240679 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  43.85 
 
 		 352 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  43.52 
 
 		 353 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3264  hydrolase, alpha/beta fold family  40.88 
 
 		 332 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  41.97 
 
 		 341 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1269  alpha/beta hydrolase fold  41.8 
 
 		 348 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331641  normal  0.0800465 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  41.9 
 
 		 342 aa  248  7e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  42.16 
 
 		 387 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1764  alpha/beta fold family hydrolase  42.52 
 
 		 429 aa  248  9e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  42.86 
 
 		 404 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2147  Alpha/beta hydrolase fold  41.28 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  42.86 
 
 		 404 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  42.86 
 
 		 439 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  42.86 
 
 		 441 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  42.16 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  43.19 
 
 		 352 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  42.16 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2862  alpha/beta fold family hydrolase  42.86 
 
 		 877 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  41.86 
 
 		 344 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  42.62 
 
 		 387 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1544  alpha/beta hydrolase fold  42.52 
 
 		 406 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1824  alpha/beta hydrolase fold  42.62 
 
 		 332 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3101  Alpha/beta hydrolase fold  40.31 
 
 		 332 aa  245  9e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  40.24 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  38.34 
 
 		 331 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  42.37 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  42.03 
 
 		 332 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1396  putative transmembrane protein  42.47 
 
 		 355 aa  236  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  40.38 
 
 		 329 aa  235  6e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  36.3 
 
 		 345 aa  196  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  34.46 
 
 		 336 aa  179  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  33.44 
 
 		 343 aa  169  8e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  33.9 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  33.11 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 336 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  28.19 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  28.06 
 
 		 300 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  25.99 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  27.74 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  24.19 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3528  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  34.64 
 
 		 518 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  25.42 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  26.13 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  27.69 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  25.9 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  25.9 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  25.41 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  25.41 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  25.41 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  32.62 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  24.3 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  26.13 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 		 272 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  31.01 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  29.44 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  28.12 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  39.13 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  24.22 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  28.43 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6236  hypothetical protein  28.64 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  28.43 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>