More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2714 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2714  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 355 aa  711    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.64557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0288  peptide chain release factor 1  73.3 
 
 		 354 aa  503  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2530  peptide chain release factor 1  70.67 
 
 		 360 aa  500  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  66.48 
 
 		 355 aa  470  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0941  peptide chain release factor 1  63.79 
 
 		 350 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.301393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0980  peptide chain release factor 1  65.64 
 
 		 334 aa  438  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1733  peptide chain release factor 1  64.08 
 
 		 351 aa  437  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0137  peptide chain release factor 1  61 
 
 		 361 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  0.125169 
 
 
-
 
NC_004310  BR1869  peptide chain release factor 1  59.33 
 
 		 359 aa  433  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1800  peptide chain release factor 1  59.33 
 
 		 377 aa  432  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0750  peptide chain release factor 1  61.92 
 
 		 354 aa  434  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322203  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1564  peptide chain release factor 1  62.75 
 
 		 360 aa  434  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370048 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1806  peptide chain release factor 1  61.47 
 
 		 354 aa  429  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0496443  normal  0.210435 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1036  peptide chain release factor 1  58.1 
 
 		 357 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.125967  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  60.58 
 
 		 359 aa  424  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4748  peptide chain release factor 1  62.12 
 
 		 359 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.681376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0075  peptide chain release factor 1  58.77 
 
 		 361 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439429  normal  0.176298 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  57.66 
 
 		 359 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0610  peptide chain release factor 1  58.5 
 
 		 361 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2502  peptide chain release factor 1  59.13 
 
 		 360 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.135893 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0097  peptide chain release factor 1  58.22 
 
 		 361 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0470  peptide chain release factor 1  59.05 
 
 		 361 aa  420  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.807242  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0359  peptide chain release factor 1  55.99 
 
 		 359 aa  418  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  57.94 
 
 		 359 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0112  peptide chain release factor 1  61.84 
 
 		 359 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0894  peptide chain release factor 1  60.45 
 
 		 361 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0442  peptide chain release factor 1  60.43 
 
 		 359 aa  417  9.999999999999999e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.34864  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0377  peptide chain release factor 1  59.09 
 
 		 358 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117375  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0597  peptide chain release factor 1  60.12 
 
 		 359 aa  417  9.999999999999999e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.349785  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0918  peptide chain release factor 1  60.83 
 
 		 361 aa  412  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  64.2 
 
 		 360 aa  412  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0955  peptide chain release factor 1  60.83 
 
 		 361 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0150049  normal  0.0330786 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  56.98 
 
 		 359 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  57.22 
 
 		 361 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0889  peptide chain release factor 1  59.6 
 
 		 358 aa  408  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.491137  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7604  peptide chain release factor 1  59.6 
 
 		 361 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2623  peptide chain release factor 1  57.83 
 
 		 360 aa  408  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2907  peptide chain release factor 1  61.18 
 
 		 351 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3126  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 		 361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000819953  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1552  peptide chain release factor 1  61.18 
 
 		 351 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00635005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0406  peptide chain release factor 1  56.41 
 
 		 367 aa  404  1.0000000000000001e-112  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.795353  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0894  peptide chain release factor 1  59.59 
 
 		 351 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188141  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_002978  WD0247  peptide chain release factor 1  58.73 
 
 		 359 aa  404  1e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.736319  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  59.38 
 
 		 362 aa  403  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  59.38 
 
 		 362 aa  403  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1113  peptide chain release factor 1  60.88 
 
 		 351 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.0276117 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  57.79 
 
 		 360 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  58.36 
 
 		 360 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  57.79 
 
 		 360 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3599  peptide chain release factor 1  58.97 
 
 		 362 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  60.75 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  56.9 
 
 		 361 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1990  peptide chain release factor 1  59.89 
 
 		 361 aa  398  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00333479  decreased coverage  0.0018191 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  61.54 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0646  peptide chain release factor 1  59.83 
 
 		 357 aa  398  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.308235  normal  0.249903 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  60.12 
 
 		 360 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  56.41 
 
 		 360 aa  394  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  55.93 
 
 		 361 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4748  peptide chain release factor 1  58.07 
 
 		 360 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  59.82 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  58.29 
 
 		 361 aa  396  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  59.82 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  56.13 
 
 		 360 aa  396  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  58.99 
 
 		 363 aa  397  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61700  peptide chain release factor 1  56.94 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  58.11 
 
 		 357 aa  396  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  56.13 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  57.51 
 
 		 360 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  57.22 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  55.56 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  59.57 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  58.86 
 
 		 357 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2912  peptide chain release factor 1  56.34 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107492  normal  0.707414 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01186  peptide chain release factor 1  57.39 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.304726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2436  peptide chain release factor 1  57.39 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000671796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1316  peptide chain release factor 1  57.39 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000610156  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  61.06 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1359  peptide chain release factor 1  57.39 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000344623  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  56.5 
 
 		 363 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01196  hypothetical protein  57.39 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.26987  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  56.7 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  56.78 
 
 		 363 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  0.0000410243 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  56.5 
 
 		 363 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  59.25 
 
 		 361 aa  388  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  59.25 
 
 		 361 aa  388  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  54.9 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1375  peptide chain release factor 1  57.79 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017097  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2072  peptide chain release factor 1  57.26 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  55.31 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  54.72 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2415  peptide chain release factor 1  57.39 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00102463  hitchhiker  0.000030401 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1913  peptide chain release factor 1  57.55 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1931  peptide chain release factor 1  57.39 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000608431  normal  0.0690317 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  54.72 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  56.78 
 
 		 363 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1692  peptide chain release factor 1  57.39 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0012914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  54.72 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  55.96 
 
 		 363 aa  390  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2212  peptide chain release factor 1  54.75 
 
 		 361 aa  386  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.189214  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0512  peptide chain release factor 1  58.22 
 
 		 361 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.1342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>