More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1211 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 527 aa  1080    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  68.73 
 
 		 519 aa  730    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.82 
 
 		 526 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.59 
 
 		 530 aa  545  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.99 
 
 		 526 aa  537  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.63 
 
 		 525 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.44 
 
 		 525 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.72 
 
 		 525 aa  525  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.95 
 
 		 525 aa  522  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.47 
 
 		 526 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.62 
 
 		 525 aa  503  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  42.45 
 
 		 523 aa  415  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  45.29 
 
 		 509 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  44.32 
 
 		 520 aa  414  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  44.53 
 
 		 511 aa  411  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  41.59 
 
 		 518 aa  400  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  44.49 
 
 		 521 aa  387  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5778  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.63 
 
 		 565 aa  340  4e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0737  AMP-dependent synthetase and ligase  39.19 
 
 		 522 aa  334  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188702  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  38.65 
 
 		 520 aa  333  6e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5271  AMP-dependent synthetase and ligase  39.89 
 
 		 541 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0661  AMP-binding enzyme family protein  37.35 
 
 		 520 aa  327  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  37.86 
 
 		 516 aa  324  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0970  AMP-dependent synthetase and ligase  38.01 
 
 		 520 aa  324  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  38.26 
 
 		 514 aa  324  3e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 		 530 aa  323  4e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.866447  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  39.08 
 
 		 519 aa  323  7e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  37.62 
 
 		 515 aa  322  8e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  38.89 
 
 		 520 aa  322  8e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  38 
 
 		 518 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  38.59 
 
 		 503 aa  322  9.000000000000001e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0743  AMP-dependent synthetase and ligase  39.38 
 
 		 522 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.83543  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 		 515 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  39.38 
 
 		 522 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147131  normal  0.360345 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 		 517 aa  312  9e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  35.82 
 
 		 518 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 		 518 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4353  AMP-dependent synthetase and ligase  36.9 
 
 		 517 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  36.78 
 
 		 524 aa  310  5e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  34.89 
 
 		 515 aa  309  8e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  36.52 
 
 		 517 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  36.52 
 
 		 517 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  34.89 
 
 		 565 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  36.77 
 
 		 499 aa  307  3e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  36.95 
 
 		 518 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  37.9 
 
 		 518 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  37.38 
 
 		 516 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  32.76 
 
 		 526 aa  301  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  37.38 
 
 		 518 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  36.01 
 
 		 508 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  37.6 
 
 		 520 aa  298  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  35.69 
 
 		 531 aa  297  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2745  AMP-dependent synthetase and ligase  35.55 
 
 		 519 aa  296  7e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  36.22 
 
 		 508 aa  296  7e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  36.16 
 
 		 517 aa  296  9e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  36.82 
 
 		 532 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  35.88 
 
 		 508 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1498  AMP-dependent synthetase and ligase  36.55 
 
 		 531 aa  293  6e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6394  AMP-dependent synthetase and ligase  35.24 
 
 		 517 aa  293  7e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  35.09 
 
 		 515 aa  292  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  34.27 
 
 		 509 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  36.55 
 
 		 502 aa  290  3e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  36.61 
 
 		 518 aa  290  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  36.07 
 
 		 504 aa  290  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  35.81 
 
 		 534 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  35.34 
 
 		 530 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  38.43 
 
 		 500 aa  287  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  36.01 
 
 		 527 aa  286  5e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  35.91 
 
 		 525 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4949  acyl-CoA synthetase  36.01 
 
 		 521 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2207  AMP-dependent synthetase and ligase  34.53 
 
 		 512 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.77359  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2438  AMP-dependent synthetase and ligase  35.01 
 
 		 512 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  36.12 
 
 		 516 aa  283  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  38.6 
 
 		 1043 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  35.09 
 
 		 512 aa  283  7.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  34.95 
 
 		 496 aa  282  9e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  38.64 
 
 		 540 aa  282  9e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  34.95 
 
 		 496 aa  282  9e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  36.51 
 
 		 530 aa  282  9e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4481  AMP-dependent synthetase and ligase  36.16 
 
 		 506 aa  282  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  34.95 
 
 		 496 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  34.95 
 
 		 496 aa  280  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  36.87 
 
 		 503 aa  280  5e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  35.02 
 
 		 514 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  34.89 
 
 		 520 aa  280  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  34.92 
 
 		 522 aa  280  6e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5134  acyl-CoA synthetase / AMP-dependent synthetase and ligase  35.69 
 
 		 517 aa  280  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.93936 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.79 
 
 		 519 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  37.55 
 
 		 530 aa  278  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1095  AMP-dependent synthetase and ligase  35.93 
 
 		 518 aa  278  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  35.81 
 
 		 515 aa  278  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  36.92 
 
 		 516 aa  278  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  35.4 
 
 		 501 aa  277  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.47 
 
 		 514 aa  277  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.98 
 
 		 529 aa  277  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  36.63 
 
 		 512 aa  276  5e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.24 
 
 		 513 aa  276  7e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2351  acyl-CoA synthetase  35.73 
 
 		 517 aa  276  8e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197387  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  33.72 
 
 		 519 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.42 
 
 		 512 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>