More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0069 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0069  NLP/P60 family lipoprotein  100 
 
 
148 aa  305  2e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  55.81 
 
 
150 aa  162  1e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4872  NLP/P60 protein  52.7 
 
 
183 aa  160  5e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0063  NLP/P60 protein  49.66 
 
 
159 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.56196e-07 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0061  NLP/P60 protein  49.66 
 
 
159 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  4.1841e-08 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0059  NLP/P60 protein  49.66 
 
 
159 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.560848  hitchhiker  0.000388338 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  48.98 
 
 
164 aa  154  5e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0062  NLP/P60 protein  48.98 
 
 
154 aa  154  5e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  48.32 
 
 
154 aa  154  5e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0052  NLP/P60 protein  49.66 
 
 
154 aa  152  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00304715  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4296  NLP/P60 protein  50.72 
 
 
164 aa  151  3e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0058  NLP/P60 protein  50.72 
 
 
164 aa  151  3e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1142  lipoprotein NlpC  48.67 
 
 
166 aa  145  2e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0142689  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  52.54 
 
 
156 aa  142  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  46.98 
 
 
162 aa  138  2e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1387  putative lipoprotein  46.67 
 
 
162 aa  138  2e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0376898  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  51.33 
 
 
196 aa  137  4e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  8.56339e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  44.97 
 
 
157 aa  133  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3689  NLP/P60 family lipoprotein  43.17 
 
 
179 aa  133  9e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  44.3 
 
 
162 aa  133  1e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  43.62 
 
 
154 aa  128  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  54.39 
 
 
205 aa  127  4e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  45.3 
 
 
190 aa  126  9e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.18421e-09 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  45.3 
 
 
190 aa  126  9e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  45.3 
 
 
190 aa  126  9e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  46.15 
 
 
188 aa  126  1e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  43.62 
 
 
154 aa  126  1e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  46.15 
 
 
188 aa  126  1e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  46.15 
 
 
188 aa  126  1e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  46.15 
 
 
188 aa  126  1e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  46.15 
 
 
188 aa  126  1e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  46.15 
 
 
188 aa  126  1e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  43.62 
 
 
154 aa  126  1e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  46.15 
 
 
188 aa  126  1e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  43.62 
 
 
154 aa  126  1e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  46.15 
 
 
188 aa  126  1e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  46.15 
 
 
188 aa  126  1e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  48.72 
 
 
172 aa  125  2e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  45.3 
 
 
147 aa  125  2e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.10623e-05 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  45.3 
 
 
147 aa  125  2e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  2.43067e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  48.72 
 
 
194 aa  125  2e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  48.72 
 
 
194 aa  125  2e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  48.46 
 
 
189 aa  125  2e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3902  NLP/P60 protein  49.17 
 
 
171 aa  124  4e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  46.15 
 
 
191 aa  124  4e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1592  NLP/P60  40.13 
 
 
171 aa  124  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.098676  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1912  lipoprotein, NlpC/P60 family  42.95 
 
 
154 aa  124  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  43.92 
 
 
154 aa  123  8e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  43.92 
 
 
154 aa  123  8e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  44.14 
 
 
154 aa  122  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  43.62 
 
 
154 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  43.62 
 
 
154 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  43.62 
 
 
154 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  45.39 
 
 
154 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  45.39 
 
 
154 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  43.62 
 
 
154 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  45.39 
 
 
154 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  43.62 
 
 
154 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.303201 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  45.39 
 
 
154 aa  122  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  44.44 
 
 
189 aa  121  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  41.89 
 
 
154 aa  121  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  46.15 
 
 
193 aa  121  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  46.15 
 
 
194 aa  121  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  44.44 
 
 
143 aa  120  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  42.57 
 
 
155 aa  120  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  42.28 
 
 
154 aa  120  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  45.3 
 
 
191 aa  119  2e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  41.45 
 
 
167 aa  119  2e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  44.44 
 
 
191 aa  117  4e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1014  NLP/P60 protein  40.71 
 
 
211 aa  110  7e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0170  NLP/P60 protein  42.11 
 
 
184 aa  105  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1825  lipoprotein NlpC  42.5 
 
 
152 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1884  NLP/P60 protein  38.69 
 
 
174 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.715704  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0427  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
240 aa  101  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1644  lipoprotein NlpC  40.83 
 
 
153 aa  99.8  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0428  NLP/P60 protein  37.24 
 
 
173 aa  99  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0595  NLP/P60 protein  38.33 
 
 
201 aa  97.8  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  39.86 
 
 
265 aa  95.5  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.04581e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  39.29 
 
 
266 aa  94.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  38.03 
 
 
208 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  45.37 
 
 
223 aa  94  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  45.37 
 
 
223 aa  94  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  40 
 
 
333 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  45.37 
 
 
223 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  5.24971e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  41.23 
 
 
246 aa  92.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  45.37 
 
 
223 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  45.37 
 
 
223 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  37.4 
 
 
246 aa  91.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0941  NLP/P60 family protein  33.56 
 
 
159 aa  91.7  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33367  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  44.44 
 
 
224 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  44.44 
 
 
218 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  44.44 
 
 
234 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  44.44 
 
 
234 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  2.2944e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  44.44 
 
 
218 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  44.44 
 
 
218 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  5.76333e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  44.44 
 
 
234 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  6.24175e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  44.44 
 
 
218 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  40 
 
 
177 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  33.33 
 
 
205 aa  90.5  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  35.19 
 
 
181 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>