More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3474 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  100 
 
 		 354 aa  728    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  55.29 
 
 		 359 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  55 
 
 		 359 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  55 
 
 		 359 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  55 
 
 		 359 aa  375  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.12 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.1 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000214794 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  54.12 
 
 		 359 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.53 
 
 		 359 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.82 
 
 		 359 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.62 
 
 		 363 aa  343  2e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0358  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  48.84 
 
 		 364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  38.34 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  33.22 
 
 		 386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 390 aa  148  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03364  sensor histidine kinase, putative  27.54 
 
 		 422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3005  histidine kinase  35 
 
 		 386 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188406  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 420 aa  126  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2544  putative signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 363 aa  122  7e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 		 393 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1587  histidine kinase  34.15 
 
 		 439 aa  119  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  30.87 
 
 		 423 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  33.65 
 
 		 383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  27.45 
 
 		 437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1291  sensor histidine kinase  29.11 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000227861  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  27.76 
 
 		 376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03850  signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 418 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  0.231181 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0310  hypothetical protein  25.73 
 
 		 361 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.720618  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  27.68 
 
 		 376 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1938  histidine kinase  35.18 
 
 		 363 aa  113  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  27.68 
 
 		 376 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  29.92 
 
 		 376 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  29.92 
 
 		 376 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  25.64 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  27.33 
 
 		 376 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  27.22 
 
 		 376 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  29.3 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  27.73 
 
 		 376 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  27.14 
 
 		 376 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 369 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  30.95 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  26.92 
 
 		 376 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  32.55 
 
 		 381 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  30.9 
 
 		 405 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02860  signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0504  histidine kinase  32.38 
 
 		 407 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.991268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  34.04 
 
 		 400 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.500623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  23.4 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06610  signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 376 aa  97.4  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04460  two-component system sensor protein  25.34 
 
 		 378 aa  96.3  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.9 
 
 		 363 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000104287  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1409  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  22.9 
 
 		 363 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00593294  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 389 aa  95.5  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2769  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  27.38 
 
 		 786 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 382 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  27.72 
 
 		 527 aa  93.6  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 385 aa  92.8  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884966 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 399 aa  92.8  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  33.49 
 
 		 457 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  32.58 
 
 		 367 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11520  Histidine kinase  32.6 
 
 		 364 aa  90.5  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.10079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 425 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  26.87 
 
 		 407 aa  89.7  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3054  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  29.32 
 
 		 382 aa  89.4  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0117  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  32.24 
 
 		 382 aa  89.4  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0493339  normal  0.135679 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 612 aa  88.6  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  27.48 
 
 		 384 aa  89  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1679  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.71 
 
 		 426 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  28.07 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  26.92 
 
 		 397 aa  87.4  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 398 aa  86.7  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  30.88 
 
 		 462 aa  86.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4056  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.62 
 
 		 351 aa  86.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.022218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.31 
 
 		 386 aa  85.9  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0092  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.72 
 
 		 726 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 536 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  25.62 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  29.91 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  31.03 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  30.45 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1239  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.21 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  26.62 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.36 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  29.8 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7438  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.95 
 
 		 744 aa  83.2  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0287  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  33.5 
 
 		 370 aa  82.8  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.144944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  28.64 
 
 		 399 aa  82.8  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0957  histidine kinase  25.99 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1732  histidine kinase  23.51 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8145  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.58 
 
 		 581 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.876501  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  27.61 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3533  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  30.61 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3803  histidine kinase  31.39 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.263208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>