More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0890 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0890  YceI  100 
 
 		 220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  32.66 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  35.5 
 
 		 199 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  33.01 
 
 		 205 aa  135  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  30.3 
 
 		 202 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  32.81 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  30.41 
 
 		 216 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0834  YceI family protein  37 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.929023  hitchhiker  0.00225936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  34.25 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  33.5 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  32.95 
 
 		 205 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0009  YceI like family protein  35.14 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  34.27 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0007  YceI like family protein  34.95 
 
 		 217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1434  YceI like family protein  34.95 
 
 		 199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311091  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1154  putative lipoprotein  34.95 
 
 		 217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0009  putative lipoprotein  34.95 
 
 		 199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.686573  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0008  putative lipoprotein  34.95 
 
 		 217 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0008  YceI like family protein  34.95 
 
 		 199 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  34.46 
 
 		 213 aa  124  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1513  YceI-like family protein  36.78 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137036  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  33.01 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  34.52 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  33.15 
 
 		 212 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  34.27 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  39.66 
 
 		 242 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  31.18 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  32.69 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0976  YceI  35.52 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  30.86 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  35.03 
 
 		 196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5437  YceI family protein  30.81 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  34.94 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0604  YceI family protein  35.43 
 
 		 234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  29.13 
 
 		 213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  29.13 
 
 		 213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  34.55 
 
 		 189 aa  108  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  31.18 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  32.56 
 
 		 182 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  33.93 
 
 		 179 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  32.16 
 
 		 196 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0687  hypothetical protein  34.86 
 
 		 234 aa  105  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  29.41 
 
 		 190 aa  105  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  32.51 
 
 		 201 aa  105  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  32.57 
 
 		 191 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  28.05 
 
 		 237 aa  102  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  28.05 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  30.46 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4488  YceI family protein  33.33 
 
 		 252 aa  102  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.644863  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  31.55 
 
 		 191 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  30.06 
 
 		 193 aa  102  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  33.54 
 
 		 188 aa  101  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  31.55 
 
 		 191 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  31.55 
 
 		 191 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  33.54 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  31.02 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  31.55 
 
 		 191 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  30.72 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  30.86 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0293  hypothetical protein  31.69 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000191826  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  33.33 
 
 		 182 aa  99.8  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  35.58 
 
 		 176 aa  99.8  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  30.86 
 
 		 191 aa  99.8  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  31.68 
 
 		 191 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  34.83 
 
 		 183 aa  99.4  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1178  hypothetical protein  31.02 
 
 		 191 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000879388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  27.98 
 
 		 235 aa  99  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  32.95 
 
 		 182 aa  98.6  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  98.2  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  29.59 
 
 		 175 aa  98.2  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  34.97 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  32.63 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  32.63 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  32.63 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  28.49 
 
 		 177 aa  97.1  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  30.85 
 
 		 191 aa  97.1  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  30.86 
 
 		 191 aa  97.4  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  30.34 
 
 		 175 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  29.44 
 
 		 214 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3598  hypothetical protein  32.04 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2265  YceI  32.39 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  28.89 
 
 		 178 aa  96.3  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3043  YceI family protein  29.79 
 
 		 210 aa  95.9  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  31.06 
 
 		 192 aa  95.1  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  31.52 
 
 		 190 aa  95.1  8e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  33.13 
 
 		 190 aa  95.1  8e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  33.14 
 
 		 192 aa  95.1  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  30.85 
 
 		 192 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  31.17 
 
 		 182 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0564  hypothetical protein  28.16 
 
 		 174 aa  94.4  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.512882 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  33.79 
 
 		 176 aa  94.4  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  28.81 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0067  YceI family protein  29.88 
 
 		 171 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3370  hypothetical protein  32.09 
 
 		 191 aa  93.2  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  29.48 
 
 		 183 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1536  hypothetical protein  31.93 
 
 		 190 aa  92  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  30.06 
 
 		 183 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  30.77 
 
 		 183 aa  92  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3229  hypothetical protein  28.88 
 
 		 197 aa  92  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.474421  normal  0.780413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>