More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0690 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0690  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 		 287 aa  558  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000502165 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  41.32 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 		 280 aa  97.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  44.63 
 
 		 256 aa  97.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  30.8 
 
 		 264 aa  96.7  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  31.5 
 
 		 259 aa  95.5  8e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  44 
 
 		 252 aa  95.5  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  35.24 
 
 		 275 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  42.98 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  46.28 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  40.3 
 
 		 307 aa  94  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  41.96 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  41.72 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  32.18 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  35.06 
 
 		 265 aa  92.8  5e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  41.59 
 
 		 246 aa  92.8  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  31.89 
 
 		 307 aa  92.4  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  43.44 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 		 281 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  46.36 
 
 		 280 aa  91.3  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  47.37 
 
 		 475 aa  91.3  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  42.28 
 
 		 313 aa  90.1  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  42.61 
 
 		 260 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  42.61 
 
 		 260 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  46.85 
 
 		 264 aa  90.1  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  40.46 
 
 		 285 aa  89.7  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  39.35 
 
 		 242 aa  90.1  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  33.16 
 
 		 271 aa  89.7  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  43.9 
 
 		 303 aa  89.7  5e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  42.59 
 
 		 264 aa  89.7  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  43.44 
 
 		 295 aa  89.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  45.3 
 
 		 276 aa  89.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  42.59 
 
 		 267 aa  89.4  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2708  phosphatidate cytidylyltransferase  44.63 
 
 		 273 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1365  phosphatidate cytidylyltransferase  44.63 
 
 		 273 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.0127657 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  36.52 
 
 		 269 aa  89.4  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  42.64 
 
 		 285 aa  89.4  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  37.8 
 
 		 260 aa  89  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  34.27 
 
 		 269 aa  89  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 282 aa  89  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  40.74 
 
 		 233 aa  88.6  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  42.31 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  41.3 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2150  phosphatidate cytidylyltransferase  38.82 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  40.98 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  35.81 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  38.12 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  33.7 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  42.4 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  41.13 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  32.49 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.4 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1811  phosphatidate cytidylyltransferase  41.59 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000250905  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  39.85 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  44.63 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1144  phosphatidate cytidylyltransferase  40.65 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.200182  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 		 260 aa  87.4  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4016  phosphatidate cytidylyltransferase  43.55 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  38.52 
 
 		 280 aa  87  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  42.34 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.03 
 
 		 368 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  40.8 
 
 		 309 aa  86.7  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  40.8 
 
 		 309 aa  86.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  40.8 
 
 		 309 aa  86.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  39.85 
 
 		 285 aa  86.7  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  39.85 
 
 		 285 aa  86.7  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 		 275 aa  86.7  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  41.79 
 
 		 254 aa  86.3  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  38.79 
 
 		 283 aa  86.7  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  42.15 
 
 		 322 aa  86.3  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  34.09 
 
 		 269 aa  86.3  6e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  33.96 
 
 		 265 aa  85.9  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  38.76 
 
 		 271 aa  85.9  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  41.82 
 
 		 282 aa  85.9  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  41.96 
 
 		 263 aa  85.5  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2713  phosphatidate cytidylyltransferase  33.61 
 
 		 258 aa  85.5  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0757456  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4517  phosphatidate cytidylyltransferase  40.52 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  42.34 
 
 		 263 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  42.34 
 
 		 263 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2935  phosphatidate cytidylyltransferase  41.41 
 
 		 312 aa  85.5  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  41.6 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  42.34 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  42.34 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  42.34 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  42.34 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  42.34 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2630  phosphatidate cytidylyltransferase  43.31 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000515592  normal  0.523786 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  42.34 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  32.83 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1579  phosphatidate cytidylyltransferase  30.66 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  39.39 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  40.16 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  37.9 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0813  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  37.9 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  32.36 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  44.14 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  38.46 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  41.04 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>