219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2947 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1434  major facilitator transporter  99.07 
 
 
432 aa  850  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1407  major facilitator transporter  98.38 
 
 
447 aa  845  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1398  major facilitator transporter  96.99 
 
 
432 aa  781  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2947  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
432 aa  860  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0563  major facilitator transporter  51.76 
 
 
425 aa  437  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  49.38 
 
 
420 aa  386  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6584  major facilitator superfamily MFS_1  47.03 
 
 
420 aa  349  5e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2076  major facilitator superfamily MFS_1  49.64 
 
 
419 aa  348  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0005  major facilitator transporter  47.13 
 
 
421 aa  344  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0753564  normal  0.228788 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2822  major facilitator superfamily MFS_1  46.73 
 
 
415 aa  332  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  27.03 
 
 
417 aa  115  2e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  28.92 
 
 
432 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  27.25 
 
 
424 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  26.65 
 
 
415 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  27.79 
 
 
436 aa  104  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  27.32 
 
 
423 aa  99  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  26.5 
 
 
423 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  27.6 
 
 
423 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  27.1 
 
 
440 aa  97.1  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  24.82 
 
 
420 aa  97.1  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  26.23 
 
 
423 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  26.23 
 
 
423 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  26.23 
 
 
423 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  26.23 
 
 
423 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  27.44 
 
 
410 aa  95.9  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  25.06 
 
 
428 aa  95.5  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  26.26 
 
 
412 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  27.7 
 
 
435 aa  95.9  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  27.41 
 
 
425 aa  93.6  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  26.63 
 
 
423 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  25.68 
 
 
389 aa  91.3  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  24.32 
 
 
438 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  28.09 
 
 
428 aa  90.9  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  26.98 
 
 
415 aa  90.5  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  26.98 
 
 
415 aa  90.5  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  28.36 
 
 
413 aa  90.1  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  24.07 
 
 
438 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  24.07 
 
 
438 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  24.07 
 
 
438 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  24.07 
 
 
438 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  26.33 
 
 
403 aa  89.4  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  27.22 
 
 
421 aa  89  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  24.07 
 
 
438 aa  89  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  28.03 
 
 
412 aa  89  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  25.68 
 
 
435 aa  89  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  26.6 
 
 
424 aa  88.2  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1218  Fucose permease-like protein  42.34 
 
 
158 aa  87.4  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  26.12 
 
 
431 aa  87.4  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  25.2 
 
 
407 aa  86.7  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  5.23123e-10  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0872  major facilitator transporter  27.13 
 
 
426 aa  86.7  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  29.46 
 
 
412 aa  86.3  1e-15  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  23.15 
 
 
438 aa  85.1  2e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  23.15 
 
 
438 aa  85.1  2e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  23.15 
 
 
438 aa  85.1  2e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  23.15 
 
 
438 aa  85.5  2e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  23.15 
 
 
438 aa  85.1  2e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  24.68 
 
 
417 aa  84.3  3e-15  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  26.54 
 
 
415 aa  83.6  6e-15  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1052  L-fucose permease  21.99 
 
 
444 aa  83.2  9e-15  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.682471  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  27.32 
 
 
427 aa  82.4  1e-14  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25.37 
 
 
438 aa  81.6  2e-14  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  24.59 
 
 
426 aa  82  2e-14  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  26.24 
 
 
433 aa  81.6  2e-14  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  28.69 
 
 
417 aa  81.6  2e-14  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  25.13 
 
 
458 aa  82  2e-14  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  25.2 
 
 
407 aa  81.3  3e-14  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  27.38 
 
 
413 aa  80.9  5e-14  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  23.3 
 
 
406 aa  80.1  6e-14  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  25.57 
 
 
428 aa  80.1  7e-14  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  22.77 
 
 
406 aa  79.7  9e-14  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  26.47 
 
 
435 aa  79.7  9e-14  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  27.89 
 
 
429 aa  79  2e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  25.79 
 
 
421 aa  79  2e-13  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 
406 aa  78.6  2e-13  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  23.3 
 
 
406 aa  78.2  3e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.04378e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  26.85 
 
 
428 aa  78.2  3e-13  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  24.17 
 
 
425 aa  77  5e-13  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  5.6973e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  24.81 
 
 
431 aa  77  5e-13  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  22.7 
 
 
406 aa  77  6e-13  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  26.13 
 
 
431 aa  77  6e-13  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01060  conserved hypothetical protein  25.75 
 
 
468 aa  76.3  1e-12  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1420  major facilitator transporter  25.86 
 
 
467 aa  75.9  1e-12  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  26.37 
 
 
431 aa  75.5  2e-12  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  8.54879e-05  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  27.82 
 
 
405 aa  75.1  2e-12  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  21.99 
 
 
405 aa  74.7  3e-12  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  26.37 
 
 
431 aa  74.7  3e-12  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2170  sugar transporter  24.07 
 
 
429 aa  74.3  4e-12  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  23.56 
 
 
406 aa  73.9  5e-12  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  7.29069e-08 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0849  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 
430 aa  73.9  5e-12  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  23.24 
 
 
417 aa  73.9  5e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  24.4 
 
 
426 aa  73.6  6e-12  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  23.56 
 
 
406 aa  73.2  9e-12  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  3.12687e-05 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  25.82 
 
 
413 aa  72.8  1e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  23.56 
 
 
406 aa  72.8  1e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  8.55622e-11 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  25.2 
 
 
426 aa  72.4  1e-11  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1315  glucose/galactose transporter  26.29 
 
 
435 aa  72  2e-11  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0258067  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  24.73 
 
 
421 aa  72.4  2e-11  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3503  glucose/galactose transporter  26.37 
 
 
435 aa  72  2e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  25.53 
 
 
408 aa  71.2  3e-11  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1215  glucose/galactose transporter  26.8 
 
 
434 aa  71.6  3e-11  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  9.75208e-06  normal  0.526597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>