More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6236 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6236  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  753    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5780  hypothetical protein  59.26 
 
 		 361 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2638  hypothetical protein  56.85 
 
 		 356 aa  411  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.12684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3724  hypothetical protein  56.47 
 
 		 355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.994214  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0379  hypothetical protein  53.33 
 
 		 359 aa  391  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0430  hypothetical protein  53.33 
 
 		 359 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3561  hypothetical protein  56.43 
 
 		 388 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2278  hypothetical protein  48.21 
 
 		 355 aa  326  4.0000000000000003e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4720  hypothetical protein  44.86 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4434  hypothetical protein  46.67 
 
 		 387 aa  310  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4548  hypothetical protein  46.93 
 
 		 387 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0653533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4067  hypothetical protein  46.06 
 
 		 387 aa  306  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4182  hypothetical protein  44.85 
 
 		 358 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221061  normal  0.020827 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4711  alpha/beta hydrolase fold protein  32.01 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3918  homoserine O-acetyltransferase  36.31 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  0.0489209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3432  hypothetical protein  28.65 
 
 		 340 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00875  homoserine acetyltransferase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G15350)  29.19 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.611267 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0050  alpha/beta hydrolase fold  33.63 
 
 		 380 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2478  hypothetical protein  30.23 
 
 		 345 aa  103  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0540594 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0180  alpha/beta hydrolase fold  36.23 
 
 		 831 aa  96.7  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0373  hypothetical protein  30.85 
 
 		 359 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0051  homoserine O-acetyltransferase  32.26 
 
 		 386 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1589  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 		 337 aa  94.4  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.643722  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1300  hypothetical protein  27.43 
 
 		 348 aa  94  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2620  homoserine O-acetyltransferase  27.99 
 
 		 408 aa  94.4  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1125  homoserine O-acetyltransferase  29.07 
 
 		 381 aa  94.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000197892  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4498  homoserine O-acetyltransferase  26.95 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202595  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2550  homoserine O-acetyltransferase  30.84 
 
 		 433 aa  90.9  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2096  homoserine O-acetyltransferase  32.11 
 
 		 386 aa  90.5  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5507  hypothetical protein  28.9 
 
 		 339 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1835  alpha/beta hydrolase fold protein  33.71 
 
 		 353 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0283  hypothetical protein  27.6 
 
 		 338 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99545  normal  0.0139101 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1097  homoserine O-acetyltransferase  26.97 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.076735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2369  alpha/beta hydrolase fold protein  27.43 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0437  homoserine O-acetyltransferase  31.58 
 
 		 381 aa  87.4  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7515  hypothetical protein  32.28 
 
 		 341 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0067  homoserine O-acetyltransferase  31.5 
 
 		 403 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0977  homoserine O-acetyltransferase  26.3 
 
 		 366 aa  86.7  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0061  homoserine O-acetyltransferase  27.22 
 
 		 338 aa  86.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1883  homoserine O-acetyltransferase  28.83 
 
 		 404 aa  85.9  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1909  homoserine O-acetyltransferase  31.1 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.872712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0676  homoserine O-acetyltransferase  29.17 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0896  hypothetical protein  25.97 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.039913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0026  hypothetical protein  27.99 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  30.99 
 
 		 491 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0036  hypothetical protein  27.99 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0045  hypothetical protein  27.99 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0127659 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0611  hypothetical protein  27.66 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231125 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0909  homoserine O-acetyltransferase  29.95 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.707138  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2563  homoserine O-acetyltransferase  33.9 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1089  homoserine O-acetyltransferase  30.18 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.740239  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4076  homoserine O-acetyltransferase  30.27 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.66182  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3584  homoserine O-acetyltransferase  27.65 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0598  hypothetical protein  27.89 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.693744  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0613  homoserine O-acetyltransferase  29.3 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0191439  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0585  homoserine O-acetyltransferase  28.18 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0406  homoserine O-acetyltransferase  26.71 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19560  homoserine O-acetyltransferase  27.27 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4254  homoserine O-acetyltransferase  32.47 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.218969  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4099  homoserine O-acetyltransferase  27.72 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0147  homoserine O-acetyltransferase  26.5 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1186  homoserine O-acetyltransferase  29.02 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3567  hypothetical protein  27.8 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3685  hypothetical protein  28.38 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4252  homoserine O-acetyltransferase  27.72 
 
 		 400 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.647342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4281  homoserine O-acetyltransferase  27.43 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183607  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0329  homoserine O-acetyltransferase  31.47 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115964 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0338  homoserine O-acetyltransferase  23.51 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1457  homoserine O-acetyltransferase  32.49 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1709  homoserine O-acetyltransferase  32.42 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.980413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1161  homoserine O-acetyltransferase  31.77 
 
 		 496 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.985258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1308  homoserine O-acetyltransferase  32.51 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00994406  normal  0.346812 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3376  hypothetical protein  28.04 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2058  homoserine O-acetyltransferase  31.16 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000028902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1714  hypothetical protein  29.81 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5144  hypothetical protein  27 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.565819 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2886  homoserine O-acetyltransferase  28.05 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0321  homoserine O-acetyltransferase  27.65 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3266  homoserine O-acetyltransferase  30.21 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0349  homoserine O-acetyltransferase  31.47 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4066  homoserine O-acetyltransferase  26.92 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.685956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0583  homoserine O-acetyltransferase  31.16 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0752  homoserine O-acetyltransferase  31.58 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00772131  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  31.25 
 
 		 492 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3500  homoserine O-acetyltransferase  27.84 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000120242  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  29.59 
 
 		 488 aa  76.3  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0949  homoserine O-acetyltransferase  29.47 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3483  homoserine O-acetyltransferase  26.32 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4125  homoserine O-acetyltransferase  26.32 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2822  homoserine O-acetyltransferase  31.28 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2039  homoserine O-acetyltransferase  31.2 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3134  homoserine O-acetyltransferase  27.4 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289102  normal  0.106399 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6044  homoserine O-acetyltransferase  30.85 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3190  homoserine O-acetyltransferase  29.94 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4562  homoserine O-acetyltransferase  24.21 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2428  homoserine O-acetyltransferase  30.46 
 
 		 579 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71707  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2859  homoserine O-acetyltransferase  29.57 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0385  homoserine O-acetyltransferase  32.26 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.859111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0143  homoserine O-acetyltransferase  30.11 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1759  homoserine O-acetyltransferase  33.68 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>