More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2010 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
218 aa  449  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 
236 aa  158  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21249  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0075  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  37.85 
 
 
212 aa  155  3e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
223 aa  105  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.209414  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
238 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.644121  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 
223 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2239  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.11 
 
 
451 aa  97.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.53 
 
 
267 aa  96.7  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 
223 aa  97.1  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  34.24 
 
 
276 aa  96.3  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4667  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.43 
 
 
234 aa  94.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.69 
 
 
233 aa  94.4  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000223483  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2590  short chain dehydrogenase  29.87 
 
 
236 aa  94.4  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.27 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.27 
 
 
225 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  32.18 
 
 
271 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.67 
 
 
256 aa  93.6  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.15 
 
 
275 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.94 
 
 
273 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3541  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 
270 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100637  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.78 
 
 
225 aa  91.7  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31851  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  32.39 
 
 
270 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.94 
 
 
273 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.84 
 
 
236 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.157663  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1794  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.23 
 
 
238 aa  90.5  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 
535 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.61705 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.84 
 
 
236 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
286 aa  89.7  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.44 
 
 
236 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.901767  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
226 aa  89  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00421455  normal  0.304991 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.15 
 
 
243 aa  89  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.809428  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
256 aa  88.6  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.67 
 
 
230 aa  87.4  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3209  short chain dehydrogenase  29.63 
 
 
268 aa  87.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.12 
 
 
238 aa  87.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2026  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.64 
 
 
227 aa  86.7  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.293852 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.34 
 
 
275 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.32 
 
 
260 aa  87  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02915  serine 3-dehydrogenase  32.07 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2321  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  31.94 
 
 
275 aa  86.3  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.195083 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 
272 aa  86.3  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0942  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 
268 aa  86.7  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.28 
 
 
257 aa  86.3  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  29.38 
 
 
272 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.32 
 
 
278 aa  85.9  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.82 
 
 
264 aa  86.3  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1192  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  27.66 
 
 
255 aa  85.9  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1432  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.01 
 
 
226 aa  85.5  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.411004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
242 aa  85.9  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.23 
 
 
241 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.82 
 
 
284 aa  85.5  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.65 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.61 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.32 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227726  hitchhiker  0.00265893 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0818  short chain dehydrogenase  26.41 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.7 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.77 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.7 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.92 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0206025  normal  0.910086 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  27.39 
 
 
241 aa  84  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.18 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.83 
 
 
238 aa  84  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 
264 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200417  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1351  pyrophosphorylase  26.89 
 
 
470 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169142  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.33 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0563281  normal  0.507807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.82 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.892025  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.14 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  32 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.74 
 
 
251 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.89 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000634692  hitchhiker  0.00117931 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.74 
 
 
259 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0150364  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.74 
 
 
249 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311099  normal  0.357873 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
244 aa  82  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.94 
 
 
271 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  27.35 
 
 
276 aa  81.6  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1596  short chain dehydrogenase  27.95 
 
 
245 aa  81.6  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.184756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
274 aa  81.6  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.11 
 
 
272 aa  81.6  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  31.28 
 
 
270 aa  81.6  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0122  oxidoreductase  29.89 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.49595  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.98 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.89 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.02 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0596  sepiapterin reductase  29.73 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0994  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  31.25 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3826  short chain dehydrogenase  26.36 
 
 
234 aa  81.3  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.273342  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38500  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  29.52 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4069  short chain dehydrogenase  30.56 
 
 
239 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0596677  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6091  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.17 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50583  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.38 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0706  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  28.12 
 
 
474 aa  80.1  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.266926  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2906  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.79 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  30.48 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.65 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.77 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.012898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>